Data/hora: 01/06/2024 17:54:30

Biblioteca(s): | Embrapa Unidades Centrais.
Data corrente: | 02/04/2004
Data da última atualização: | 04/09/2006
Autoria: | CARVALHO, L. de F. S.
Título: | BLOOM-BLAST object Oriented Management: uma solução integrada para gerenciamento dos resultados do BLAST por meio de um paradigma orientado a objetos.
Ano de publicação: | 2002
Fonte/Imprenta: | 2002 .
Páginas: | 203 f.
Idioma: | Português
Notas: | Pós Graduação (Pesquisa Mestrado em Gestão do Conhecimento  e da   Tecnologia da Informação)) - Universidade Católica de Brasília - Brasília-DF

Conteúdo:

Considerada uma disciplina especial desde o início dos anos 80, a bioinformática 
pode ser definida como uma modalidade que abrange todos os aspectos de 
aquisição, processamento, armazenamento, distribuição, análise e interpretação da 
informação biológica. Tudo ocorre numa estreita sinergia com o paradigma 
fundamental da biologia molecular, a qual postula que a informação genética está 
armazenada nas seqüências de DNA. Após a iniciativa pública do Projeto do Genoma Humano, iniciado em 1990 e com   prazo previsto para ser completado em 2005, tem havido crescimento   extraordinário do volume de seqüências de nucleotídeos e de aminoácidos   disponível em bancos de dados. Para que se converta em efetivo benefício na   medicina, na biotecnologia, na agronomia e em diversas outras áreas, toda essa  informação genética precisa ser processada, comparada e analisada, o que constitui  novos desafios para bioinformática, matemática e estatística: integrar e disponibilizar  esses dados por meio de ferramentas amigáveis que permitam a mineração eficiente   de informações pelos especialistas, mesmo aqueles pouco afeitos a computadores e  a biologia molecular.  A proposta desta pesquisa é integrar o maior número possível de serviços de análise   de seqüências, encapsulando-os em um único aplicativo de interface gráfica   interativa. Inicialmente estão sendo considerados quatro serviços, a saber:  alinhamento pairwise, alinhamento múltiplo, predição de estrutura secundária de  proteína e derivação de árvore filogenética. Com isso, pretende-se tornar a análise   genômica mais acessível, eficiente e simplificada, o que permitirá aos pesquisadores  concentrarem-se principalmente na interpretação biológica dos resultados.
Quanto à bioinformática, os resultados obtidos nesta pesquisa permitem concluir 
que o aplicativo em desenvolvimento vem possibilitando aos pesquisadores da Rede 
Biofoco: melhor gerenciamento, organização e disponibilização das informações 
genômicas; e uso desse como ferramenta de datamining, auxiliando na visualização e 
exploração das informações que trafegam como entrada ou saída entre as diversas 
ferramentas integradas. Quanto à informática, alguns dos principais ganhos são: 
validação e emprego de orientação a objetos, CORBA, UML e RUP no 
desenvolvimento de uma ferramenta para uso científico; integração com utilitários 
externos e com os sistemas Anotação e Genoma; e reuso da arquitetura empregada 
no sistema Genoma.

Palavras-Chave: | Bioinformática; BLAST; BLOSUM; FAST; Projeto Genoma.
Thesagro: | Biologia Molecular; DNA; RNA.
Categoria do assunto: | --
Registro original: | Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE)
Exemplares: | AI-SEDE - (26026-1) - ADD - TS - -- - 02/051 - CAR - 2002.00051 - DIS