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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
08/07/2013 |
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Data da última atualização: |
19/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
JESUS, O. N. de; SILVA, S. DE O. E; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; CAMPOS, J. M. S. de; SILVA, G. de G.; FIGUEIRA, A. |
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Afiliação: |
ONILDO NUNES DE JESUS, CNPMF; SEBASTIÃO DE OLIVEIRA E SILVA; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; JOSÉ MARCELLO SALABERT DE CAMPOS; GABRIELA DE GASPARI SILVA, USP; ANTONIO FIGUEIRA, USP. |
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Título: |
Genetic diversity and population structure of Musa accessions in ex situ conservation. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Plant Biology, p. 13:41, 2013. |
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ISSN: |
1471-2229 |
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DOI: |
10.1186/1471-2229-13-41 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Banana cultivars are mostly derived from hybridization between wild diploid subspecies of Musa acuminata (A genome) and M. balbisiana (B genome), and they exhibit various levels of ploidy and genomic constitution. The Embrapa ex situ Musa collection contains over 220 accessions, of which only a few have been genetically characterized. Knowledge regarding the genetic relationships and diversity between modern cultivars and wild relatives would assist in conservation and breeding strategies. Our objectives were to determine the genomic constitution based on Internal Transcribed Spacer (ITS) regions polymorphism and the ploidy of all accessions by flow cytometry and to investigate the population structure of the collection using Simple Sequence Repeat (SSR) loci as co-dominant markers based on Structure software, not previously performed in Musa. Results: From the 221 accessions analyzed by flow cytometry, the correct ploidy was confirmed or established for 212 (95.9%), whereas digestion of the ITS region confirmed the genomic constitution of 209 (94.6%). Neighborjoining clustering analysis derived from SSR binary data allowed the detection of two major groups, essentially distinguished by the presence or absence of the B genome, while subgroups were formed according to the genomic composition and commercial classification. The co-dominant nature of SSR was explored to analyze the structure of the population based on a Bayesian approach, detecting 21 subpopulations. Most of the subpopulations were in agreement with the clustering analysis. Conclusions: The data generated by flow cytometry, ITS and SSR supported the hypothesis about the occurrence of homeologue recombination between A and B genomes, leading to discrepancies in the number of sets or portions from each parental genome. These phenomenons have been largely disregarded in the evolution of banana, as the ?single-step domestication? hypothesis had long predominated. These findings will have an impact in future breeding approaches. Structure analysis enabled the efficient detection of ancestry of recently developed tetraploid hybrids by breeding programs, and for some triploids. However, for the main commercial subgroups, Structure appeared to be less efficient to detect the ancestry in diploid groups, possibly due to sampling restrictions. The possibility of inferring the membership among accessions to correct the effects of genetic structure opens possibilities for its use in marker-assisted selection by association mapping. MenosBackground: Banana cultivars are mostly derived from hybridization between wild diploid subspecies of Musa acuminata (A genome) and M. balbisiana (B genome), and they exhibit various levels of ploidy and genomic constitution. The Embrapa ex situ Musa collection contains over 220 accessions, of which only a few have been genetically characterized. Knowledge regarding the genetic relationships and diversity between modern cultivars and wild relatives would assist in conservation and breeding strategies. Our objectives were to determine the genomic constitution based on Internal Transcribed Spacer (ITS) regions polymorphism and the ploidy of all accessions by flow cytometry and to investigate the population structure of the collection using Simple Sequence Repeat (SSR) loci as co-dominant markers based on Structure software, not previously performed in Musa. Results: From the 221 accessions analyzed by flow cytometry, the correct ploidy was confirmed or established for 212 (95.9%), whereas digestion of the ITS region confirmed the genomic constitution of 209 (94.6%). Neighborjoining clustering analysis derived from SSR binary data allowed the detection of two major groups, essentially distinguished by the presence or absence of the B genome, while subgroups were formed according to the genomic composition and commercial classification. The co-dominant nature of SSR was explored to analyze the structure of the population based on a Bayesian approach, detecting 21 subpopulations.... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Banana; Hibridação; Melhoramento vegetal; Musa Acuminata. |
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Thesaurus Nal: |
Hybridization; Musa balbisiana. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 1. |  | MAZA, A. P.; MUNK, M.; ONORATO, G. C.; NEVES, C. C.; BRANDAO, H. de M.; CAMPOS, J. M. S. Avaliação da genotoxicidade de nanopartículas de titanato de bário em Alium cepa In: SIMPÓSIO DE ECOTOXICOLOGIA, 3., 2016, Rio Claro. Anais... Rio Claro: Universidade Estadual Paulista, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 2. | | PAIVA, E. A. A.; BUSTAMANTE, F. O.; SALGADO, C. C.; CAMPOS, J. M. S.; DAVIDE, L. C.; PEREIRA, A. V. Consequências da duplicação cromossônica em híbridos hexaplóides entre capim-elefante x milheto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2006. p. 1178.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | BUSTAMANTE, F. O.; PAIVA, E. A. A.; SALGADO, C. C.; CAMPOS, J. M. S.; DAVIDE, L. C.; PEREIRA, A. V. Variação no diâmetro de grãos de pólen de híbridos hexaplóides entre capim-elefante x milheto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2006. p. 1171.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | PASQUAL, M.; PIO, L. A. S.; SILVA, S. de O. e; SANTOS-SEREJO, J. A. dos; DAVIDE, L. C.; CAMPOS, J. M. S. de. Indução e verificação de poliploidia em Musa acuminata, Colla. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | CAMPOS, J. M. S. de; SALGADO, C. C.; SILVA, P. S.; ALVES, C. C. de S.; DAVIDE, L. C.; PEREIRA, A. V.; VICCINI, L. F. Citometria de fluxo na análise genômica em híbridos entre capim elefante e milheto. In: ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA - MG, 20., 2006, São João Del Rei. 20 anos de Encontro Regional da SBQ-MG: passado e futuro: anais. São João del Rei: UFSJ, 2006. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | COSTA, P. P.; PAULA, C. M. P. de; CAMPOS, J. M. S. de; DAVIDE, L. C.; VICCINI, L. F.; LÉDO, F. J. da S.; PEREIRA, A. V. Avaliação de ploidia em Pennisetum sp. In: SEMANA DE BIOLOGIA, 31.; MOSTRA DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2008, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: UFJF, 2008. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | CAMPOS, J. M. S. de; CALDERANO, C. de A.; PEREIRA, A. V.; DAVIDE, L. C.; VICCINI, L. F.; SANTOS, M. de O. Embriogênese somática em híbridos de Pennisetum sp. e avaliação de estabilidade genômica por citometria. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasílila, DF, v. 44, n. 1, p. 38-44, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | PAULA, C. M. P.; COSTA, P. P.; CAMPOS, J. M. S.; BARBOSA, S.; DAVIDE, L. C.; VICCINI, L. F.; LEDO, F. J. da S.; PEREIRA, A. V. Eliminação de sequências genômicas em resposta à hibridação e poliploidização em híbridos entre capim-elefante (Pennisetum purpureum) e milheto (P. glaucum). In: SEMANA DE BIOLOGIA, 31., MOSTRA DE PRODUÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2008, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: UFJF, 2008. 4 p. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | SALGADO, C. C.; CAMPOS, J. M. S.; CHAVES, I. S.; PEREIRA, V. A.; DAVIDE, L. C.; BUSTAMANTE, F. O.; PAIVA, E. A. A. Estratégias citogenéticas no melhoramento do capim-elefante. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2006. p. 1184.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 13. | | EL AOUAR FILHO, R. A.; PAULA, C. M. P.; NUNES, J. D.; AZEVEDO, A. L. S.; PEREIRA, A. V.; DAVIDE, L. C.; CAMPOS, J. M. S. Estabilidade genômica em explantes triploides e eliminação cromossômica após indução de poliploidia - Implicações para a duplicação cromossômica em Pennisetum. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 15. | | CAMPOS, J. M. S. de; DAVIDE, L. C.; SALGADO, C. C.; SILVA, P. S.; ALVES, C. C. de S.; PEREIRA, A. V.; VICCINI, L. F. Duplicação cromossômica em híbridos triplóides entre capim elefante e milheto - análise de ploidia por citometria de fluxo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... Lavras: UFLA / SBMP, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 16. | | NUNES, J. D.; AZEVEDO, A. L. S.; PEREIRA, A. V.; PAULA, C. M. P.; CAMPOS, J. M. S.; LEDO, F. J. da S.; SANTOS, V. B. DNA elimination in embryogenic development of Pennisetum glaucum x Pennisetum purpureum (Poaceae) hybrids. Genetics and Molecular Research, v. 12, n. 4, p. 4817-4826, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | PEREIRA, A. V.; CAMPOS, J. M. S. de; DAVIDE, L. C.; LÉDO, F. J. da S.; AUAD, A. M.; SOUZA SOBRINHO, F. de. Variação da quantidade de DNA em populações hexaplóides de capim elefante x milheto. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20., REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30., CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Anais... Cuzco: ALPA/APPA, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | PEREIRA, A. V.; CAMPOS, J. M. S. de; DAVIDE, L. C.; LÉDO, F. J. da S.; AUAD, A. M.; SOUZA SOBRINHO, F. de. Variação da quantidade de DNA em populações hexaplóides de capim elefante x milheto. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20.; REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Resumenes... Cuzco: ALPA/APPA, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | PAULA, C. M. P.; CAMPOS, J. M. S.; NUNES, J. D.; AZEVEDO, A. L. S.; DAVIDE, L. C.; LEDO, F. J. da S.; PEREIRA, A. V. Instabilidade genômica no desenvolvimento de embriões triploides de Pennisetum após hibridação interespecífica. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Aguas de Lindoia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | CAMPOS, J. M. S.; AZEVEDO, A. L. S.; AZEVEDO, A. L. S.; NUNES, J. D.; LEDO, F. J. da S.; VICCINI, L. F.; DAVIDE, L. C.; PEREIRA, A. V. Análise de pólen em Pennisetum por citometria de fluxo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Aguas de Lindoia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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