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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
15/10/2020 |
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Data da última atualização: |
06/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BERNARDINO, K. C.; MENEZES, C. B. de; SOUSA, S. M. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, P. C. S.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; HUFNAGEL, B.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de. |
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Afiliação: |
Karine C. Bernardino, Universidade Federal de Viçosa; CICERO BESERRA DE MENEZES, CNPMS; SYLVIA MORAIS DE SOUSA TINOCO, CNPMS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; Pedro C. S. Carneiro, Universidade Federal de Viçosa; ROBERT EUGENE SCHAFFERT, CNPMS; Leon V. Kochian, University of Saskatchewan; Barbara Hufnagel, University of Montpellier; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS. |
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Título: |
Association mapping and genomic selection for sorghum adaptation to tropical soils of Brazil in a sorghum multiparental random mating population. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 134, p. 295-312, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00122-020-03697-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Tropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the genetic architecture of grain yield. By overlapping consensus QTL regions, we mapped two candidate P efciency genes to a ~5 Mb region on chromosomes 6 (ALMT) and 9 (PHO2). Remarkably, we fnd that only 200 progeny genotyped with~45,000 markers in BRP13R can lead to GWAS-based positional cloning of naturally rare, subpopulation-specifc alleles, such as for SbMATE-conditioned Al tolerance. Genomic selection was found to be useful in such MP-RMP, particularly if markers in LD with major genes are ftted as fxed efects into GBLUP models accommodating dominance. Shifts in allele frequencies in progeny contrasting for grain yield indicated that intermediate to minor-efect genes on P efciency, such as SbPSTOL1 genes, can be employed in pre-breeding via allele mining in the base population. Therefore, MP-RMPs such as BRP13R emerge as multipurpose resources for efcient gene discovery and deployment for breeding sorghum cultivars adapted to tropical soils. MenosTropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the genetic architecture of grain yield. By overlapping consensus QTL regions, we mapped two candidate P efciency genes to a ~5 Mb region on chromosomes 6 (ALMT) and 9 (PHO2). Remarkably, we fnd that only 200 progeny genotyped with~45,000 markers in BRP13R can lead to GWAS-based positional cloning of naturally rare, subpopulation-specifc alleles, such as for SbMATE-conditioned Al tolerance. Genomic selection was found to be useful in such MP-RMP, particularly if markers in LD with major genes are ftted as fxed efects into GBLUP models accommodating dominance. Shifts in allele frequencies in progeny contrasting for grain yield indicated that intermediate to minor-efect genes on P efciency, such as SbPSTOL1 genes, can be employed in pr... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Gene; Genética Vegetal; Melhoramento Genético Vegetal; Sorgo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/223127/1/Association-mapping.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
12/08/2010 |
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Data da última atualização: |
04/06/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 2 |
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Autoria: |
COSTA, R. V. da; SILVA, D. D. da; COTA, L. V.; PARREIRA, D. F.; FERREIRA, A. da S.; CASELA, C. R. |
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Afiliação: |
RODRIGO VERAS DA COSTA, CNPMS; DAGMA DIONISIA DA SILVA, BOLSISTA CNPq; LUCIANO VIANA COTA, CNPMS; DOUGLAS FERREIRA PARREIRA, BOLSISTA CAPES; ALEXANDRE DA SILVA FERREIRA, PESQUISADOR APOSENTADO CNPMS; CARLOS ROBERTO CASELA, PESQUISADOR APOSENTADO CNPMS. |
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Título: |
Incidência de Colletotrichum graminicola em colmos de genótipos de milho. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 36, n. 2, p. 122-128, 2010. |
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DOI: |
10.1590/S0100-54052010000200003 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A podridão do colmo, causada por Colletotrichum graminicola, é uma das mais severas doenças da cultura do milho no Brasil, principalmente se ocorrer após a fase de florescimento, por causar perdas significativas na produtividade. A melhor alternativa para o controle da doença é a utilização de cultivares geneticamente resistentes. O objetivo deste trabalho foi avaliar a incidência da podridão de colmo em híbridos comerciais de milho, tendo em vista a pouca disponibilidade de informações que permitam a utilização da resistência genética como estratégia para o controle desta doença. Foram avaliados 18 híbridos comerciais de milho, em três ensaios conduzidos nos anos de 2005, 2006 e 2007 na área experimental da Embrapa Milho e Sorgo, sob condições de inóculo natural. Em cada parcela foram coletados fragmentos do colmo de três plantas, sendo: o segundo entrenó acima do solo, o entrenó de inserção da espiga e o entrenó localizado abaixo do pendão. Quatro fragmentos de cada parte foram desinfestados e transferidos para placas de Petri contendo meio de farinha de aveia - ágar (FAA). As placas foram mantidas em câmara de incubação sob luz fluorescente contínua à temperatura de 25°C, seguindo-se a identificação e quantificação do patógeno após três a quatro dias de incubação. As menores incídências (abaixo de 30%) foram observadas nos híbridos BR201 e BR206 e a maior incidência (acima de 60%) detectada no híbrido BRS 1010. O patógeno foi detectado em todos os segmentos do colmo analisados, predominando, entretanto, no terço médio superior para a maioria dos híbridos avaliados. Apesar da variação observada entre os genótipos quanto à incidência da antracnose no colmo, nenhum híbrido pôde ser considerado como de altamente resistente ao patógeno. MenosA podridão do colmo, causada por Colletotrichum graminicola, é uma das mais severas doenças da cultura do milho no Brasil, principalmente se ocorrer após a fase de florescimento, por causar perdas significativas na produtividade. A melhor alternativa para o controle da doença é a utilização de cultivares geneticamente resistentes. O objetivo deste trabalho foi avaliar a incidência da podridão de colmo em híbridos comerciais de milho, tendo em vista a pouca disponibilidade de informações que permitam a utilização da resistência genética como estratégia para o controle desta doença. Foram avaliados 18 híbridos comerciais de milho, em três ensaios conduzidos nos anos de 2005, 2006 e 2007 na área experimental da Embrapa Milho e Sorgo, sob condições de inóculo natural. Em cada parcela foram coletados fragmentos do colmo de três plantas, sendo: o segundo entrenó acima do solo, o entrenó de inserção da espiga e o entrenó localizado abaixo do pendão. Quatro fragmentos de cada parte foram desinfestados e transferidos para placas de Petri contendo meio de farinha de aveia - ágar (FAA). As placas foram mantidas em câmara de incubação sob luz fluorescente contínua à temperatura de 25°C, seguindo-se a identificação e quantificação do patógeno após três a quatro dias de incubação. As menores incídências (abaixo de 30%) foram observadas nos híbridos BR201 e BR206 e a maior incidência (acima de 60%) detectada no híbrido BRS 1010. O patógeno foi detectado em todos os segmentos do colmo anali... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Colletotrichum Graminicola; Podridão do Colmo; Zea Mays. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/32735/1/Incidencia-colletotrichum.pdf
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Marc: |
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245 $aIncidência de Colletotrichum graminicola em colmos de genótipos de milho.$h[electronic resource]
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520 $aA podridão do colmo, causada por Colletotrichum graminicola, é uma das mais severas doenças da cultura do milho no Brasil, principalmente se ocorrer após a fase de florescimento, por causar perdas significativas na produtividade. A melhor alternativa para o controle da doença é a utilização de cultivares geneticamente resistentes. O objetivo deste trabalho foi avaliar a incidência da podridão de colmo em híbridos comerciais de milho, tendo em vista a pouca disponibilidade de informações que permitam a utilização da resistência genética como estratégia para o controle desta doença. Foram avaliados 18 híbridos comerciais de milho, em três ensaios conduzidos nos anos de 2005, 2006 e 2007 na área experimental da Embrapa Milho e Sorgo, sob condições de inóculo natural. Em cada parcela foram coletados fragmentos do colmo de três plantas, sendo: o segundo entrenó acima do solo, o entrenó de inserção da espiga e o entrenó localizado abaixo do pendão. Quatro fragmentos de cada parte foram desinfestados e transferidos para placas de Petri contendo meio de farinha de aveia - ágar (FAA). As placas foram mantidas em câmara de incubação sob luz fluorescente contínua à temperatura de 25°C, seguindo-se a identificação e quantificação do patógeno após três a quatro dias de incubação. As menores incídências (abaixo de 30%) foram observadas nos híbridos BR201 e BR206 e a maior incidência (acima de 60%) detectada no híbrido BRS 1010. O patógeno foi detectado em todos os segmentos do colmo analisados, predominando, entretanto, no terço médio superior para a maioria dos híbridos avaliados. Apesar da variação observada entre os genótipos quanto à incidência da antracnose no colmo, nenhum híbrido pôde ser considerado como de altamente resistente ao patógeno.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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