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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
13/11/2017 |
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Data da última atualização: |
08/05/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, P. R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I. |
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Afiliação: |
PAULA RENATA ALVES DA SILVA, UFRRJ; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; LEONARDO MAGALHÃES CRUZ, UFPR; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFPR; JOSE IVO BALDANI, CNPAB. |
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Título: |
Draft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 2010-2011, Apr./Jun. 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.07.005 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Paraburkholderia tropica (syn Burkholderia tropica) are nitrogen-fixing bacteria commonly found in sugarcane. The Paraburkholderia tropica strain Ppe8 is part of the sugarcane inoculant consortium that has a beneficial effect on yield. Here, we report a draft genome sequence of this strain elucidating the mechanisms involved in its interaction mainly with Poaceae. A genome size of approximately 8.75 Mb containing 7844 protein coding genes distributed in 526 subsystems was de novo assembled with ABySS and annotated by RAST. Genes related to the nitrogen fixation process, the secretion systems (I, II, III, IV, and VI), and related to a variety of metabolic traits, such as metabolism of carbohydrates, amino acids, vitamins, and proteins, were detected, suggesting a broad metabolic capacity and possible adaptation to plant association. |
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Palavras-Chave: |
Diazotrophic; Next generation sequencing; Nitrogen fixing; Secretion system. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/176513/1/JEAN-IVO-MARCIA-Draft-genome.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 34 | |
| 4. |  | CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; WEBER, O. B.; BALDANI, J. I.; DÖBEREINER, Johanna; PEDROSA, F. de O. 16S ribosomal DNA characterization of nitrogen-fixing bacteria isolated from banana (Musa spp.) and pineapple (Ananas comosus (L.) Merril). Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 67, n. 5, p. 2375-2379, may 2001.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 7. | | CRUZ, L. M. V. da; GOI, S. R.; JAMES, E. K.; PITARD, R. M.; OLIVEIRA, L. D. Nodulação de Mimosa pudica por beta-rizóbio isolados de diferentes ecossistemas no Brasil. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4 p. 1 CD-ROM. Parceria: UFRRJ.
Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 8. | | CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M.; WEBER, O. B.; BALDANI, J. I.; DÖBEREINER, Johanna; PEDROSA, F. O. Phylogeny of new diazotrophs isolated from banana (Musa spp.) and pineapples (Ananas spp.) by 16S rRNA gene homology. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 27., 1998, Caxambu. Resumos... Caxambu: Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular, 1998. Resumo F-11. p. 46.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 11. | | ETTO, R. M.; GALVÃO, C. W.; GALVÃO, F.; CURCIO, G. R.; RACHWAL, M. F. G.; PEDROSA, F. O.; CRUZ, L. M.; STEFFENS, M. B. R. Biodiversity of prokaryotes from high-elevation grassland organosols of the Parana State, Brazil. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 38., 2009, águas de Lindóia. Abstracts. Águas de Lindóia: SBBq, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 12. | | LAMMEL, D. R.; BARTH, G.; OVASKAINEN, O.; CRUZ, L. M.; ZANATTA, J. A.; RYO, M.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O. Direct and indirect effects of a pH gradient bring insights into the mechanisms driving prokaryotic community structures. Microbiome, v. 6, article 106, June 2018. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 13. | | SANTOS, C. M dos; SOUZA, D. G. de; BALSANELLI, E; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I.; SCHWAB, S. A culture independent approach to enrich endophytic bacterial cells from sugarcane stems for community characterization. Microbiol Ecology, v. 74, n. 2, p. 453-465, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 14. | | SILVA, P. R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I. Draft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 2010-2011, Apr./Jun. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 15. | | BALDANI, J. I.; CRUZ, L. M.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de; SCHWAB, S.; TEIXEIRA, K. R. dos S.; SOUZA, E. M.; PEDROSA, F. O.; FARINELLI. Draft genome sequente of six endophytic nittrogen-fixing bacteria with potential biofertilizer application in non-leguminous plants. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. Slll. 05| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 17. | | JESUS, E. da C.; ETTO, R. M.; CRUZ, L. M.; GALVÃO, C. W.; SOUZA, E. M.; PEDROSA, F. O.; STEFFENS, M. B. R. Prokaryotic communities of acidic peatlands from the southern Brazilian atlantic forest. Brazilian journal of Microbiology, v. 43, n. 2, p. 661-674, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 18. | | ETTO, R. M.; CRUZ, L. M.; JESUS, E. da C.; GALVÃO, C. W.; GALVÃO, F.; SOUZA, E. M.; PEDROSA, F. de O.; STEFFENS, M. B. R. Seasonal changes in dominant bacterial taxa from acidic peatlands of the Atlantica Rain Forest. Research in Microbiology, 22 may, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 19. | | ETTO, R. M.; JESUS, E. da C.; CRUZ, L. M.; SCHNEIDER, B. S. F.; TOMACHEWSKI, D.; URREA-VALENCIA , S.; GONÇALVES, D. R. P.; GALVÃO, F.; AYUB, R. A.; CURCIO, G. R.; STEFFENS, M. B. R.; GALVÃO, C. W. Influence of environmental factors on the tropical peatlands diazotrophic communities from the Southern Brazilian Atlantic Rain Forest. Letters in Applied Microbiology, v. 74, n. 4, p. 543-554, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Florestas. |
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| 20. | | SCHWAB, S.; CRIVELARO, A. L. R.; WEISS, V. A.; SFEIR, M. Z. T.; FAORO, H.; CRUZ, L. M.; PEDROZA, F. de O.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I. Global transcriptional shift analysis of nitrogenase switch-off by glutamate in azospirillum amazonense strain CBAMC, isolated from sugarcane. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION WITH NON-LEGUMES, 13., 2012, Neuherberg, GE. Abstracts... Neuherberg: German Research Center for Environmental Health, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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