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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
02/12/2011 |
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Data da última atualização: |
02/12/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DIAS, A. C. F.; DINI-ANDREOTE, F.; TAKETANI, R. G.; TSAI, S. M.; AZEVEDO, J. L.; MELO, I. S. de; ANDREOTE, F. D. |
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Afiliação: |
ARMANDO CAVALCANTE FRANCO DIAS, CENA-USP; FRANCISCO DINI-ANDREOTE, ESALQ-USP; RODIRGO GOUVÊA TAKETANI, CENA-USP; SIU MUI TSAI, CENA-USP; JOÃO LÚCIO AZEVEDO, CENA-USP; ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA; FERNANDO DINI ANDREOTE, ESALQ-USP. |
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Título: |
Archaeal communities in the sediments of three contrasting mangroves. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Soils and Sediments, Berlin, v. 11, n. 8, p. 1466-1476, 2011. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: This study evaluates the presence and diversity of 16S rRNA (rrs) and amoA genes from archaea in three mangrove sediments under different stages of preservation(one pristine mangrove, one affected by anthropogenic activity, and another contaminated by an oil spill) in the state of São Paulo (Brazil). Materials and methods A combination of DGGE, coupled with ordination analysis, and clone libraries of both targeted genes (rrs and amoA) was used to infer the diversity and phylogeny of archaeal communities in the mangrove analyzed samples. Results and discussion The DGGE combined with multivariate analysis revealed, based on the ribosomal gene, differences in archaeal communities according to environmental parameters such as mangrove location, anthropogenic activity, and oil contamination. The profiles based on the amoA gene were more similar than those obtained for the gene rrs, with the only difference statistically observed for the community found in the mangrove under anthropogenic pressure. Furthermore, phylogenetic analysis revealed most archaeal groups affiliated to sequences belonging to the Thaumarchaeota (53.1%, 24 OTUs) and Euryarchaeota (29.6%, 14 OTUs) phyla, in addition to 14 sequences affiliated to an unclassified Archaea (16.1%, 8 OTUs). Concerning the analysis of the amoA gene, mangroves harbored sequences affiliated with those previously described in water column and soil/sediment samples, besides two possible clusters specifically found in mangroves. Conclusions The findings are that the mangroves act as a reservoir for archaeal diversity, are possibly involved in nitrogen transformation in this ecosystem, and are affected by distinct pressures caused by anthropogenic activities. MenosAbstract: This study evaluates the presence and diversity of 16S rRNA (rrs) and amoA genes from archaea in three mangrove sediments under different stages of preservation(one pristine mangrove, one affected by anthropogenic activity, and another contaminated by an oil spill) in the state of São Paulo (Brazil). Materials and methods A combination of DGGE, coupled with ordination analysis, and clone libraries of both targeted genes (rrs and amoA) was used to infer the diversity and phylogeny of archaeal communities in the mangrove analyzed samples. Results and discussion The DGGE combined with multivariate analysis revealed, based on the ribosomal gene, differences in archaeal communities according to environmental parameters such as mangrove location, anthropogenic activity, and oil contamination. The profiles based on the amoA gene were more similar than those obtained for the gene rrs, with the only difference statistically observed for the community found in the mangrove under anthropogenic pressure. Furthermore, phylogenetic analysis revealed most archaeal groups affiliated to sequences belonging to the Thaumarchaeota (53.1%, 24 OTUs) and Euryarchaeota (29.6%, 14 OTUs) phyla, in addition to 14 sequences affiliated to an unclassified Archaea (16.1%, 8 OTUs). Concerning the analysis of the amoA gene, mangroves harbored sequences affiliated with those previously described in water column and soil/sediment samples, besides two possible clusters specifically found in mangroves... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
16S rRNA; Ammonium processing; amoA; Thaumarchaeota. |
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Thesagro: |
Mangue; Microrganismo; Sedimento. |
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Thesaurus Nal: |
Archaea; Euryarchaeota; Mangrove swamps. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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| Registros recuperados : 122 | |
| 22. |  | GALON, L.; LIMA, R. F.; SOARES, E. R.; SIMONETTO, R.; CONCENCO, G.; SILVA, A. F. Períodos de interferência de Brachiaria brizantha em soja transgênica semeada no Cone Sul do Estado de Rondônia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 23. | | GALON, L.; LIMA, R. F.; SOARES, E. R.; SIMONETTO, R.; CONCENCO, G.; SILVA, A. F. Períodos de interferência de Brachiaria brizantha em soja transgênica semeada no Cone Sul do Estado de Rondônia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 24. | | CONCENCO, G.; ANDRES, A.; SCHREIBER, F.; GALON, L.; CORADINI, M. C.; THIEL, C. H. Weed flora in rice areas under distinct cropping systems, herbicide and irrigation managements. International Journal of Advanced Engineering Research and Science, v. 5, n. 8, p. 25-32, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 29. | | CONCENCO, G.; STAUT, L. A.; SILVA, C. J. da; CORREIA, I. V. T.; VIEIRA, L. C. Y; GALON, L. Análise de crescimento de crambe na presença ou ausência de competição interespecífica. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 30. | | ALVES, C.; GALON, L.; HOLZ, C. M.; KAIZER, R. R.; WINTER, F. L.; CONCENCO, G.; NONEMACHER, F.; PERIN, G. F. Características fisiológicas de plantas hibernais com potencial fitorremediador sob influência dos herbicidas fomesafen e sulfentrazone. Revista de Ciências Agroveterinárias, v. 18, n. 1, p. 1-12, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 31. | | SANTOS, L. O.; PINTO, J. J. O.; PIVETA, L. B.; NOLDIN, J. A.; GALON, L.; CONCENCO, G. Carroyover effect of imidazolinone herbicides for crops following rice. American Journal of Plant Sciences, v. 5, n. 8, p. 1049-1058, Mar. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 34. | | GALON, L.; CONCENCO, G.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZU, I.; SILVA, A. F. da; GIACOBBO, C. L.; ANDRES, A. Influence of biotic and abiotic stress factors on physiological traits of sugarcane varieties. In: DUBINSKY, Z. (Ed.). Photosynthesis. Rijeka: In Tech, 2013. cap. 7, p. 185-208.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 35. | | FERREIRA, E. A.; GALON, L.; ASPIAZU, I.; SILVA, A. A.; CONCENÇO, G.; SILVA, A. F.; OLIVEIRA, J. A.; VARGAS, L. Glyphosate translocation in hairy fleabane (Conyza bonariensis) biotypes. Planta Daninha, Viçosa, MG, v. 26, n. 3, p. 637-643, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
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| 36. | | GALON, L.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZÚ, I.; CONCENCO, G.; SILVA, A. F.; SILVA, A. A.; VARGAS, L. Glyphosate translocation in herbicide tolerant plants. Planta Daninha, Viçosa, MG, v. 31, n. 1, p. 193-201, jan./mar. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Trigo. |
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| 37. | | FRANDOLOSO, F. S.; GALON, L.; CONCENÇO, G.; ROSSETTO, E. R. O.; BIANCHESSI, F.; SANTIN, C. O.; FORTE, C. T. Interference and level of economic damage of Alexandergrass on corn. Planta Daninha, v. 38, e020219966, 2020. 12 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 38. | | LIMA, R. F.; LIMA, A. M.; GALON, L.; SOARES, E. R.; SIMONETTO, R.; CONCENCO, G.; SILVA, A. F.; GUIMARÃES, S. Interferência de Brachiaria brizantha nos componentes de rendimento da soja transgênica semeada em Rondônia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 39. | | LIMA, R. F.; LIMA, A. M.; GALON, L.; SOARES, E. R.; SIMONETTO, R.; CONCENCO, G.; SILVA, A. F.; GUIMARÃES, S. Interferência de Brachiaria brizantha nos componentes de rendimento da soja transgênica semeada em Rondônia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 40. | | SILVA, C.; SILVA, A. F. da; VALE, W. G. do; GALON, L.; PETTER, F. A.; MAY, A.; KARAM, D. Interferência de plantas daninhas na cultura do sorgo sacarino. Bragantia, Campinas, v. 73, n. 4, p. 1-8, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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