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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
12/09/2014 |
Data da última atualização: |
29/04/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; SILVEIRA, R. D. D.; ZAMBUSSI-CARVALHO, P. F.; PEREIRA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. do C.; GUIMARÃES, C. M.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO-BRONDANI, R. P. |
Afiliação: |
BÁRBARA SALOMÃO DE FARIA MÜLLER, BIOAGRO - UFV; TETSU SAKAMOTO, UFMG; RICARDO DIÓGENES DIAS SILVEIRA; PATRICIA FERNANDA ZAMBUSSI-CARVALHO, UFG; MARISTELA PEREIRA, UFG; GEORGIOS JOANIS PAPPAS JUNIOR, UNB; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN; CLEBER MORAIS GUIMARAES, CNPAF; WENDELL JACINTO PEREIRA; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
Título: |
Differentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporter, Athens, v. 32, p. 438-451, 2014. |
DOI: |
10.1007/s11105-013-0651-7 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Drought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly those of the AP2-EREBP family (97.8 %). Of the target sequences validated by quantitative real-time polymerase chain reaction, most genes showed an expression level that agreed with that predicted by in silico analysis. Thus, the drought transcriptome dataset is a valuable resource on the variation in these gene sequences, offering the opportunity to identify robust molecular markers tightly linked to trait-controlling loci for use in marker-assisted breeding. MenosDrought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly thos... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Deficiência hídrica; Feijão; Phaseolus vulgaris. |
Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Beans; Water stress. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180004/1/Muller2014-Article-DifferentiallyExpressedGenesDu.pdf
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Marc: |
LEADER 02986naa a2200325 a 4500 001 1994817 005 2024-04-29 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11105-013-0651-7$2DOI 100 1 $aMÜLLER, B. S. de F. 245 $aDifferentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aDrought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly those of the AP2-EREBP family (97.8 %). Of the target sequences validated by quantitative real-time polymerase chain reaction, most genes showed an expression level that agreed with that predicted by in silico analysis. Thus, the drought transcriptome dataset is a valuable resource on the variation in these gene sequences, offering the opportunity to identify robust molecular markers tightly linked to trait-controlling loci for use in marker-assisted breeding. 650 $aAbiotic stress 650 $aBeans 650 $aWater stress 650 $aDeficiência hídrica 650 $aFeijão 650 $aPhaseolus vulgaris 700 1 $aSAKAMOTO, T. 700 1 $aSILVEIRA, R. D. D. 700 1 $aZAMBUSSI-CARVALHO, P. F. 700 1 $aPEREIRA, M. 700 1 $aPAPPAS JUNIOR, G. J. 700 1 $aCOSTA, M. M. do C. 700 1 $aGUIMARÃES, C. M. 700 1 $aPEREIRA, W. J. 700 1 $aBRONDANI, C. 700 1 $aVIANELLO-BRONDANI, R. P. 773 $tPlant Molecular Biology Reporter, Athens$gv. 32, p. 438-451, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
Data corrente: |
14/10/2004 |
Data da última atualização: |
29/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
EGITO, A. S. do; GIRARDT, J. M.; POIRSON, C.; HUMBERT, G.; MICLO, L.; GAILLARD, J. L. |
Afiliação: |
ANTONIO SILVIO DO EGITO, CNPC. |
Título: |
Ação da plasmina sobre as caseínas equinas. |
Ano de publicação: |
2002 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINÁRIA, 29., 2002, Gramado, RS. Saúde ambiental, animal e humana: uma questão de sobrevivência: anais. Gramado: Sociedade Brasileira de Medicina Veterinária, 2002. 1 CD ROM. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A criação de éguas leiteiras tem apresentado grande interesse em alguns países da Europa em decorrência da possível utilização deste leite como cosméticos, medicamentos e alimentos dietéticos. Um conhecimento mais substancial das propriedades bioquímicas do leite eqüino promoverá uma valorização dos constituintes deste leite e principalmente de suas proteínas. O objetivo deste estudo foi investigar a ação da plasmina sobre as caseínas eqüinas, durante a estocagem destas últimas em solução, e identificar os possíveis produtos de degradação obtidos pela ação da plasmina sobre a b caseína do leite de égua. Realizou-se uma hidrólise do caseinato pela plasmina (0,23 unidades de plasmina por mL de solução de caseinato a 10mg.mL-1) a 37°C e pH 8,0 durante diferentes tempos. A caseína b eqüina e, em menor grau a as1 e a k , são bons substratos para ação da plasmina. A b caseína equina é facilmente hidrolisada pela plasmina apresentando um local de preferencia de ação enzimática na posição Lys47-Ile48,produzindo caseína do tipo g de 22 kDa, similar a g caseína bovina. Estas caseínas do tipo g são degradadas pela solução de plasmina posteriormente a sua formação. A presença de peptídeos proteoses-peptonas de 20 kDa associados ao caseinato de sódio, parece ser ocasionado pela atividade da plasmina endógena existente no leite equino. No entanto, a sua formação não é evidente quando a região amino-terminal da caseína b é hidrolisada pela plasmina. A plasmina endógena parece estar fortemente associada à micela de caseína no leite eqüino, uma vez que uma atividade residual é encontrada na solução de caseinato de sódio quando incubado a 37ºC a pH 8,0, durante 24 h ou quando o caseinato de sódio é estocado a 7ºC por um período de 2 anos. MenosA criação de éguas leiteiras tem apresentado grande interesse em alguns países da Europa em decorrência da possível utilização deste leite como cosméticos, medicamentos e alimentos dietéticos. Um conhecimento mais substancial das propriedades bioquímicas do leite eqüino promoverá uma valorização dos constituintes deste leite e principalmente de suas proteínas. O objetivo deste estudo foi investigar a ação da plasmina sobre as caseínas eqüinas, durante a estocagem destas últimas em solução, e identificar os possíveis produtos de degradação obtidos pela ação da plasmina sobre a b caseína do leite de égua. Realizou-se uma hidrólise do caseinato pela plasmina (0,23 unidades de plasmina por mL de solução de caseinato a 10mg.mL-1) a 37°C e pH 8,0 durante diferentes tempos. A caseína b eqüina e, em menor grau a as1 e a k , são bons substratos para ação da plasmina. A b caseína equina é facilmente hidrolisada pela plasmina apresentando um local de preferencia de ação enzimática na posição Lys47-Ile48,produzindo caseína do tipo g de 22 kDa, similar a g caseína bovina. Estas caseínas do tipo g são degradadas pela solução de plasmina posteriormente a sua formação. A presença de peptídeos proteoses-peptonas de 20 kDa associados ao caseinato de sódio, parece ser ocasionado pela atividade da plasmina endógena existente no leite equino. No entanto, a sua formação não é evidente quando a região amino-terminal da caseína b é hidrolisada pela plasmina. A plasmina endógena parece estar forteme... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Leite de égua. |
Thesagro: |
Caseína. |
Thesaurus NAL: |
Casein; Mare milk. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/45334/1/rac-Acao-da-plasmina.pdf
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Marc: |
LEADER 02578nam a2200217 a 4500 001 1530794 005 2023-08-29 008 2002 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aEGITO, A. S. do 245 $aAção da plasmina sobre as caseínas equinas.$h[electronic resource] 260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINÁRIA, 29., 2002, Gramado, RS. Saúde ambiental, animal e humana: uma questão de sobrevivência: anais. Gramado: Sociedade Brasileira de Medicina Veterinária, 2002. 1 CD ROM.$c2002 520 $aA criação de éguas leiteiras tem apresentado grande interesse em alguns países da Europa em decorrência da possível utilização deste leite como cosméticos, medicamentos e alimentos dietéticos. Um conhecimento mais substancial das propriedades bioquímicas do leite eqüino promoverá uma valorização dos constituintes deste leite e principalmente de suas proteínas. O objetivo deste estudo foi investigar a ação da plasmina sobre as caseínas eqüinas, durante a estocagem destas últimas em solução, e identificar os possíveis produtos de degradação obtidos pela ação da plasmina sobre a b caseína do leite de égua. Realizou-se uma hidrólise do caseinato pela plasmina (0,23 unidades de plasmina por mL de solução de caseinato a 10mg.mL-1) a 37°C e pH 8,0 durante diferentes tempos. A caseína b eqüina e, em menor grau a as1 e a k , são bons substratos para ação da plasmina. A b caseína equina é facilmente hidrolisada pela plasmina apresentando um local de preferencia de ação enzimática na posição Lys47-Ile48,produzindo caseína do tipo g de 22 kDa, similar a g caseína bovina. Estas caseínas do tipo g são degradadas pela solução de plasmina posteriormente a sua formação. A presença de peptídeos proteoses-peptonas de 20 kDa associados ao caseinato de sódio, parece ser ocasionado pela atividade da plasmina endógena existente no leite equino. No entanto, a sua formação não é evidente quando a região amino-terminal da caseína b é hidrolisada pela plasmina. A plasmina endógena parece estar fortemente associada à micela de caseína no leite eqüino, uma vez que uma atividade residual é encontrada na solução de caseinato de sódio quando incubado a 37ºC a pH 8,0, durante 24 h ou quando o caseinato de sódio é estocado a 7ºC por um período de 2 anos. 650 $aCasein 650 $aMare milk 650 $aCaseína 653 $aLeite de égua 700 1 $aGIRARDT, J. M. 700 1 $aPOIRSON, C. 700 1 $aHUMBERT, G. 700 1 $aMICLO, L. 700 1 $aGAILLARD, J. L.
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Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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