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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
18/06/2012 |
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Data da última atualização: |
24/07/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO-GOMES, J.; CARVALHO, J. de F. C.; NASCIMENTO, L. C. do; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; CARAZZOLLE, M. F.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. |
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Afiliação: |
FABIANA APARECIDA RODRIGUES, CNPSo; JULIANA MARCOLINO-GOMES, CNPSo; JOSIRLEI DE FÁTIMA CORRÊA CARVALHO, CARVALHO , J. de F. C.; LEANDRO COSTA DO NASCIMENTO, UNICAMP; NORMAN NEUMAIER, CNPSO; JOSE RENATO BOUCAS FARIAS, CNPSO; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP; FRANCISMAR CORREA MARCELINO GUIMARÃES, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI. |
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Título: |
Subtractive libraries for prospecting differentially expressed genes in the soybean under water deficit. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 304-314, May 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soybean has a wide range of applications in the industry and, due to its crop potential, its improvement is widely desirable. During drought conditions, soybean crops suffer significant losses in productivity. Therefore, understanding the responses of the soybean under this stress is an effective way of targeting crop improvement techniques. In this study, we employed the Suppressive Subtractive Hybridization (SSH) technique to investigate differentially expressed genes under water deficit conditions. Embrapa 48 and BR 16 soybean lines, known as drought-tolerant and -sensitive, respectively, were grown hydroponically and subjected to different short-term periods of stress by withholding the nutrient solution. Using this approach, we have identified genes expressed during the early response to water deficit in roots and leaves. These genes were compared among the lines to assess probable differences in the plant transcriptomes. In general, similar biochemical processes were predominant in both cultivars; however, there were more considerable differences between roots and leaves of Embrapa 48. Moreover, we present here a fast, clean and straightforward method to obtain drought-stressed root tissues and a large enriched collection of transcripts expressed by soybean plants under water deficit that can be useful for further studies towards the understanding of plant responses to stress. |
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Thesagro: |
Deficiência hídrica; Estiagem; Gene; Genoma; Relação água-planta; Seca; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Drought; Gene expression; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61091/1/gmb.subtractive.v35n1s.304-314.2012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 42. | | LIMA, R. S.; LOBO, F. P.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; RODRIGUES, E. L. C.; ALVES, A. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FORMIGHIERI, E. F. Elaeis oleifera genome draft: genomics of american oil palm. In: X-MEETING, 2012, Campinas, SP. [Anais?]. Brasilia, DF: CAPES: CNPq, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 43. | | LIMA, R. S.; LOBO, F. P.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; RODRIGUES, E. L. de C.; ALVES, A. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FORMIGHIERI, E. F. Elaeis oleifera genome draft - genomics of american oil palm. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 44. | | RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO-GOMES, J.; CARVALHO, J. de F. C.; NASCIMENTO, L. C. do; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; CARAZZOLLE, M. F.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Subtractive libraries for prospecting differentially expressed genes in the soybean under water deficit. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 304-314, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 46. | | IVAMOTO, S. T.; REIS JÚNIOR, O.; DOMINGUES, D. S.; SANTOS, T. B. dos; OLIVEIRA, F. F. de; POT, D.; LEROY, T.; VIEIRA, L. G. E.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; PEREIRA, L. F. P. Transcriptome Analysis of Leaves, Flowers and Fruits Perisperm of Coffea arabica L. Reveals the Differential Expression of Genes Involved in Raffinose Biosynthesis. PLOS ONE, January 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 54. | | KULCHESKI, F. R.; OLIVEIRA, L. F. V.; MOLINA, L. G.; ALMERÃO, M.; RODRIGUES, F. A.; MARCOLINO, J.; BARBOSA, J. F.; STOLF-MOREIRA, R.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MARGIS, R. Identification of novel soybean microRNAs involved in abiotic and biotic stresses. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 55. | | PASQUALI, G.; BASTOLLA, F. M.; KIRCH, R. P.; PIZZOLI, G.; ROESLER, G. A.; PAZZINI, F.; CARAZZOLLE, M. F.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEREIRA, G. A. G.; CASCARDO, J. C. M.; GRATTAPAGLIA, D. Expressão gênica em Eucalyptus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 508.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 56. | | LOPES, F. R.; JJINGO, D.; SILVA C. R. M. da; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; TEIXEIRA, J. B.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; PEREIRA, L. F. P.; VANZELA, A. L. L.; WANG, L.; JORDAN, I. K.; CARARETO, C. M. A. Transcriptional activity, chromosomal distribution and expression effects of transposable elements in Coffea genomes. Plos One, v, 8, n. 11, e78931, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 57. | | CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; COSTA, P. de B.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; TEODORO, G. S.; ABRAHÃO, A.; LAMBERS, H.; CARAZZOLLE, M. F.; HUNTEMANN, M.; CLUM, A.; FOSTER, B.; FOSTER, B.; ROUX, S.; PALANIAPPAN, K.; VARGHESE, N.; MUKHERJEE, S.; REDDY, T. B. K.; DAUM, C.; COPELAND, A.; CHENM U, M. A.; IVANOVA, N. N.; KYRPIDES, N. C.; PENNACCHIO, C.; ELOE-FADROSH, E. A.; ARRUDA, P.; OLIVEIRA, R. S. Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot. Scientific Data, v. 6, p. 1-11, 2019. Article number: 140.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 58. | | MONDEGO, J. M. C.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; PARIZZI, L. P.; RINCONES, J.; COTOMACCI, C.; CARRARO, D. M.; CUNHA, A. F.; CARRER, H.; VIDAL, R. O.; ESTRELA, R. C.; GARCÍA, O.; THOMAZELLA, D. P. T.; OLIVEIRA, B. V.; PIRES, A. B. L.; RIO, M. C. S.; ARAÚJO, M. R. R.; CASTRO, A. L. B.; GRAMACHO, K. P.; GONÇALVES, M. S.; GÓES NETO, A.; BARBOSA, L. V.; GUILTINAM, M.; BAILEY, B.; MEINHARDT, L. W.; CASCARDO, J. C. M.; PEREIRA, G. A. G. The genome survey of Moniliophthora perniciosa, the causal agent of cacao witches' broom disease, gives insights about novel phytopathogenicity mechanisms. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 59. | | VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; MORAES, A. H. de A.; METHA, A.; OLIVEIRA, A. C. de; LABATE, C. A.; MARINO, C. L.; MONTEIRO-VITORELLO, C. de B.; MONTE, D. C.; GIGLIOTI, E.; KIMURA, E. T.; ROMANO, E.; KURAMAE, E. E.; LEMOS, E. G. M.; ALMEIDA, E. R. P. de; JORGE, E. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, F. R. da; VINECKY, F.; SAWAZAKI, H. E.; DORRY, H. F. A.; CARRER, H.; ABREU, I. N.; BATISTA, J. A. N.; TEIXEIRA, J. B.; KITAJIMA, J. P.; XAVIER, K. G.; LIMA, L. M. de; CAMARGO, L. E. A. de; PEREIRA, L. F. P.; COUTINHO, L. L.; LEMOS, M. V. F.; ROMANO, M. R.; MACHADO, M. A.; COSTA, M. M. do C.; SÁ, M. F. G. de; GOLDMAN, M. H. S.; FERRO, M. I. T.; TINOCO, M. L. P.; OLIVEIRA, M. C.; VAN SLUYS, M-A.; SHIMIZU, M. M.; MALUF, M. P.; EIRA, M. T. S. da; GUERREIRO FILHO, O.; ARRUDA, P.; MAZZAFERA, P.; MARIANI, P. D. S. C.; OLIVEIRA, R. L. B. C. de; HARAKAVA, R.; BALBAO, S. F.; TSAI, S. M.; MAURO, S. M. Z. di; SANTOS, S. N.; SIQUEIRA, W. J.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G. Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource. Brazilian Journal of Plant Physiology, v. 18, n. 1, p. 95-108, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: -- - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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