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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre; Embrapa Gado de Corte. |
Data corrente: |
05/10/2011 |
Data da última atualização: |
06/07/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOUSA, A. C. B.; GODOY, R.; SFORÇA, D. A.; CAMPOS, T. de; ZUCCHI, M. I.; JANK, L.; SOUZA, A. P. de. |
Afiliação: |
Adna Cristina Barbosa de Sousa, UNICAMP; RODOLFO GODOY, CPPSE; Danilo Augusto Sforça, UNICAMP; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC; Maria Imaculada Zucchi, IAC; LIANA JANK, CNPGC; Anete Pereira de Souza, UNICAMP. |
Título: |
Genetic diversity analysis among pigeonpea genotypes adapted to South American regions based on microsatellite markers. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, Piracicaba, v. 68, n. 4, p. 431-439, July/Aug. 2011. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The pigeonpea [Cajanus cajan (L) Millspaugh] is one of the most important perennial legume crops utilized in the food, fodder, soil conservation, crop-livestock integrated systems, reclaiming of degraded pastures and symbiotic nitrogen fixation. Microsatellite markers were used to estimate the genetic diversity of 77 pigeonpea genotypes selected from the germplasm collections at Embrapa Cattle-Southeast and, to evaluate their transferability to Phaseolus vulgaris and Vigna unguiculata species. The number of alleles per locus ranged from 2 to12, with an average of 5.1 alleles. The PIC values ranged from 0.11 to 0.80 (average 0.49) and the D values from 0.23 to 0.91 (average 0.58). The averages of observed and expected heterozygosity were 0.25 and 0.47, respectively, showing a deficit in heterozygosity. A model-based Bayesian approach implemented in the software STRUCTURE was used to assign genotypes into clusters. A dendrogram was constructed based on the modified Roger's genetic distances using a neighbor-joining method (NJ). A total of four clusters were assembled by STRUCTURE and a strong tendency of correspondence between the Bayesian clusters in the NJ tree was observed. The genetic distance ranged from 0.09 to 0.62 (average 0.37), showing a low genetic diversity in the pigeonpea genotypes. Transferability of pigeonpea-specific microsatellites revealed a cross-amplification and the presence of polymorphic alleles in P. vulgaris and V. unguiculata. |
Palavras-Chave: |
Análisis estadístico; Bayesian inference; Diversidade genética; Frijoles; Guandul; Inferência bayesiana; Marcadores genéticos; Microssatélite; Simulación por computadora; Sofware Structure; Variación genética. |
Thesagro: |
Cajanus cajan; Feijão; Feijão de corda; Guandu; Marcador genético; Marcador molecular; Método estatístico; Modelo de simulação; Phaseolus vulgaris; Polimorfismo genético; Variação genética; Vigna unguiculata. |
Thesaurus Nal: |
Beans; Computer simulation; Genetic markers; Genetic polymorphism; Genetic variation; Pigeon peas; Statistical analysis. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56519/1/23954.pdf
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Marc: |
LEADER 03075naa a2200553 a 4500 001 1902585 005 2021-07-06 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSOUSA, A. C. B. 245 $aGenetic diversity analysis among pigeonpea genotypes adapted to South American regions based on microsatellite markers. 260 $c2011 520 $aThe pigeonpea [Cajanus cajan (L) Millspaugh] is one of the most important perennial legume crops utilized in the food, fodder, soil conservation, crop-livestock integrated systems, reclaiming of degraded pastures and symbiotic nitrogen fixation. Microsatellite markers were used to estimate the genetic diversity of 77 pigeonpea genotypes selected from the germplasm collections at Embrapa Cattle-Southeast and, to evaluate their transferability to Phaseolus vulgaris and Vigna unguiculata species. The number of alleles per locus ranged from 2 to12, with an average of 5.1 alleles. The PIC values ranged from 0.11 to 0.80 (average 0.49) and the D values from 0.23 to 0.91 (average 0.58). The averages of observed and expected heterozygosity were 0.25 and 0.47, respectively, showing a deficit in heterozygosity. A model-based Bayesian approach implemented in the software STRUCTURE was used to assign genotypes into clusters. A dendrogram was constructed based on the modified Roger's genetic distances using a neighbor-joining method (NJ). A total of four clusters were assembled by STRUCTURE and a strong tendency of correspondence between the Bayesian clusters in the NJ tree was observed. The genetic distance ranged from 0.09 to 0.62 (average 0.37), showing a low genetic diversity in the pigeonpea genotypes. Transferability of pigeonpea-specific microsatellites revealed a cross-amplification and the presence of polymorphic alleles in P. vulgaris and V. unguiculata. 650 $aBeans 650 $aComputer simulation 650 $aGenetic markers 650 $aGenetic polymorphism 650 $aGenetic variation 650 $aPigeon peas 650 $aStatistical analysis 650 $aCajanus cajan 650 $aFeijão 650 $aFeijão de corda 650 $aGuandu 650 $aMarcador genético 650 $aMarcador molecular 650 $aMétodo estatístico 650 $aModelo de simulação 650 $aPhaseolus vulgaris 650 $aPolimorfismo genético 650 $aVariação genética 650 $aVigna unguiculata 653 $aAnálisis estadístico 653 $aBayesian inference 653 $aDiversidade genética 653 $aFrijoles 653 $aGuandul 653 $aInferência bayesiana 653 $aMarcadores genéticos 653 $aMicrossatélite 653 $aSimulación por computadora 653 $aSofware Structure 653 $aVariación genética 700 1 $aGODOY, R. 700 1 $aSFORÇA, D. A. 700 1 $aCAMPOS, T. de 700 1 $aZUCCHI, M. I. 700 1 $aJANK, L. 700 1 $aSOUZA, A. P. de 773 $tScientia Agricola, Piracicaba$gv. 68, n. 4, p. 431-439, July/Aug. 2011.
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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Título em português: Adaptação da técnica de fluorescência para fins de genotipagem com novos marcadores microssatélite em feijoeiro.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Rondônia. |
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Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Rondônia. |
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Título em português: Identificação de cultivares de batata por marcadores moleculares.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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