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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
06/03/2019 |
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Data da última atualização: |
06/03/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VALENTE, J. B.; PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; FARIAS, M.; KUHNEM, P.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; CASA, R. T.; BOGO, A.; SILVA, F. N. da. |
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Afiliação: |
UDESC; UDESC; UDESC; UDESC; BIOTRIGO; DOUGLAS LAU, CNPT; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; ANTONIO NHANI JUNIOR, CNPTIA; UDESC; UDESC; UDESC. |
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Título: |
A novel putative member of the family Benyviridae is associated with soilborne wheat mosaic disease in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Pathology, v. 68, n. 3, p. 588-600, Apr. 2019. |
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DOI: |
10.1111/ppa.12970 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soilborne wheat mosaic disease (SBWMD), originally attributed to infections by Soilborne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat spindle streak mosaic virus (WSSMV), is one of the most frequent virus diseases and causes economic losses in wheat in southern Brazil. This study aimed to characterize molecularly the viral species associated with wheat plants showing mosaic symptoms in Brazil. Wheat leaves and stems displaying mosaic symptoms were collected from different wheat cultivars in Passo Fundo municipality, Rio Grande do Sul State, southern Brazil. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and next-generation sequencing. No sequences of SBWMV and WSSMV were detected but the complete genome sequence of a putative new member of the family Benyviridae was determined, for which the name wheat stripe mosaic virus (WhSMV) is proposed. WhSMV has a bipartite genome with RNA 1 and RNA 2 organization similar to that of viruses belonging to Benyviridae. WhSMV RNA 1 has a single open reading frame (ORF) encoding a polyprotein with putative viral replicase function. WhSMV RNA 2 has six ORFs encoding the coat protein, the major protein (read-through), triple gene block movement proteins (TGB 1, 2 and 3) and ORF 6 (hypothetical protein). In addition to the genomic organization and nucleotide and amino acid sequence identities, phylogenetic analyses also corroborated that WhSMV is a virus species of the Benyviridae. However, isolates of WhSMV formed a clade distinct from members of the genus Benyvirus. It was also demonstrated that the plasmodiophorid Polymyxa graminis is associated with wheat roots showing SBWMD symptoms and infected by WhSMV. Keywords: Benyviridae, mosaic symptoms, next-generation sequencing, Polymyxa graminis, Triticum aestivum, wheat stripe mosaic virus MenosSoilborne wheat mosaic disease (SBWMD), originally attributed to infections by Soilborne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat spindle streak mosaic virus (WSSMV), is one of the most frequent virus diseases and causes economic losses in wheat in southern Brazil. This study aimed to characterize molecularly the viral species associated with wheat plants showing mosaic symptoms in Brazil. Wheat leaves and stems displaying mosaic symptoms were collected from different wheat cultivars in Passo Fundo municipality, Rio Grande do Sul State, southern Brazil. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and next-generation sequencing. No sequences of SBWMV and WSSMV were detected but the complete genome sequence of a putative new member of the family Benyviridae was determined, for which the name wheat stripe mosaic virus (WhSMV) is proposed. WhSMV has a bipartite genome with RNA 1 and RNA 2 organization similar to that of viruses belonging to Benyviridae. WhSMV RNA 1 has a single open reading frame (ORF) encoding a polyprotein with putative viral replicase function. WhSMV RNA 2 has six ORFs encoding the coat protein, the major protein (read-through), triple gene block movement proteins (TGB 1, 2 and 3) and ORF 6 (hypothetical protein). In addition to the genomic organization and nucleotide and amino acid sequence identities, phylogenetic analyses also corroborated that WhSMV is a virus species of the Benyviridae. However, isolates of WhSMV formed a clade ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Benyviridae; Bioinformática; Mosaic symptoms; Next-generation sequencing; Vírus do mosaico de trigo; Wheat stripe mosaic virus. |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Mosaico; Polymyxa Graminis; Trigo; Triticum Aestivum. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Plant diseases and disorders; Soil-borne wheat mosaic virus. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/193668/1/ID44548-2019v68n3p588PantPathol.pdf
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Marc: |
LEADER 03056naa a2200421 a 4500
001 2106700
005 2019-03-06
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Registro original: |
Embrapa Trigo (CNPT) |
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| Registros recuperados : 45 | |
| 1. |  | CASA, R. T.; REIS, E. M. Efeito do tratamento de sementes de milho com fungicidas na proteção de Pythium, no solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 27., 1994, Itajaí. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 19, p. 318, ago. 1994. Suplemento.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 3. | | REIS, E. M.; CASA, R. T.; SANTOS, H. P. dos. Efeito da rotação de culturas e de manejo do solo na intensidade de manchas foliares do trigo e sua relação com a incidência na semente colhida. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 26., 1993, Aracajú. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 18, p. 280, ago. 1993. Suplemento.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 4. | | REIS, E. M.; CASA, R. T.; SILVA, M. S. Efeito da erradicação de Drechslera teres, em semente, no desenvolvimento da mancha-em-rede da cevada. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 26., 1993, Aracajú. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 18, p. 315, ago. 1993. Suplemento.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 5. | | REIS, E. M.; CASA, R. T.; SÓ e SILVA, M. Efeito do tratamento de sementes de cevada no controle e no desenvolvimento da mancha-em-rede, causada por Drechslera teres. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 20, n. 4, p. 561-565, dez. 1995.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 7. | | BOGO, A.; MAFFIOLETTI, M. A.; VALDEBENITO-SANHUEZA, R. M.; CASA, R. T. Caracterização morfológica de isolados de Cryptosporiosis perennans em diferentes meios de cultura. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, n. 3, p. 248-251, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 8. | | HEMCKMEIER, D.; GALINDO, C. M.; MELCHIORETTO, E.; GAVA, A.; CASA, R. T. Claviceps purpurea e Bipolaris sp. como causa de ergotismo em bovinos no estado de Santa Catarina. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 5, p. 875-882, maio 2018 Título em inglês: Claviceps purpurea e Bipolaris sp. as a cause of ergotism in cattle in Santa Catarina State.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 9. | | REIS, E. M.; GASSEN, F.; CASA, R. T.; SÓ e SILVA, M. Relação entre a incidência e a severidade da mancha-em-rede da cevada, causada por Drechslera teres. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 20, n. 4, p. 601-604, dez. 1995.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 10. | | CASA, R. T.; REIS, E. M.; GASSEN, F. R.; SILVA, M. S. Relação entre a severidade e a incidência de mancha-em-rede da cevada, causada por Drechslera teres. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 27., 1994, Itajai. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 19, p. 337, ago. 1994. Suplemento.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 11. | | REIS, E. M.; CASA, R. T.; BIANCHIN, V.; DANELLI, A. L. D. Manejo integrado de doenças do trigo. In: SANTOS, H. P. dos; FONTANELI, R. S.; SPERA, S. T. (Ed.). Sistemas de produção para cereais de inverno sob plantio direto no sul do Brasil. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2010. Cap. 6, p. 161-205. Cap. 6, p. 161-205.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 12. | | REIS, E. M.; CASA, R. T.; BLUM, M. M. C.; SANTOS, H. P. dos, MEDEIROS, C. A. Efeitos de práticas culturais na severidade de manchas foliares do trigo e sua relação com a incidência de fungos patogenicos na semente colhida. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 22, n. 3, p. 407-412, set. 1997.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 13. | | NUNES, C. C.; ALVES, S. A. M.; BOGO, A.; CASA, R. T.; CZERMAINSKI, A. B. C.; SILVA, F. N. da. Optimal conditions for conidial germination and infection of European pear leaves by Diplocarpon mespili. Tropical Plant Pathology, v. 41, n. 2, p. 78-83, April 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 14. | | SANGOI, L.; SCHWEITZER, C.; SILVA, P. R. F. da; SCHIMITT, A.; VARGAS, V. P.; CASA, R. T.; SOUZA, C. A. Perfilhamento, área foliar e produtividade do milho sob diferentes arranjos espaciais. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 6, p. 609-616, jun. 2011 Título em inglês: Maize tillering, leaf area, and grain productivity under different spatial arrangement.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; BOGO, A.; CASA, R. T.; SILVA, F. N. da. Caracterização molecular do vírus da espiga branca do trigo no Brasil. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 14., 2021, Passo Fundo. Atas e resumos. Castro: Fundação ABC, 2021. p. 276-279.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 16. | | PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; BOGO, A.; CASA, R. T.; SILVA, F. N. da. Caracterização molecular do vírus da espiga branca do trigo no Brasil. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 14., 2021. Atas e resumos... Castro: Fundação ABC: Passo Fundo: Biotrigo Genética, 2021. p. 276-279.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 18. | | PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; VALENTE, J. B.; FARIAS, M.; BORBA, M. C.; LAU, D.; KUHNEM, P.; CASA, R. T.; SILVA, F. N. da. Seed treatments on wheat stripe mosaic virus management and molecular characterization of Plasmodiophorid vector. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 29.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 13., 2018, Gramado. Resumos... Brasília, DF: SBV, 2018. p. 283-284.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | STEMPKOWSKI, L. A.; PEREIRA, F. S.; MAR, T. B.; LAU, D.; KUHNEM, P.; CASA, R. T.; SILVA, F. N. da; ZERBINI, F. M. Genetic variability and population structure of wheat stripe mosaic virus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 33.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 17., 2022, Porto Seguro. Anais... Brasília, DF: SBV, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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