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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
26/04/2010 |
Data da última atualização: |
29/09/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MAIA, L. C. da; SOUZA, V. Q. de; KOPP, M. M.; CARVALHO, F. I. F. de F; OLIVEIRA, A. C. |
Afiliação: |
LUCIANO CARLOS DA MAIA, UFPel; VELCI QUEIRÓZ DE SOUZA, UFSM; MAURICIO MARINI KOPP, CNPGL; ERNANDO IRAJÁ FÉLIX DE CARVALHO, UFPel; ANTÔNIO COSTA OLIVEIRA, UFPel. |
Título: |
Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 4, p. 822-833, 2009. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Tandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. |
Palavras-Chave: |
Comparative genomics; EST; SSR. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711664/1/Tandem-repeat-distribution-of-gene-transcripts-in-three-plant-families.pdf
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Marc: |
LEADER 01601naa a2200217 a 4500 001 1711664 005 2022-09-29 008 2009 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091$2DOI 100 1 $aMAIA, L. C. da 245 $aTandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families.$h[electronic resource] 260 $c2009 520 $aTandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. 653 $aComparative genomics 653 $aEST 653 $aSSR 700 1 $aSOUZA, V. Q. de 700 1 $aKOPP, M. M. 700 1 $aCARVALHO, F. I. F. de F 700 1 $aOLIVEIRA, A. C. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 32, n. 4, p. 822-833, 2009.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Volume |
Status |
URL |
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Registros recuperados : 138 | |
62. | | SILVA, G. O. da; PEREIRA, A. da S.; SOUZA, V. Q. de; CARVALHO, F. I. F. de; FRITSCHE NETO, R. Seleção para caracteres componentes de aparência e rendimento de tubérculo em plântulas de batata. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 26, n. 3, p. 325-329, jul./set. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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63. | | SILVA, G. O. da; PEREIRA, A. da S.; SOUZA, V. Q. de; CARVALHO, F. I. F. de; FRITSCHE NETO. R. Seleção para caracteres componentes de aparência e rendimento de tubérculos em plântulas de batata. Horticultura Brasileira, Brasilia, DF, v. 26, n. 3, p. 325-329, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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64. | | CARVAJAL, C. Q.; CARVALHO, F. I. F. de; BARBIERI, R. L.; KOHLI, M. M.; FEDERIZZI, L. C.; PACHECO, M. T. Seleção para período de florescimento e estatura de planta e seu efeito no rendimento de grãos de trigo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 32, n. 11, p. 1167-76, nov. 1997. Título em inglês: Selection to heading date and plant height and the effect over wheat grain yield.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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65. | | SERENO, M. J. C. de M.; BONDANESE-ZANETTINI, M. H.; CARVALHO, F. I. F. de; BARBOSA NETO, J. F. Variabilidade genética em Avena sativa, Avena sterilis e em seus híbridos, por meio de avaliações agronômicas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 33, n. 10, p. 1601-7, out. 1998. Título em inglês: Genetic variability a Vena sativa, Avena sterilis and in their hybrids through the agronomic evaluation.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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66. | | BERTAN, I.; VIEIRA, E. A.; CARVALHO, F. I. F. de; OLIVEIRA, A. C. de; SCHEEREN, P. L.; OLIVO, F. Variabilidade genética em trigo aferida por meio da distância genealógica e morfológica. Scientia Agraria, Curitiba, v. 8, n. 1, p. 111-118, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - C |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Trigo. |
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67. | | MAIA, L. C. da; SOUZA, V. Q. de; KOPP, M. M.; CARVALHO, F. I. F. de F; OLIVEIRA, A. C. Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 4, p. 822-833, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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69. | | DORNELLES, A. L. C.; CARVALHO, F. I. F. de; FEDERIZZI, L. C.; SERENO, M. J. C. de M.; AMARAL, A.; MITTELMANN, A. Avaliação simultânea para tolerância ao alumínio e sensibilidade ao ácido giberélico em trigo hexaplóide. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 32, n. 9, p. 893-896, set. 1997. Título em inglês: Simultaneous test to aluminum tolerance and giberelic acid sensibility in hexaploid wheat.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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70. | | FLOSS, E. L.; ALMEIDA, J.; PACHECO, M. T.; CARVALHO, F. I. F. de; GODOY, R.; MATZEMBACKER, R. G.; OLIVEIRA, J. C.; RAMOS, L. R. M. Análise conjunta de ensaio brasileiro de cultivares recomendados de aveia, 1998. In: REUNIAO DA COMISSAO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 19., 1999, Porto Alegre, RS. Anais... Porto Alegre: UFRGS, 1999. p.157-160.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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71. | | FLOSS, E. L.; CARVALHO, F. I. F. DE; SILVA, A. C. DA; ALMEIDA, J. L.; OLIVEIRA, J. C.; GODOY, R.; OLIVEIRA, P. H.; MOLIN, R.; GARRAFA, M. Análise conjunta do ensaio brasileiro de cultivares recomendados de aveia branca, 2005. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 26., 2006, Guarapuava, PR. Resultados experimentais... Guarapuava: Fundação Agrária de Pesquisa Agropecuária, 2006. p. 353-360.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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72. | | FLOSS, E. L.; ALMEITA, J.; PACHECO, M.; CARVALHO, F. I. F. de; GODOY, R.; OLIVEIRA, J. C.; RAMOS, L. R. M. Análise conjunta do ensaio brasileiro de linhagens de aveia, 1998. In: REUNIAO DA COMISSAO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 19., 1999, Porto Alegre, RS. Anais... Porto Alegre: UFRGS, 1999. p.153-156.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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73. | | FLOSS, E. L.; SILVA, A. C. da; FEDERIZZI, L. C.; CARVALHO, F. I. F. de; ALMEIDA, M. L.; ASSMAN, I.; GODOY, R.; OLIVIERA, J. C. Análise conjunta do ensaio brasileiro de linhagens de aveia, 2000. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 21., 2001, Lages, SC. Resultados experimentais... Lages: UDESC, 2001. p. 308-312.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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74. | | FLOSS, E. L.; FEDERIZZI, L. C.; CARVALHO, F. I. F. DE; ASSMANN, I.; ALMEIDA, J. L.; SILVA, A. C. DA; OLIVEIRA, J. C.; GODOY, R. Análise conjunta do ensaio brasileiro de linhagens de aveia, 2001. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 22., 2002, Passo Fundo, RS. Resultados experimentais... Passo Fundo: UPF, 2002. p.169-178.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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75. | | FLOSS, E. L.; FEDERIZZI, L. C.; CARVALHO, F. I. F. de; ASSMANN, I.; ALMEIDA, J. L.; SILVA, A. C. da; OLIVEIRA, J. C.; GODOY, R. Análise conjunta do ensaio brasileiro de linhagens de aveia, 2002. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 23., 2003, Gramado, RS. Anais... Gramado: UFRGS, 2003. 1 CD-ROMTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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76. | | FLOSS, E. L.; FEDERIZZI, L. C.; CARVALHO, F. I. F. DE; OLIVEIRA, P. H. DE; ALMEIDA, J. L.; SILVA, A. C. DA; OLIVEIRA, J. C.; GODOY, R. Análise conjunta do ensaio brasileiro de linhagens de aveia branca, 2003. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 24., 2004, Pelotas. Resultados experimentais... Pelotas: UFPelotas, 2004. p.430-442.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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77. | | BARBIERI, R. L.; CARVALHO, F. I. F. de; BARBOSA NETO, J. F.; CAETANO, V. da R.; MARCHIORO, V. S.; AZEVEDO, R. de; LONRECETTI, C. Análise dialélica para tolerância ao vírus-do-nanismo-amarelo-da-cevada em cultivares brasileiras de trigo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 1, p. 131-135, jan. 2001 Título em inglês: Diallel analysis for tolerance to barley yellow dwarf virus in Brazilian cultivars of bread wheat.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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78. | | MAIA, L. C. de; PALMIERI, D. A.; KOPP, M. M.; MAGALHÃES JÚNIOR, A. M.; CARVALHO, F. I. F. de; OLIVEIRA, A. C. de. Banco de dados de primers derivados de locos microssatélites de genoma estrutural do arroz (Oryza sativa L.) In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 5.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 27., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2007. v. 1, p. 264-266Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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79. | | VASCONCELLOS, N. J. S. de; CARVALHO, F. I. F. de; CAETANO, V. da R.; OLIVEIRA, A. C. de; SILVA, S. D. dos A.; SCHEEREN, P.; MARCHIORO, V. Bases genéticas de fatores condicionantes da qualidade de panificação do trigo. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGA VEGETAL, 2., 1997, Gramado. Programa e resumos... [S.l.]: REDBIO-Sul-região Brasil, [1997]. p. 220Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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80. | | KOPP, M. M.; LUZ, V. K. da; MAIA, L. C. da; COIMBRA, J. L. M.; SOUSA, R. O. de; CARVALHO, F. I. F. de; OLIVEIRA, A. C. Avaliação de genótipos de arroz sob efeito do ácido butírico. Acta Botanica Brasilica, v. 24, n. 2, p. 578-584, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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Registros recuperados : 138 | |
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