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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Data corrente:  29/08/2022
Data da última atualização:  29/08/2022
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; CAETANO, A. R.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; O'SULLIVAN, F. L. A.
Afiliação:  R. V. PAIXÃO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; FERNANDA LOUREIRO ALMEIDA OSULLIVAN, CPAA.
Título:  Phylogenomic and expression analysis of Colossoma macropomum cyp19a1a and cyp19a1b and their non-classical role in tambaqui sex differentiation.
Ano de publicação:  2022
Fonte/Imprenta:  Gene, v. 843, art. 146795, Nov. 2022.
DOI:  https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146795
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The genes coding for Cytochrome P450 aromatase (cyp19a1a and cyp19a1b) and estrogen (E2) receptors (esr1, esr2a and esr2b) play a conserved role in ovarian differentiation and development among teleosts. Classically, the "gonad form" of aromatase, coded by the cyp19a1a, is responsible for the ovarian differentiation in genetic females via ligation and activation of the Esr, which mediates the endocrine and exocrine signaling to allow or block the establishment of the feminine phenotype. However, in neotropical species, studies on the molecular and endocrine processes involved in gonad differentiation as well as on the effects of sex modulators are recent and scarce. In this study, we combined in silico analysis, real-time quantitative PCR (qPCR) assay and quantification of E2 plasma levels of differentiating tambaqui (Colossoma macropomum) to unveil the roles of the paralogs cypa19a1a and cyp19a1b during sex differentiation.
Palavras-Chave:  Cyp19a1; Neotropical fish; Promoter Structure; Sex development; Synteny.
Thesagro:  Colossoma Macropomum; Tambaqui.
Thesaurus Nal:  Aromatase; Colossoma; Fish; Phylogeny.
Categoria do assunto:  --
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1145818/1/1-s2.0-S037811192200614X-main.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CENARGEN38907 - 1UPCAP - DD
CNPASA1188 - 1UPCAP - DD20222022
CNPTIA21242 - 1UPCAP - DD
CPAA38809 - 1UPCAP - DD
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Registros recuperados : 41
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1.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Computational investigations in eukaryotes genome de novo assembly using short reads. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Instruções para uso do Open Grid Engine no Laboratório Multiusuário de Bioinformática. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2016. 26 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 154).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Sistemas de arquivos distribuídos em apoio ao processamento científico. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2017. 45 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 151).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Uma proposta para a virtualização de servidores utilizando Xen. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 7 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 111).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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5.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Virtualização com o Xen: instalando e configurando o ambiente. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 8 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 102).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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6.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; CINTRA, L. C. Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. Campinas: Embrapa informática Agropecuária, 2016. 36 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 149).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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7.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; GONZALEZ, C. A. L. Uso de nuvem pública para computação de alto desempenho. Campinas: Embrapa Agricultura Digital, 2022. 14 p. il. color. (Embrapa Agricultura Digital. Documentos, 188).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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8.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Development of a computational pipeline to detect positive selection. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P1007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; NAKAI, A. M.; CORREA, J. L. Métodos, procedimentos e técnicas utilizadas na construção de AgroTIC. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 15. p. 293-301.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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10.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; NAKAI, A. M.; CORREA, J. L. Methods, procedures and techniques used in constructing AgroICT. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Information and communication technologies and their relations with agriculture. Brasília, DF: Embrapa, 2016. ch. 15, p. 287-294.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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11.Imagem marcado/desmarcadoVAZ, G. J.; CORREA, J. L.; CINTRA, L. C.; FERREIRA, D. M.; PIEROZZI JUNIOR, I. Agropedia brasilis. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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12.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, London, v. 16, n. 1, 567, Aug. 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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13.Imagem marcado/desmarcadoNAGAI, L. A. E.; SILVA, F. R.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Using Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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14.Imagem marcado/desmarcadoFELTRIM, D.; GUPTA, B.; GUNDIMEDA, S.; KIYOTA, E.; DOMINGUES JÚNIOR, A. P.; CINTRA, L. C.; MAZZAFERA, P. Exposure of Eucalyptus to varied temperature and CO2 has a profound effect on the physiology and expression of genes related to cell wall formation and remodeling. Tree Genetics & Genomes v. 18, n. 1, 3, Feb. 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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15.Imagem marcado/desmarcadoPAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; CAETANO, A. R.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; O'SULLIVAN, F. L. A. Phylogenomic and expression analysis of Colossoma macropomum cyp19a1a and cyp19a1b and their non-classical role in tambaqui sex differentiation. Gene, v. 843, art. 146795, Nov. 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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16.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Aplicações da bioinformática na agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (Ed.). Agricultura digital: pesquisa, desenvolvimento e inovação nas cadeias produtivas. Brasília, DF: Embrapa, 2020. cap. 10, p. 234-257.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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17.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Applications of bioinformatics in agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (ed.). Digital agriculture: research, development and innovation in production chains. Brasília, DF: Embrapa, 2023. cap. 10, p. 179-194.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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18.Imagem marcado/desmarcadoGUIMARÃES, P. S.; SCHENK, J. C. M.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; SILVAROLLA, M. B.; PADILHA, L.; MALUF, M. P. Large-scale prospection of genes on caffeine-free Coffea arabica plants - discovery of novel markers associated with development and secondary metabolism. Plant Gene, v. 27, p. 1-9, Sept. 2021. Article 100314.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café.
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19.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; SILVA, N. M. A. da; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Genome Sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0481.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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20.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; SILVA, N. M. A. da; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Genome sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0481.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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