| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
19/12/2013 |
|
Data da última atualização: |
14/04/2021 |
|
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
|
Autoria: |
ALVES, E. N. T. D.; MARRIEL, I. E.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; COSTA, R. V. da; COTA, L. V.; SILVA, D. D. da; MATTOS, B. B.; VERDOLIN, A. L. G. |
|
Afiliação: |
ERIKA NAYARA TOMACHESKI DINIZ ALVES, BOLSISTA; IVANILDO EVODIO MARRIEL, CNPMS; CHRISTIANE ABREU DE OLIVEIRA PAIVA, CNPMS; RODRIGO VERAS DA COSTA, CNPMS; LUCIANO VIANA COTA, CNPMS; DAGMA DIONISIA DA SILVA, CNPMS; BIANCA BRAZ MATTOS, CNPMS; ANA LAURA GUIMARÃES VERDOLIN, BOLSISTA. |
|
Título: |
Seleção de microrganismos antagonistas para biocontrole de Fusarium verticillioides na cultura do milho (Zea mays L.). |
|
Ano de publicação: |
2013 |
|
Fonte/Imprenta: |
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2013. |
|
Páginas: |
26 p. |
|
Série: |
(Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 75). |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O objetivo do trabalho foi selecionar e analisar estirpes de bactérias e actinomicetos com potencial antagonista para o biocontrole do Fusarium verticillioides, causador de doenças na cultura do milho. O potencial antagonista de 80 isolados, de bactérias e actinomicetos, foi avaliado in vitro por meio do método de culturas pareadas. Dentre os isolados avaliados, foram selecionados Act.336, B.1433 e Act.9, devido aos maiores índices de inibição contra o fitopatógeno, com valores de 66,9%, 53,1% e 51,9%, respectivamente. A seguir, avaliou-se a influência de metabólitos produzidos por estes microrganismos para a inibição do crescimento micelial fúngico em meio líquido e germinação de conídios do patógeno em meio sólido. Estes isolados pré-selecionados apresentaram efeito antagonista contra o crescimento micelial. Entretanto, em meio sólido, somente os isolados Act.336 e Act.9 inibiram a germinação de conídios do fitopatógeno. Os três isolados apresentaram, in vitro, potencial para uso como antagonista de F. verticillioides. |
|
Thesagro: |
Controle biológico; Doença fungica; Fungo. |
|
Thesaurus Nal: |
Biological control; Fungal diseases of plants; Fungi. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94390/1/bol-75.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01974nam a2200289 a 4500
001 1974347
005 2021-04-14
008 2013 bl uuuu u0uu1 u #d
100 1 $aALVES, E. N. T. D.
245 $aSeleção de microrganismos antagonistas para biocontrole de Fusarium verticillioides na cultura do milho (Zea mays L.).$h[electronic resource]
260 $aSete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo$c2013
300 $a26 p.
490 $a(Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 75).
520 $aO objetivo do trabalho foi selecionar e analisar estirpes de bactérias e actinomicetos com potencial antagonista para o biocontrole do Fusarium verticillioides, causador de doenças na cultura do milho. O potencial antagonista de 80 isolados, de bactérias e actinomicetos, foi avaliado in vitro por meio do método de culturas pareadas. Dentre os isolados avaliados, foram selecionados Act.336, B.1433 e Act.9, devido aos maiores índices de inibição contra o fitopatógeno, com valores de 66,9%, 53,1% e 51,9%, respectivamente. A seguir, avaliou-se a influência de metabólitos produzidos por estes microrganismos para a inibição do crescimento micelial fúngico em meio líquido e germinação de conídios do patógeno em meio sólido. Estes isolados pré-selecionados apresentaram efeito antagonista contra o crescimento micelial. Entretanto, em meio sólido, somente os isolados Act.336 e Act.9 inibiram a germinação de conídios do fitopatógeno. Os três isolados apresentaram, in vitro, potencial para uso como antagonista de F. verticillioides.
650 $aBiological control
650 $aFungal diseases of plants
650 $aFungi
650 $aControle biológico
650 $aDoença fungica
650 $aFungo
700 1 $aMARRIEL, I. E.
700 1 $aOLIVEIRA-PAIVA, C. A.
700 1 $aCOSTA, R. V. da
700 1 $aCOTA, L. V.
700 1 $aSILVA, D. D. da
700 1 $aMATTOS, B. B.
700 1 $aVERDOLIN, A. L. G.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
|
Data corrente: |
09/01/2023 |
|
Data da última atualização: |
09/01/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
ARIYOSHI, C.; SANT'ANA, G. C.; FELICIO, M. S.; SERA, G. H.; NOGUEIRA, L. M.; RODRIGUES, L. M. R.; FERREIRA, R. V.; SILVA, B. S. R. da; RESENDE, M. L. V. de; DESTÉFANO, S. A. L.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P. |
|
Afiliação: |
CAROLINE ARIYOSHI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; GUSTAVO CÉSAR SANT'ANA, TROPICAL MELHORAMENTO & GENÉTICA; MARIANE SILVA FELICIO, INSTITUTO DE DESENVOLVIMENTO RURAL DO PARANÁ; GUSTAVO HIROSHI SERA, INSTITUTO DE DESENVOLVIMENTO RURAL DO PARANÁ; LIVIA MARIA NOGUEIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; LUCAS MATEUS RIVERO RODRIGUES, INSTITUTO AGRONÔMICO; RAFAELLE VECCHIA FERREIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; BRUNA SILVESTRE RODRIGUES DA SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; MÁRIO LÚCIO VILELA DE RESENDE, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; SUZETE APARECIDA LANZA DESTÉFANO, INSTITUTO BIOLÓGICO; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA LUIZ DE QUEIROZ; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa. |
|
Título: |
Genome-wide association study for resistance to Pseudomonas syringae pv. garcae in Coffea arabica. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 13, article 989847, 2022. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.3389/fpls.2022.989847 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Bacteria halo blight (BHB), a coffee plant disease caused by Pseudomonas syringae pv. garcae, has been gaining importance in producing mountain regions and mild temperatures areas as well as in coffee nurseries. Most Coffea arabica cultivars are susceptible to this disease. In contrast, a great source of genetic diversity and resistance to BHB are found in C. arabica Ethiopian accessions. Aiming to identify quantitative trait nucleotides (QTNs) associated with resistance to BHB and the influence of these genomic regions during the domestication of C. arabica, we conducted an analysis of population structure and a Genome-Wide Association Study (GWAS). For this, we used genotyping by sequencing (GBS) and phenotyping for resistance to BHB of a panel with 120 C. arabica Ethiopian accessions from a historical FAO collection, 11 C. arabica cultivars, and the BA-10 genotype. Population structure analysis based on single-nucleotide polymorphisms (SNPs) markers showed that the 132 accessions are divided into 3 clusters: most wild Ethiopian accessions, domesticated Ethiopian accessions, and cultivars. GWAS, using the single-locus model MLM and the multi-locus models mrMLM, FASTmrMLM, FASTmrEMMA, and ISIS EM-BLASSO, identified 11 QTNs associated with resistance to BHB. Among these QTNs, the four with the highest values of association for resistance to BHB are linked to g000 (Chr_0_434_435) and g010741 genes, which are predicted to encode a serine/threonine-kinase protein and a nucleotide binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR), respectively. These genes displayed a similar transcriptional downregulation profile in a C. arabica susceptible cultivar and in a C. arabica cultivar with quantitative resistance, when infected with P. syringae pv. garcae. However, peaks of upregulation were observed in a C. arabica cultivar with qualitative resistance, for both genes. Our results provide SNPs that have potential for application in Marker Assisted Selection (MAS) and expand our understanding about the complex genetic control of the resistance to BHB in C. arabica. In addition, the findings contribute to increasing understanding of the C. arabica domestication history. MenosBacteria halo blight (BHB), a coffee plant disease caused by Pseudomonas syringae pv. garcae, has been gaining importance in producing mountain regions and mild temperatures areas as well as in coffee nurseries. Most Coffea arabica cultivars are susceptible to this disease. In contrast, a great source of genetic diversity and resistance to BHB are found in C. arabica Ethiopian accessions. Aiming to identify quantitative trait nucleotides (QTNs) associated with resistance to BHB and the influence of these genomic regions during the domestication of C. arabica, we conducted an analysis of population structure and a Genome-Wide Association Study (GWAS). For this, we used genotyping by sequencing (GBS) and phenotyping for resistance to BHB of a panel with 120 C. arabica Ethiopian accessions from a historical FAO collection, 11 C. arabica cultivars, and the BA-10 genotype. Population structure analysis based on single-nucleotide polymorphisms (SNPs) markers showed that the 132 accessions are divided into 3 clusters: most wild Ethiopian accessions, domesticated Ethiopian accessions, and cultivars. GWAS, using the single-locus model MLM and the multi-locus models mrMLM, FASTmrMLM, FASTmrEMMA, and ISIS EM-BLASSO, identified 11 QTNs associated with resistance to BHB. Among these QTNs, the four with the highest values of association for resistance to BHB are linked to g000 (Chr_0_434_435) and g010741 genes, which are predicted to encode a serine/threonine-kinase protein and a nucleoti... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Coffea Arábica. |
|
Thesaurus NAL: |
Disease resistance; Genome; Genome-wide association study; Pseudomonas syringae group. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1150817/1/Genome-wide-association-study.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03197naa a2200325 a 4500
001 2150817
005 2023-01-09
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.3389/fpls.2022.989847$2DOI
100 1 $aARIYOSHI, C.
245 $aGenome-wide association study for resistance to Pseudomonas syringae pv. garcae in Coffea arabica.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aBacteria halo blight (BHB), a coffee plant disease caused by Pseudomonas syringae pv. garcae, has been gaining importance in producing mountain regions and mild temperatures areas as well as in coffee nurseries. Most Coffea arabica cultivars are susceptible to this disease. In contrast, a great source of genetic diversity and resistance to BHB are found in C. arabica Ethiopian accessions. Aiming to identify quantitative trait nucleotides (QTNs) associated with resistance to BHB and the influence of these genomic regions during the domestication of C. arabica, we conducted an analysis of population structure and a Genome-Wide Association Study (GWAS). For this, we used genotyping by sequencing (GBS) and phenotyping for resistance to BHB of a panel with 120 C. arabica Ethiopian accessions from a historical FAO collection, 11 C. arabica cultivars, and the BA-10 genotype. Population structure analysis based on single-nucleotide polymorphisms (SNPs) markers showed that the 132 accessions are divided into 3 clusters: most wild Ethiopian accessions, domesticated Ethiopian accessions, and cultivars. GWAS, using the single-locus model MLM and the multi-locus models mrMLM, FASTmrMLM, FASTmrEMMA, and ISIS EM-BLASSO, identified 11 QTNs associated with resistance to BHB. Among these QTNs, the four with the highest values of association for resistance to BHB are linked to g000 (Chr_0_434_435) and g010741 genes, which are predicted to encode a serine/threonine-kinase protein and a nucleotide binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR), respectively. These genes displayed a similar transcriptional downregulation profile in a C. arabica susceptible cultivar and in a C. arabica cultivar with quantitative resistance, when infected with P. syringae pv. garcae. However, peaks of upregulation were observed in a C. arabica cultivar with qualitative resistance, for both genes. Our results provide SNPs that have potential for application in Marker Assisted Selection (MAS) and expand our understanding about the complex genetic control of the resistance to BHB in C. arabica. In addition, the findings contribute to increasing understanding of the C. arabica domestication history.
650 $aDisease resistance
650 $aGenome
650 $aGenome-wide association study
650 $aPseudomonas syringae group
650 $aCoffea Arábica
700 1 $aSANT'ANA, G. C.
700 1 $aFELICIO, M. S.
700 1 $aSERA, G. H.
700 1 $aNOGUEIRA, L. M.
700 1 $aRODRIGUES, L. M. R.
700 1 $aFERREIRA, R. V.
700 1 $aSILVA, B. S. R. da
700 1 $aRESENDE, M. L. V. de
700 1 $aDESTÉFANO, S. A. L.
700 1 $aDOMINGUES, D. S.
700 1 $aPEREIRA, L. F. P.
773 $tFrontiers in Plant Science$gv. 13, article 989847, 2022.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
