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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
26/01/2016 |
Data da última atualização: |
02/02/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVEIRA, R. D.; ABREU, F. R. M.; MAMIDI, S.; McCLEAN, P. E.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C.; CARNEIRO, N. P.; BRONDANI, C. |
Afiliação: |
NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS. |
Título: |
Expression of drought tolerance genes in tropical upland rice cultivars (Oryza sativa). |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 14, n. 3, p. 8181-8200, 2015. |
DOI: |
10.4238/2015.July.27.6 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Gene expression related to drought response in the leaf tissues of two Brazilian upland cultivars, the drought-tolerant Douradão and the drought-sensitive Primavera, was analyzed. RNA-seq identified 27,618 transcripts in the Douradão cultivar, with 24,090 (87.2%) homologous to the rice database, and 27,221 transcripts in the Primavera cultivar, with 23,663 (86.9%) homologous to the rice database. Gene-expression analysis between control and water-deficient treatments revealed 493 and 1154 differentially expressed genes in Douradão and Primavera cultivars, respectively. Genes exclusively expressed under drought were identified for Douradão, including two genes of particular interest coding for the protein peroxidase precursor, which is involved in three distinct metabolic pathways. Comparisons between the two drought-exposed cultivars revealed 2314 genes were differentially expressed (978 upregulated, 1336 downregulated in Douradão). Six genes distributed across 4 different transcription factor families (bHLH, MYB, NAC, and WRKY) were identified, all of which were upregulated in Douradão compared to Primavera during drought. Most of the genes identified in Douradão activate metabolic pathways responsible for production of secondary metabolites and genes coding for enzymatically active signaling receptors. Quantitative PCR validation showed that most gene expression was in agreement with computational prediction of these transcripts. The transcripts identified here will define molecular markers for identification of Cis-acting elements to search for allelic variants of these genes through analysis of polymorphic SNPs in GenBank accessions of upland rice, aiming to develop cultivars with the best combination of these alleles, resulting in materials with high yield potential in the event of drought during the reproductive phase. MenosGene expression related to drought response in the leaf tissues of two Brazilian upland cultivars, the drought-tolerant Douradão and the drought-sensitive Primavera, was analyzed. RNA-seq identified 27,618 transcripts in the Douradão cultivar, with 24,090 (87.2%) homologous to the rice database, and 27,221 transcripts in the Primavera cultivar, with 23,663 (86.9%) homologous to the rice database. Gene-expression analysis between control and water-deficient treatments revealed 493 and 1154 differentially expressed genes in Douradão and Primavera cultivars, respectively. Genes exclusively expressed under drought were identified for Douradão, including two genes of particular interest coding for the protein peroxidase precursor, which is involved in three distinct metabolic pathways. Comparisons between the two drought-exposed cultivars revealed 2314 genes were differentially expressed (978 upregulated, 1336 downregulated in Douradão). Six genes distributed across 4 different transcription factor families (bHLH, MYB, NAC, and WRKY) were identified, all of which were upregulated in Douradão compared to Primavera during drought. Most of the genes identified in Douradão activate metabolic pathways responsible for production of secondary metabolites and genes coding for enzymatically active signaling receptors. Quantitative PCR validation showed that most gene expression was in agreement with computational prediction of these transcripts. The transcripts identified here will define... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Arroz; Gene; Oryza sativa; Resistência a seca; Variedade. |
Categoria do assunto: |
-- S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/137806/1/Expression-drought.pdf
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Marc: |
LEADER 02671naa a2200277 a 4500 001 2035196 005 2016-02-02 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.4238/2015.July.27.6$2DOI 100 1 $aSILVEIRA, R. D. 245 $aExpression of drought tolerance genes in tropical upland rice cultivars (Oryza sativa).$h[electronic resource] 260 $c2015 520 $aGene expression related to drought response in the leaf tissues of two Brazilian upland cultivars, the drought-tolerant Douradão and the drought-sensitive Primavera, was analyzed. RNA-seq identified 27,618 transcripts in the Douradão cultivar, with 24,090 (87.2%) homologous to the rice database, and 27,221 transcripts in the Primavera cultivar, with 23,663 (86.9%) homologous to the rice database. Gene-expression analysis between control and water-deficient treatments revealed 493 and 1154 differentially expressed genes in Douradão and Primavera cultivars, respectively. Genes exclusively expressed under drought were identified for Douradão, including two genes of particular interest coding for the protein peroxidase precursor, which is involved in three distinct metabolic pathways. Comparisons between the two drought-exposed cultivars revealed 2314 genes were differentially expressed (978 upregulated, 1336 downregulated in Douradão). Six genes distributed across 4 different transcription factor families (bHLH, MYB, NAC, and WRKY) were identified, all of which were upregulated in Douradão compared to Primavera during drought. Most of the genes identified in Douradão activate metabolic pathways responsible for production of secondary metabolites and genes coding for enzymatically active signaling receptors. Quantitative PCR validation showed that most gene expression was in agreement with computational prediction of these transcripts. The transcripts identified here will define molecular markers for identification of Cis-acting elements to search for allelic variants of these genes through analysis of polymorphic SNPs in GenBank accessions of upland rice, aiming to develop cultivars with the best combination of these alleles, resulting in materials with high yield potential in the event of drought during the reproductive phase. 650 $aArroz 650 $aGene 650 $aOryza sativa 650 $aResistência a seca 650 $aVariedade 700 1 $aABREU, F. R. M. 700 1 $aMAMIDI, S. 700 1 $aMcCLEAN, P. E. 700 1 $aVIANELLO, R. P. 700 1 $aLANNA, A. C. 700 1 $aCARNEIRO, N. P. 700 1 $aBRONDANI, C. 773 $tGenetics and Molecular Research, Ribeirão Preto$gv. 14, n. 3, p. 8181-8200, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registros recuperados : 239 | |
101. | | SILVA, P. G.; CARNEIRO, A. A.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; CANIATO, F. F.; PAULA, U. L.; CARNEIRO, N. P. Caracterização molecular de microrganismos mineralizadores de fosfato orgânico isolados da rizosfera de milho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 24.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBACTÉRIAS, 12.; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURA, 2.; ENCONTRO DE ENSINO EM MICROBIOLOGIA, 4., 2007, Brasília, DF. Anais. [São Paulo]: SBM, 2007. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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102. | | HORTA, A. C. B. D'A.; LOPES, S. da S.; OLIVEIRA, R. P. de; ALVES, M. de C.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A. Caracterização molecular do promotor ubiquitin-conjugating enzyme (UCE) de soja em plantas transgênicas de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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103. | | LANA, U. G. P.; GOMES, E. A.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, N. P.; JARDIM, S. N.; ALVES, V. M. C.; PURCINO, A. A. C. Caracterização de genes especificamente induzidos por alumínio em ápices de raízes de braquiaria. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 25.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 1., 2004, Cuiabá, MT. Da agricultura familiar ao agronegócio: tecnologia, competitividade e sustentabilidade: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Cuiabá: Empaer, 2004. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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105. | | MOREIRA, R. O.; ALVES, P. A.; BARROS, B. de A.; ANDRADE, E. C. de; VALICENTE, F. H.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P. Comportamento de dsRNA GFP em plantas de milho visando controle de pragas pela tecnologia do RNAi. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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106. | | CASTANHEIRA, A. L. M.; SOUZA, I. R. P. de; OLIVEIRA, E. de; CARNEIRO, N. P.; NETTO, D. A. M.; PAIVA, E. Diversidade genética de isolados geográficos de Spiroplasma kunkelii. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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107. | | MAGALHAES, P. C.; SIMEONE, M. L. F.; CARNEIRO, N. P.; GOMES JUNIOR, C. C.; SOUZA, T. C. de; OLIVEIRA, A. C. de; FONSECA, T. M. da. Efeitos de diferentes níveis de estresse hídrico na caracterização ecofisiológica de genótipos de sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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108. | | PEDROSO, J. C.; NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; CARNEIRO, N. P.; MARTINS, P. K.; BRETON, M. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E. Differential gene expression in nematode resistant soybean genotypes. Nematology, Boston, v. 4, n. 2, p. 235, 2002. Presented in Fourth International Congress of Nematology. Programme and abstracts. 8-13 June 2002, Tenbel, La Galletas, Arona, Tenerife, Canary Islands, Spain.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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109. | | OLIVEIRA, K. E. S. de; VALINHAS, M. C.; OLIVEIRA, R. P. de; SOUSA, S. M. de; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P. Edição dos genes ZmBahd01 e ZmBahd05 em milho via CRISPR/Cas9 In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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110. | | SIMEONE, M. L. F.; MAGALHAES, P. C.; CARNEIRO, N. P.; GOMES JÚNIOR, C. C.; AVILA, R. G.; SOUZA, T. C. de; OLIVEIRA, A. C. de. Ecophysiological characterization of sorghum genotypes submitted to water deficit tolerance. In: GOES, R. J. (org.). Cadeias produtivas e novas tecnologias: aspectos econômicos, ecológicos e sociais. Ponta Grossa: Atena, 2021. p. 69-83.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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111. | | COELHO, G. T. C. P.; REZENDE, R. K. S.; TORGA, P. P.; PETRILLO, C. P.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P.; PINHO, R. G. V.; PAIVA, R. Embriogênese somática de linhagens tropicais de milho (Zea mays) em diferentes concentrações de 2,4-D. Horticultura Brasileira, v. 23, n. 2, p. 600, ago. 2005. Suplemento. Edição dos resumos do 45º Congresso Brasileiro de Olericultura; 15º Congresso Brasileiro de Floricultura e Plantas Ornamentais; 2º Congresso Brasileiro de Cultura de Tecidos de Plantas realizado em Fortaleza.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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113. | | VASCONCELOS, V. D. B.; MAGALHAES, P. C.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARAES, C. T.; SOUZA, E. T. S.; SILVA, V. L.; DEUS, F. G.; CARNEIRO, N. P. DREB gene family in drought tolerant maize lines. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GENOMICS OF PLANT GENETIC RESOURCES, 2., 2010, Bologna, Itália. Final program and abstracts. Bologna: University of Bologna, 2010. p. 111.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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114. | | COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F. da; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. Diversity of Paenibacillus spp. in the rhizosphere of four sorghum (Sorghum bicolor) cultivars sown with two contrasting levels of nitrogen fertilizer assessed by rpoB-Based PCR-DGGE and sequencing analysis. Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 17, n. 5, p. 753-760, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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115. | | VERDOLIN, A. L. M.; BARROS, B. de A.; ALVES, M. de C.; NODA, R. W.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P. Avaliação da tecnologia do RNA interferente (RNAi) para controle de Rhopalosiphum maidis e Schizaphis graminum em milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016. p. 18-22.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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116. | | OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; GOMES, E. A.; MARRIEL, I. E.; LANA, U. G. de P.; CARNEIRO, N. P.; GUIMARAES, C. T.; SCHAFFERT, R. E.; ALVES, V. M. C. Microrganismos solubilizadores de fosfato isolados da rizosfera de genótipos de milho em plantio direto e convencional. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 21 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 04).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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117. | | SOUZA, R. A. V. de; SILVA, E. T. S.; ALVES, M. de C.; NAIE, A.; CARNEIRO, N. P.; BOREM, A.; CARNEIRO, A. A. Transformação genética de embriões imaturos de milho tropical via Agrobacterium tumefaciens. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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119. | | POSSA, K. F.; CARNEIRO, M. H.; PEREIRA, M. F.; LANA, U. G. D. P.; CARNEIRO, N. P.; MAGALHAES, J. V. D.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A. Transformação genética de milho com o gene de tolerância ao alumínio SbMATE isolado de sorgo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 88.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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120. | | OLIVEIRA, K. E. de; ALVES, M. de C.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P.; VALICENTE, F. H.; CARNEIRO, A. A. Transformação genética de milho Hill com o gene crycnpms222 de Bacillus thuringiensis. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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