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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
31/08/2021 |
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Data da última atualização: |
31/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TREVISOLI, P. A.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; PETRINI, J.; MARGARIDO, G. R. A.; LEDUR, M. C.; MOURÃO, G. B.; GARRICK, D.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
PRISCILA ANCHIETA TREVISOLI, ESALQ; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; ALINE SILVA MELLO CESAR, ESALQ; JULIANA PETRINI, ESALQ; GABRIEL RODRIGUES ALVES MARGARIDO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; GERSON BARRETO MOURÃO, ESALQ; DORIAN GARRICK, Massey University; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
A missense mutation in the MYBPH gene is associated with abdominal fat traits in meat-type chickens. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 12, n. 698163, 2021. |
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DOI: |
10.3389/fgene.2021.698163 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Chicken is an important source of protein for human nutrition and a model system for growth and developmental biology. Although the genetic architecture of quantitative traits in meat-type chickens has been the subject of ongoing investigation, the identification of mutations associated with carcass traits of economic interest remains challenging. Therefore, our aim was to identify predicted deleterious mutation, which potentially affects protein function, and test if they were associated with carcass traits in chickens. For that, we performed a genome-wide association analysis (GWAS) for breast, thigh and drumstick traits in meat-type chickens and detected 19 unique quantitative trait loci (QTL). We then used: (1) the identified windows; (2) QTL for abdominal fat detected in a previous study with the same population and (3) previously obtained whole genome sequence data, to identify 18 predicted deleterious single nucleotide polymorphisms (SNPs) in those QTL for further association with breast, thigh, drumstick and abdominal fat traits. Using the additive model, a predicted deleterious SNP c.482C > T (SIFT score of 0.4) was associated (p-value < 0.05) with abdominal fat weight and percentage. This SNP is in the second exon of the MYBPH gene, and its allele frequency deviates from Hardy?Weinberg equilibrium. In conclusion, our study provides evidence that the c.482C > T SNP in the MYBPH gene is a putative causal mutation for fat deposition in meat-type chickens. |
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Palavras-Chave: |
Gordura abdominal; Meat-type; MYBPH; Predicted deleterious SNPs. |
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Thesagro: |
Carne; Frango de Corte; Genética Animal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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001 2133957
005 2021-08-31
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520 $aAbstract: Chicken is an important source of protein for human nutrition and a model system for growth and developmental biology. Although the genetic architecture of quantitative traits in meat-type chickens has been the subject of ongoing investigation, the identification of mutations associated with carcass traits of economic interest remains challenging. Therefore, our aim was to identify predicted deleterious mutation, which potentially affects protein function, and test if they were associated with carcass traits in chickens. For that, we performed a genome-wide association analysis (GWAS) for breast, thigh and drumstick traits in meat-type chickens and detected 19 unique quantitative trait loci (QTL). We then used: (1) the identified windows; (2) QTL for abdominal fat detected in a previous study with the same population and (3) previously obtained whole genome sequence data, to identify 18 predicted deleterious single nucleotide polymorphisms (SNPs) in those QTL for further association with breast, thigh, drumstick and abdominal fat traits. Using the additive model, a predicted deleterious SNP c.482C > T (SIFT score of 0.4) was associated (p-value < 0.05) with abdominal fat weight and percentage. This SNP is in the second exon of the MYBPH gene, and its allele frequency deviates from Hardy?Weinberg equilibrium. In conclusion, our study provides evidence that the c.482C > T SNP in the MYBPH gene is a putative causal mutation for fat deposition in meat-type chickens.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 410 | |
| 23. |  | NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; CAETANO, A. R.; COUTINHO, L. L. Associação de poliformismos de base única (SNP) no íntron 8 gene do receptor da leptina em galinhas com rendimento de órgãos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. O avanço científico e tecnológico na produção animal: anais. Jaboticabal: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UNESP, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, 2007. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 24. | | NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; CAETANO, A. R.; COUTINHO, L. L. Associação de polimorfismo de base única (SNP) no íntron 8 do gene do receptor da leptina em galinhas com rendimento de órgãos. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: SBZ, 2007. 1 CD-ROM. Projeto n. 02.03.21.600-01.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 25. | | RAMOS, S. B.; NUNES, B. N.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; KLEIN, C. H.; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P. Associações genéticas e ambientais entre peso corporal ao abate e deposição de gordura na carcaça de aves resultantes do cruzamento de linhagens de corte e postura. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Anais. Águas de Lindóia: SGB, 2007. p. 167. Projeto n. 01.02.10.210-10.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 26. | | BOSCHIERO, C.; NONES, K.; ROSÁRIO, M. F.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; MOURA, A. S. M. T. Análise de meio-irmãos para o mapeamento fino de uma região associada a QTLs no cromosso 1 da galinha. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Anais. Salvador: SBG, 2008 p. 241. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 28. | | ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Collaborative effort to identify genes involved with bone related traits in broiler chickens. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. P0640.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 29. | | SILVA, F. E. J.; PACKER, I. U.; SILVA, N. A.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C.; ROSÁRIO, M. F. Caracterização genotípica de populações recíprocas brasileiras da galinha usando marcadores microssatélites no cromossomo 5 In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55, 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia:SBG, p. 152, 2009. Projeto/Plano de Ação: 01.06.106.03-05| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 30. | | TAMBASCO, D. D.; ALENCAR, M. M. de; COUTINHO, L. L.; TAMBASCO, M. D.; REGITANO, L. C. de A. Caracterização molecular de animais da raça Nelore utilizando microssatélites e genes candidatos. Revista Brasileira Zootecnia, v.29, n,4, p.1044-1049, 2000.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 31. | | FAUSTO, D. A.; FERRAZ, A. L.; DELGADO, E. F.; ANDRADE, S. C. S.; COUTINHO, L. L.; FEIJO, G. L. D. Changes muscle gene expression profile in Bos indicus cows submitted to medium and high gain rates during recovery from undernutrition In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of Knowledge in animal production - abstracts. Campinas: SBZ, 2013 I CD ROM| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 32. | | CONTEVILLE, L. C.; ANDRADE, B. G.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Carbohydrate active enzymes in metagenome-assembled genomes from ruminal and stool microbiomes of nelore cattle. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal. [Abstracts]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 426. e-book. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana de Almeida Regitano.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 34. | | MOREIRA, G. C. M.; PÉRTILLE, F.; GODOY, T. F.; BRASSOLOTI, R.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Discovery of candidate genes for fatness in chickens based on genotyping with 600K SNP chip in a QTL region. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos? Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 64| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 36. | | TREVISAN, L.; ATTILIO, D. B.; NINOV, K.; PADUAN, M.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; ROSÁRIO, M. F. do. Desenho e otimização de primers do gene FGF2 associado ao crescimento da galinha doméstica. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO, 20., 2012, Pirassununga. [Resumos]. São Paulo: USP, 2012. SIICUSP 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 37. | | PINTO, L. F. P.; PACKER, I. U.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; ENCISO-PÉREZ, M.; COUTINHO, L. L. Efeito epistático de QTLs para peso vivo em frangos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: SBZ, 2007. 1 CD-ROM. Projeto n. 16.00.30.001-16| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 38. | | COUTINHO, L. L.; JORGE, E. C.; ROSÁRIO, M. F. do; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C. Genômica animal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 17.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 9., 2007, Londrina, PR. Anais... Londrina: UEL/ ABZ, 2007. p.429-441 Projeto n. 01.02.102.10-10.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 39. | | PEIXOTO, J. de O.; PERI, E.; COLDEBELLA, A.; TESSMANN, A. L.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Influence of the A286G polymorphism in the LEPR gene on carcass traits in a paternal broiler line. In: WORLD´S POULTRY CONGRESS, 24., 2012, Salvador. Abstract... Salvador: WSPA, 2012. 1 CD-ROM. World's Poultry Science Journal, v. 68, supl. 1, 2012. Projeto/Plano de Ação: 01.06.01.006.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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