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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
24/01/2023 |
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Data da última atualização: |
14/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; JOSE, J.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; MUKHERJEE, S.; HUNTEMANN, M.; KYRPIDES, N. C.; CARAZZOLLE, M. F.; ARRUDA, P. |
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Afiliação: |
ANTONIO P. CAMARGO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; RAFAEL S. C. DE SOUZA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS, SYMBIOMICS MICROBIOME SOLUTIONS; JULIANA JOSE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; ISABEL RODRIGUES GERHARDT, CNPTIA; RICARDO AUGUSTO DANTE, CNPTIA; SUPRATIM MUKHERJEE, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; MARCEL HUNTEMANN, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; NIKOS C. KYRPIDES, DEPARTMENT OF ENERGY JOINT GENOME INSTITUTE; MARCELO F. CARAZZOLLE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; PAULO ARRUDA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS. |
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Título: |
Plant microbiomes harbor potential to promote nutrient turnover in impoverished substrates of a Brazilian biodiversity hotspot. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
The ISME Journal, v. 17, n. 3, p. 354-370, Mar. 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41396-022-01345-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The substrates of the Brazilian campos rupestres, a grassland ecosystem, have extremely low concentrations of phosphorus and nitrogen, imposing restrictions to plant growth. Despite that, this ecosystem harbors almost 15% of the Brazilian plant diversity, raising the question of how plants acquire nutrients in such a harsh environment. Here, we set out to uncover the taxonomic profile, the compositional and functional differences and similarities, and the nutrient turnover potential of microbial communities associated with two plant species of the campos rupestres-dominant family Velloziaceae that grow over distinct substrates (soil and rock). Using amplicon sequencing data, we show that, despite the pronounced composition differentiation, the plant-associated soil and rock communities share a core of highly efficient colonizers that tend to be highly abundant and is enriched in 21 bacterial families. Functional investigation of metagenomes and 522 metagenome-assembled genomes revealed that the microorganisms found associated to plant roots are enriched in genes involved in organic compound intake, and phosphorus and nitrogen turnover. We show that potential for phosphorus transport, mineralization, and solubilization are mostly found within bacterial families of the shared microbiome, such as Xanthobacteraceae and Bryobacteraceae. We also detected the full repertoire of nitrogen cycle-related genes and discovered a lineage of Isosphaeraceae that acquired nitrogen-fixing potential via horizontal gene transfer and might be also involved in nitrification via a metabolic handoff association with Binataceae. We highlight that plant-associated microbial populations in the campos rupestres harbor a genetic repertoire with potential to increase nutrient availability and that the microbiomes of biodiversity hotspots can reveal novel mechanisms of nutrient turnover. MenosThe substrates of the Brazilian campos rupestres, a grassland ecosystem, have extremely low concentrations of phosphorus and nitrogen, imposing restrictions to plant growth. Despite that, this ecosystem harbors almost 15% of the Brazilian plant diversity, raising the question of how plants acquire nutrients in such a harsh environment. Here, we set out to uncover the taxonomic profile, the compositional and functional differences and similarities, and the nutrient turnover potential of microbial communities associated with two plant species of the campos rupestres-dominant family Velloziaceae that grow over distinct substrates (soil and rock). Using amplicon sequencing data, we show that, despite the pronounced composition differentiation, the plant-associated soil and rock communities share a core of highly efficient colonizers that tend to be highly abundant and is enriched in 21 bacterial families. Functional investigation of metagenomes and 522 metagenome-assembled genomes revealed that the microorganisms found associated to plant roots are enriched in genes involved in organic compound intake, and phosphorus and nitrogen turnover. We show that potential for phosphorus transport, mineralization, and solubilization are mostly found within bacterial families of the shared microbiome, such as Xanthobacteraceae and Bryobacteraceae. We also detected the full repertoire of nitrogen cycle-related genes and discovered a lineage of Isosphaeraceae that acquired nitrogen-fixing pot... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Campos rupestres; Data sequencing; Ecossistema de pastagens; Microbioma vegetal; Plant microbiomes; Sequenciamento de dados; Soil microbes. |
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Thesagro: |
Bactéria; Genoma; Nitrogênio. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Nitrogen; Velloziaceae. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151181/1/AP-Plant-microbiomes-2022.pdf
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Marc: |
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001 2151181
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 168 | |
| 102. |  | SOUZA, M. G. de; GUALBERTO, G. F.; SOUZA, A. das G. C. de; ALMEIDA, O. C.; SOUSA, N. R. Quantificação de basidiocarpos de Moniliophthora perniciosa em vassouras de bruxa em cupuaçuzeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 42., 2009, Rio de Janeiro. Fitopatologia: ciência, evolução e perspectivas na era biotecnológica. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S193, ago. 2009. Suplemento.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 103. | | SOUZA, M. G. da S.; GRANDE, M. L. M.; SILVA, D. M.; PENA, M. R. S.; BUENO, A. de F. Seletividade de inseticidas a fase de pupa de Telenomus remus (Hymenoptera: Platygastridae). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 11., 2016, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2016. p. 40-46. (Embrapa Soja. Documentos, 373).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 106. | | SOUZA, M. G. L. de; SCHERER, W. P.; SILVEIRA, B. P.; NASCIMENTO JUNIOR, A. do; KOPP, M. M. Produtividade de aveia forrageira em Bagé-RS. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 11., 2021, Bagé, RS. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2021. p. 14.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Trigo. |
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| 109. | | BRAMBILLA, I.; SOUZA, M. G. de; CORDEIRO, O. de A.; SOUZA, A. das G. C. de; CHAVES, F. C. M.; OLIVEIRA, M. R. de. Atividade antifúngica de óleos essenciais no controle de Moniliophthora perniciosa. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA OCIDENTAL, 9., 2012, Manaus. Anais... Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2012. p. 51-59. (Embrapa Amazônia Ocidental. Documentos, 100).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 110. | | FERREIRA, C. C.; SOUZA, M. G. de; CHAVES, F. C. M.; GOMES, F. B.; CUNHA, A. L. B. da; OLIVEIRA, M. R. de. Atividade biológica do óleo essencial de Piper hispidum e Piper hispidinervum. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA OCIDENTAL, 12., 2015, Manaus. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 33-34.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 112. | | CUNHA, D. G. M.; GUIMARÃES, C. M.; MELO, L. C.; BORGES, M. G.; LUCAS, J. de F.; SOUZA, M. G. de; TEIXEIRA, A. G. R.; PERES, B. A. Avaliação de famílias F5:8 do cruzamento 'BRS Pérola' x BAT 477 sob deficiência hídrica e irrigação adequada. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 113. | | CAMPECHE, D. F. B.; MORAES, S. A. de; LIMA, V. T.; SOUSA, S. M. de N.; OLIVEIRA, S. T. L. de; SOUZA, M. G. de; PAULINO, R. V. Composição bromatológica e digestibilidade aparente de alimentos encontrados na região Semiárida brasileira para arraçoamento de tilapia rosa em cultivos. Ciência Rural, v. 41, n. 2, p. 343-348, fev. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 114. | | SOUZA, F. de F.; SOUZA, M. G. de; FARIA, L. C. de; DEL PELOSO, M. J.; GONDINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M. Adaptabiidade e estabiidade de genótipos de feijão comum do grupo carioca, em Rondônia. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 1. p. 246-249. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 182).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 115. | | SOUZA, F. de F.; SOUZA, M. G. de; FARIA, L. C. de; DEL PELOSO, M. J.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M. Adaptabilidade e estabilidade de genótipos de feijoeiro comum do grupo mulatinho, em Rondônia. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 1. p. 250-253. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 182).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 116. | | SOUZA, F. de F.; SOUZA, M. G. de; FARIA, LUÍS CLÁUDIO de; DEL PELOSO, M. J.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M. Adaptabilidade e estabilidade de genótipos de feijoeiro comum do grupo mulatinho, em Rondônia. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 1. p. 250-253.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 117. | | SOUZA, F. de F.; SOUZA, M. G. de; FARIA, LUÍS CLÁUDIO de; DEL PELOSO, M. J.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M. Adaptabilidade e estabilidade de genótipos de feijoeiro comum do grupo mulatinho, em Rondônia. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 1. p. 250-253.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 118. | | ANGELO, P. C. da S.; SENA, M. T.; MORAES, L. A. C.; SOUZA, M. G. de; SOUZA, A. das G. C. de; LOZANO, J. L. L. Interação antagônica entre Chromobacterium violaceum e Colletotrichum guaranicola, o agente causador da antracnose do guaranazeiro. In: SEMINÁRIO SOBRE PESQUISAS COM O GUARANAZEIRO NA AMAZÔNIA, 1., 2005, Manaus. Anais... Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2005. p. 93-97. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 119. | | ANGELO, P. C. da S.; SENA, M. T.; MORAES, L. A. C.; SOUZA, M. G. de; SOUZA, A. das G. C. de; LOZANO, J. L. L. Interação antagônica entre Chromobacterium violaceum e Colletotrichum guaranicola, o agente causador da antracnose do guaranazeiro. In: PEREIRA, J. C. R.; ARRUDA, M. R. de (Ed.). Pesquisa com guaranazeiro na Embrapa Amazônia Ocidental: status atual e perspectivas. Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2007. p. 135-140.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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