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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
09/02/2023 |
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Data da última atualização: |
10/02/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AFONSO, J.; SHIM, W. J.; BODEN, M.; FORTES, M. R. S.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; ROCHA, M. I. P.; CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. A.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
JULIANA AFONSO; WOO JUN SHIM, THE UNIVERSITY OF QUEENSLAND; MIKAEL BODEN, THE UNIVERSITY OF QUEENSLAND; MARINA RUFINO SALINAS FORTES, THE UNIVERSITY OF QUEENSLAND; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, AUBURN UNIVERSITY; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, UNIVERSITY OF WASHINGTON; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; JENNIFER JESSICA BRUSCADIN, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; CAIO FERNANDO GROMBONI, INSTITUTO FEDERAL DE EDUCAÇÃO, CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA BAHIA; ANA RITA ARAUJO NOGUEIRA; GERSON BARRETO MOURÃO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Repressive epigenetic mechanisms, such as the H3K27me3 histone modification, were predicted to affect muscle gene expression and its mineral content in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Biochemistry and Biophysics Reports, v. 33, 101420, Mar. 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.bbrep.2023.101420 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Epigenetic repression has been linked to the regulation of different cell states. In this study, we focus on the influence of this repression, mainly by H3K27me3, over gene expression in muscle cells, which may affect mineral content, a phenotype that is relevant to muscle function and beef quality. Based on the inverse relationship between H3K27me3 and gene expression (i.e., epigenetic repression) and on contrasting sample groups, we computationally predicted regulatory genes that affect muscle mineral content. To this end, we applied the TRIAGE predictive method followed by a rank product analysis. This methodology can predict regulatory genes that might be affected by repressive epigenetic regulation related to mineral concentration. Annotation of orthologous genes, between human and bovine, enabled our investigation of gene expression in the Longissimus thoracis muscle of Bos indicus cattle. The animals under study had a contrasting mineral content in their muscle cells. We identified candidate regulatory genes influenced by repressive epigenetic mechanisms, linking histone modification to mineral content in beef samples. The discovered candidate genes take part in multiple biological pathways, i.e., impulse transmission, cell signalling, immunological, and developmental pathways. Some of these genes were previously associated with mineral content or regulatory mechanisms. Our findings indicate that epigenetic repression can partially explain the gene expression profiles observed in muscle samples with contrasting mineral content through the candidate regulators here identified. MenosAbstract. Epigenetic repression has been linked to the regulation of different cell states. In this study, we focus on the influence of this repression, mainly by H3K27me3, over gene expression in muscle cells, which may affect mineral content, a phenotype that is relevant to muscle function and beef quality. Based on the inverse relationship between H3K27me3 and gene expression (i.e., epigenetic repression) and on contrasting sample groups, we computationally predicted regulatory genes that affect muscle mineral content. To this end, we applied the TRIAGE predictive method followed by a rank product analysis. This methodology can predict regulatory genes that might be affected by repressive epigenetic regulation related to mineral concentration. Annotation of orthologous genes, between human and bovine, enabled our investigation of gene expression in the Longissimus thoracis muscle of Bos indicus cattle. The animals under study had a contrasting mineral content in their muscle cells. We identified candidate regulatory genes influenced by repressive epigenetic mechanisms, linking histone modification to mineral content in beef samples. The discovered candidate genes take part in multiple biological pathways, i.e., impulse transmission, cell signalling, immunological, and developmental pathways. Some of these genes were previously associated with mineral content or regulatory mechanisms. Our findings indicate that epigenetic repression can partially explain the gene expressio... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Epigenetic regulation; Expressão gênica; Gene repression; H3K27me3. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de Corte; Gado Nelore; Mineral. |
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Thesaurus Nal: |
Epigenetics; Gene expression; Minerals. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151623/1/AP-Repressive-epigenetic-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Registros recuperados : 28 | |
| 1. |  | ROCHA, G. C.; PALMA, M. N. N.; DETMANN, E.; VALADARES FILHO, S. de C. Evaluation of acid digestion techniques to estimate chromium contents in cattle feces. PESQUISA AGROPECUÁRIA BRASILEIRA, Brasília, DF, v. 50, n. 1, p. 92-95, jan., 2015. Notas Científicas.
Título em português: Avaliação de técnicas de digestão ácida para estimar teores de cromo em fezes de bovinos.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 2. | | BIANCHIN, I.; KOLLER, W. W.; ALVES, R. G. de O.; DETMANN, E. Efeito da mosca-dos-chifres, Haematobia irritans (L.) (Diptera: Muscidae), no ganho de peso de bovinos Nelore. Ciência Rural, Santa Maria, RS, v. 34, n. 3, p. 885-890, maio/jun. 2004. Título em inglês: Effects of the horn fly, Haematobia irritans (L.) (Diptera: Muscidae)in the weight gain on Nellore cattle.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | CABRAL, L. da S.; VALADARES FILHO, S. de C.; ZERVOUDAKIS, J. T.; SOUZA, A. L. de; DETMANN, E. Degradabilidade in situ da matéria seca, da proteína bruta e da fibra de alguns alimentos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 8, p. 777-781, ago. 2005 Título em inglês: In situ degradability of dry matter, crude protein and fiber of some feeds.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; VALADARES FILHO, S. de C.; DETMANN, E.; CAVALI, J.; SALES, M. F. L. Exigência energética para tourinhos mestiços Nelore/Holandês, em pasto de Brachiaria decumbens Stapf. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 6. | | PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; VALADARES FILHO, S. de C.; DETMANN, E.; CAVALI, J.; SALES, M. F. L. Exigência proteica para tourinhos mestiços Nelore/Holandês, em pasto de Brachiaria decumbens. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 7. | | SALES, M. F. L.; PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; VALADARES FILHO, S. de C.; DETMANN, E.; CAVALI, J. Exigências de macrominerais para mantença e ganho de peso, para tourinhos mestiços suplementados sob pastejo. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 8. | | SILVA, A. L.; MARCONDES, M. I.; DETMANN, E.; MACHADO, F. S.; VALADARES FILHO, S. C.; TRECE, A. S.; DIJKSTRA, J. Effects of raw milk and starter feed on intake and body composition of Holstein × Gyr male calves up to 64 days of age. Journal of Dairy Science, v. 98, n. 4, p. 2641-2649, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | DETMANN, E.; FRANCO, M. de O.; GOMES, D. I.; BARBOSA, M. M.; VALADARES FILHO, S. de C. Protein contamination on klason lignin contents in tropical grasses and legumes. PESQUISA AGROPECUÁRIA BRASILEIRA, Brasília, DF, v. 49, n. 12, p. 994-997, dez., 2014. Notas científicas.
Título em português: Contaminação proteica sobre os teores de lignina Klason em gramíneas e leguminosas tropicais.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | CECON, P. R.; SILVA, F. F. e; FERREIRA, A.; FERRÃO, R. G.; CARNEIRO, A. P. S.; DETMANN, E.; FARIA, P. N.; MORAIS, T. S. da S. Análise de medidas repetidas na avaliação de clones de café 'Conilon'. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 9, p. 1171-1176, set. 2008. Título em inglês: Repeated measure analysis in the clonal evaluation in 'Conilon' coffee.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | RODRIGUES, C. S.; NASCIMENTO JÚNIOR, D. do; DETMANN, E.; SILVA, S. C. da; SOUSA, B. M. de L.; SILVEIRA, M. C. T. da. Grupos funcionais de gramíneas forrageiras tropicais. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 41, n. 6, p. 1385-1393, jun. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 13. | | PEREIRA, L. G. R.; LAGE, J. F.; PAULINO, P. V. R.; VALADARES FILHO, S. de C.; OLIVEIRA, A. S. de; DETMANN, E. Consumo e desempenho de cordeiros alimentados com glicerina bruta. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2010 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 14. | | RESENDE, L. H. G. da S. de; ALBERTINI, T. Z.; DETMANN, E.; TOMICH, T. R.; FRANCO, G. L.; LEMPP, B.; MORAIS, M. da G. Consumo e digestibilidade do feno de capim-braquiária em bovinos de corte sob suplementação com mistura contendo sulfato de amônio, caseína e uréia. Revista Brasileira de Zootecnia, v.37, n.4, p. 717-723, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 15. | | PAULINO, P. V. R.; LAGE, J. F.; PEREIRA, L. G. R.; OLIVEIRA, A. S. de; VALADARES FILHO, S. de C.; DETMANN, E. Avaliação econômica da dieta de cordeiros alimentados com glicerina bruta na fase de terminação. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2010. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 16. | | REIS, S. F.; PAULINO, P. V. R.; MEDEIROS, S. R. de; VALADARES FILHO, S. C.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; DETMANN, E. Eficiência alimentar, exigências nutricionais e qualidade da carne de novilhas de diferentes grupos genéticos. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 17. | | SALES, M. F. L.; PAULINO, M. F.; VALADARES FILHO, S. de C.; FIGUEIREDO, D. M. de; PORTO, M. O.; DETMANN, E. Supplementation levels for growing beef cattle grazing in the dry-rainy transition season. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 40, n. 4, p. 904-911, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 18. | | SILVA, A. L.; MARCONDES, M. I.; DETMANN, E.; CAMPOS, M. M.; MACHADO, F. S.; VALADARES FILHO, S. C.; CASTRO, M. M. D.; DIJKSTRA, J. Determination of energy and protein requirements for crossbred Holstein × Gyr preweaned dairy calves. Journal of Dairy Science, v. 100, n. 2, p. 1170-1178, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 19. | | HENRIQUES, L. T.; SILVA, J. F. C. da; VASQUEZ, H. M.; ARAUJO, G. G. L. de; CECON, P. R.; DETMANN, E.; BARROS, E. E. L. Efeito do acipin sobre a degradabilidade e taxa de passagem de silagens de capim-elefante e de milho, em bovinos Holandês x Zebu. Arquivo Brasileiro de Medicina Vetarinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 56, n. 6, p. 695-763, dez. 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 20. | | PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; DETMANN, E.; VALADARES FILHO, S. de C.; SALES, M. F. L.; CAVALI, J.; NASCIMENTO, M, L. do; ACEDO, T. S. Ofertas de suplementos múltiplos para tourinhos Nelore na fase de recria em pastagens durante o período da seca: desempenho produtivo e características nutricionais. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 40, n. 11, p. 2548-2557, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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