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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
17/09/2007 |
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Data da última atualização: |
18/02/2008 |
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Autoria: |
AMARAL, P. de P. R.; ALVES, P. C. M.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R. da; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JÚNIOR, M. T. |
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Título: |
Identification and characterization of a Resistence Gene Analog (RGA) from the Caricaceae Dumort family. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 28, n. 3, p. 458-462, dez. 2006. |
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ISSN: |
0100-2945 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases.
Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); V cauliflora C papaya; Papaya. MenosThe majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases.
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Palavras-Chave: |
cauliflora; Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); Papaya. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 56 | |
| 23. |  | ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAMILLO. J.; LEAO, A. P.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Revisiting an Unfinished Business: the Genome Content of Elaeis guineensis, E. oleifera and its Inter-specific Hybrid. In: INTERNATIONAL PLANT AND ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego, USA. Anais... Wuerselen: Lemna Tec GmbH, 2012. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 24. | | ARAÚJO, A. E.; MAFFIA, L. A.; MIZUBUTI, E. S. G.; ALFENAS, A. C.; CAPDEVILLE, G. de; GROSSI, J. A. S. Survival of Botrytis cinerea as Mycelium in rose crop debris and as Sclerotia in soil. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 30, n. 5, p. 516-521, 2005.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 25. | | MORAIS, P. B.; CAPDEVILLE, G. de; FARIAS, M. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FALCÃO, R.; LEAO, A. P. Estudo do desenvolvimento meiótico de cromossomos em microsporócitos coletados de inflorencências de Elaeis oleifera subamostra coari. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 118-120| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 26. | | TAGLIARI, M.; RIBEIRO, Z. M. de A.; GOMES, A. C. M. M.; CAPDEVILLE, G. de; CASTRO, M. E. B. de. Identificação morfológica de um isolado viral patogênico a traça-das-crucíferas (Plutella xylostella l.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. CD-ROM| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 27. | | TAGLIARI, M.; RIBEIRO, Z. M. de A.; GOMES, A. C. M. M.; CAPDEVILLE, G. de; CASTRO, M. E. B. de. Identificação e análise molecular de um isolado viral patogênico à lagarta Plutella xylostella. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 075. p. 114| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 28. | | DÍAZ-TRUJILLO, C.; FORTES, C. F.; CAPDEVILLE, G. de; JALINK, H.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J. A reliable routine assay for black leaf streak disease of bananas caused by Mycosphaerella fijiensis. In: EUROPEAN CONFERENCE ON FUNGAL GENETICS, 9., 2008, Edinburgh. Meeting abstracts... Edinburgh: University of Edinburgh, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 29. | | FALCAO, R.; REGO, T. F. C.; ARAUJO, A. C. G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.; CAPDEVILLE, G. de. Hibridização in situ por fluorescência em espécie cultivada de Musa. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 14., 2009, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2009. Resumo 014. p. 48| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 30. | | CARVALHO, S. S.; AULER, A. C. V.; ÁVILA, Z. R.; FALCÃO, R.; CAPDEVILLE, G. de; MELLO, S. C. M. Parasitismo de Sclerotinia sclerotiorum E Sclerotium rolfsii por Trichoderma spp. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 9., 2004, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2004. p. 143.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 31. | | SOUZA JUNIOR, M. T.; CAPDEVILLE, G. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMILLO, J.; ALVES, A. A.; LEAO, A. P. Whole Genome Sequencing of the E. oleifera South-American Wild Oil Palm. In: INTERNATIONAL PLANT AND ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego, USA. Anais... Wuerselen: Lemna Tec GmbH, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 32. | | VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FARIAS. P. de F.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Avaliação da fragmentação do DNA genômico de Elaeis guineensis Jacq e Elaeis oleífera (Kunth) Corté por meio de ondas sonoras de alta frequência e autoclavagem. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 34. | | SOUZA JUNIOR, M. T.; CAPDEVILLE, G. de; ONOYAMA, M. M.; SOUZA, D. T. de; SANTOS, G. S.; ALMEIDA, J. R. M. de; LIMA, R. S.; GAMBETTA, R. Biodiesel e bioquerosene: o papel da Embrapa Agroenergia. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2017. 34 p. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 21).| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 35. | | FARIAS, M. P.; VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Determinação de estádios meióticos em elaeis oleifera (kunth) cortés. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 37. | | NUNES, A. C. S.; VIANNA, G. R.; CUNEO, F.; AMAYA-FARFÁN, J.; CAPDEVILLE, G. de; RECH, E. L.; ARAGÃO, F. J. L. RNAi-mediated silencing of the myo-inositol-1-phosphate synthase gene (GmMIPS1) in transgenic soybean inhibited seed development and reduced phytate content. Planta, v. 224, p. 125-132, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: -- - A |
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| 38. | | LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P.; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Estabelecimento de curva de melting para elaeis guineenses jacq. e elaeis oleífera (kunth) cortés. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 39. | | VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FARIAS, M. P.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Estabelecimento de um protocolo eficiente para extração de rna a partir de folhas jovens de elaeis guineensis jacq. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 40. | | DIAS, B. B. A.; CUNHA, W. G.; MORAIS, L. S.; VIANNA, G. R.; RECH, E. L.; CAPDEVILLE, G. de; ARAGÃO, F. J. L. Expression of an oxalate decarboxylase gene from Flammulina sp. in transgenic lettuce (Lactuca sativa) plants and resistance to Sclerotinia sclerotiorum. Plant Pathology, v. 55, p. 187-193, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: -- - A |
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