| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|
Data corrente: |
26/11/2015 |
|
Data da última atualização: |
17/03/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
FARIAS, L. R.; SCHIMMELPFENG, P. H. C.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, N. F.; BORGES, M.; MORAES, M. C. B.; LAUMANN, R. A.; BÁO, S. N.; PAULA, D. P. |
|
Afiliação: |
LUCIANA R. FARIAS, UnB; PEDRO H. C. SCHIMMELPFENG, UnB; ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN; PRISCILA GRYNBERG; NATALIA FLORENCIO MARTINS, CENARGEN; MIGUEL BORGES, CENARGEN; MARIA CAROLINA BLASSIOLI MORAES, CENARGEN; RAUL ALBERTO LAUMANN, CENARGEN; SÔNIA N. BÁO, UnB; DEBORA PIRES PAULA, CENARGEN. |
|
Título: |
Transcriptome-based identification of highly similar odorant-binding proteins among neotropical stink bugs and their egg parasitoid. |
|
Ano de publicação: |
2015 |
|
Fonte/Imprenta: |
Plos One, jul., 2015. |
|
DOI: |
10.1371/journal.pone.013228 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Olfaction plays a fundamental role in insect survival through resource location and intra and interspecific communications. We used RNA-Seq to analyze transcriptomes for odorant-binding proteins (OBPs) from major stink bug pest species in Brazil, Euschistus heros, Chinavia ubica, and Dichelops melacanthus, and from their egg parasitoid, Telenomus podisi. We identified 23 OBPs in E. heros, 25 OBPs in C. ubica, 9 OBPs in D. melacanthus, and 7 OBPs in T. podisi. The deduced amino acid sequences of the full-length OBPs had low intraspecific similarity, but very high similarity between two pairs of OBPs from E. heros and C. ubica (76.4 and 84.0%) and between two pairs of OBPs from the parasitoid and its preferred host E. heros (82.4 and 88.5%), confirmed by a high similarity of their predicted tertiary structures. The similar pairs of OBPs from E. heros and C. ubica may suggest that they have derived from a common ancestor, and retain the same biological function to bind a ligand perceived or produced in both species. The T. podisi OBPs similar to E. heros were not orthologous to any known hymenopteran OBPs, and may have evolved independently and converged to the host OBPs, providing a possible basis for the host location of T. podisi using E. heros semiochemical cues. |
|
Palavras-Chave: |
Chinavia ubica; Pragas. |
|
Thesagro: |
Euschistus Heros. |
|
Thesaurus Nal: |
Dichelops melacanthus. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/135672/1/journal.pone.01322862.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02171naa a2200301 a 4500
001 2029755
005 2023-03-17
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1371/journal.pone.013228$2DOI
100 1 $aFARIAS, L. R.
245 $aTranscriptome-based identification of highly similar odorant-binding proteins among neotropical stink bugs and their egg parasitoid.$h[electronic resource]
260 $c2015
520 $aOlfaction plays a fundamental role in insect survival through resource location and intra and interspecific communications. We used RNA-Seq to analyze transcriptomes for odorant-binding proteins (OBPs) from major stink bug pest species in Brazil, Euschistus heros, Chinavia ubica, and Dichelops melacanthus, and from their egg parasitoid, Telenomus podisi. We identified 23 OBPs in E. heros, 25 OBPs in C. ubica, 9 OBPs in D. melacanthus, and 7 OBPs in T. podisi. The deduced amino acid sequences of the full-length OBPs had low intraspecific similarity, but very high similarity between two pairs of OBPs from E. heros and C. ubica (76.4 and 84.0%) and between two pairs of OBPs from the parasitoid and its preferred host E. heros (82.4 and 88.5%), confirmed by a high similarity of their predicted tertiary structures. The similar pairs of OBPs from E. heros and C. ubica may suggest that they have derived from a common ancestor, and retain the same biological function to bind a ligand perceived or produced in both species. The T. podisi OBPs similar to E. heros were not orthologous to any known hymenopteran OBPs, and may have evolved independently and converged to the host OBPs, providing a possible basis for the host location of T. podisi using E. heros semiochemical cues.
650 $aDichelops melacanthus
650 $aEuschistus Heros
653 $aChinavia ubica
653 $aPragas
700 1 $aSCHIMMELPFENG, P. H. C.
700 1 $aTOGAWA, R. C.
700 1 $aCOSTA, M. M. do C.
700 1 $aGRYNBERG, P.
700 1 $aMARTINS, N. F.
700 1 $aBORGES, M.
700 1 $aMORAES, M. C. B.
700 1 $aLAUMANN, R. A.
700 1 $aBÁO, S. N.
700 1 $aPAULA, D. P.
773 $tPlos One, jul., 2015.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
29/03/2011 |
|
Data da última atualização: |
12/04/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Documentos |
|
Autoria: |
SANTOS, E. H. dos. |
|
Afiliação: |
EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA. |
|
Título: |
Estrutura básica do MicroArray Gene Expression Markup Language - MAGE-ML. |
|
Ano de publicação: |
2010 |
|
Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. |
|
Páginas: |
27 p. il. |
|
Série: |
(Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 107). |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Um dos objetivos da Rede Genômica Animal é a identificação de genes que contribuam para o melhoramento de características de interesse econômico em animais de produção. Uma das ferramentas para prospecção e análise desses genes é o Microarranjo de DNA, uma técnica que permite avaliar a expressão gênica em condições específicas. Apesar de seu uso amplamente difundido na comunidade científica, os procedimentos e as informações de experimentos nem sempre são padronizados, a despeito dos esforços na criação de uma linguagem padrão como o MAGE-ML. Este documento visa apresentar o padrão MAGE-ML para aqueles que ainda não se utilizam desse recurso e gostariam de aprender um pouco a respeito. |
|
Palavras-Chave: |
Expressão gênica; MAGE-ML; Microarranjo de DNA. |
|
Thesaurus NAL: |
Gene expression; Microarray technology. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/31580/1/doc107-10.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01338nam a2200193 a 4500
001 1883658
005 2011-04-12
008 2010 bl uuuu u0uu1 u #d
100 1 $aSANTOS, E. H. dos
245 $aEstrutura básica do MicroArray Gene Expression Markup Language - MAGE-ML.$h[electronic resource]
260 $aCampinas: Embrapa Informática Agropecuária$c2010
300 $a27 p. il.
490 $a(Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 107).
520 $aUm dos objetivos da Rede Genômica Animal é a identificação de genes que contribuam para o melhoramento de características de interesse econômico em animais de produção. Uma das ferramentas para prospecção e análise desses genes é o Microarranjo de DNA, uma técnica que permite avaliar a expressão gênica em condições específicas. Apesar de seu uso amplamente difundido na comunidade científica, os procedimentos e as informações de experimentos nem sempre são padronizados, a despeito dos esforços na criação de uma linguagem padrão como o MAGE-ML. Este documento visa apresentar o padrão MAGE-ML para aqueles que ainda não se utilizam desse recurso e gostariam de aprender um pouco a respeito.
650 $aGene expression
650 $aMicroarray technology
653 $aExpressão gênica
653 $aMAGE-ML
653 $aMicroarranjo de DNA
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
