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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
15/08/2018 |
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Data da última atualização: |
23/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PAIM, T. do P.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTAL, C. M. Mc. |
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Afiliação: |
Tiago do Prado Paim, Instituto Federal Goiano/Campus Iporá; PATRICIA IANELLA, Cenargen; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; Concepta Margaret McManus Pimentel, Universidade de Brasília - Unb/Instituto de Biologia. |
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Título: |
Detection and evaluation of selection signatures in sheep. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos. |
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Conteúdo: |
The recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field. |
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Palavras-Chave: |
Analysis software; SNP markers. |
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Thesagro: |
Genética Molecular; Genoma; Melhoramento Genético Animal; Ovis Aries. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetic resources; Genetic improvement; Genomics; Molecular genetics; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181463/1/Detection-and-evaluation-of-selection.pdf
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Marc: |
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520 $aThe recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field.
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773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 303 | |
| 21. |  | SILVA, E. C. da; PIOVEZAN, U.; MCMANUS, C. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Diversidade genética de populações do suíno Monteiro (Sus scrofa) na região do Pantanal, MS, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 22. | | SILVA, E. C. da; PIOVEZAN, U.; MCMANUS, C. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Diversidade genética de populações do suíno Monteiro (Sus scrofa) na região do Pantanal, MS, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012. 3p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 23. | | MAGNABOSCO, C. de U.; OJALA, M.; FERNANDES, A.; CAETANO, A. R.; FAMULA, T. R. Efeitos de fatores ambientais sobre medidas corporais e peso em bovinos da raca Brahman no Mexico. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 33., 1996, Fortaleza, CE. Anais... Fortaleza: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 1996. p.139-141.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 24. | | MAGNABOSCO, C. de U.; OJALA, M.; FERNANDES, A.; CAETANO, A. R.; FAMULA, T. R. Efeitos de fatores ambientais sobre medidas corporais e peso em bovinos da raça Brahman no México. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 33., 1996, Fortaleza, CE. Anais... Fortaleza: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 1996. p.139-141.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 25. | | FERNANDES, A.; MGNABOSCO, C. de U.; OJALA, M.; CAETANO, A. R.; FAMULA, T. R. Efeitos de parâmetros genéticos e ambientais de medidas corporais e peso em bovinos da raça Brahman nos trópicos. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 33., 1996, Fortaleza, CE. Anais... Fortaleza: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 1996. p. 65-68.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 26. | | PAIM, T. do P.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTAL, C. M. Mc. Detection and evaluation of selection signatures in sheep. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018 Título em português: Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 28. | | CARDOSO, F. F.; LOPA, T. B. P.; BIEGELMEYER, P.; CAETANO, A. R. Avanços nos programas de avaliação genética aplicados à pecuária de corte. In: JORNADA [DO] NÚCLEO DE ESTUDOS EM SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 8.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 1., 2013, Porto Alegre. A vez da inovação na pecuária de corte: anais. Porto Alegre: NESPRO-UFRGS: SENAR, 2013. p. 179-196. 1 CD-ROM. Editores: Maria Eugênia Andrighetto Canozzi, Bárbara Bremm, João Batista Gonçalves Costa Júnior, Júlio Otávio Jardim Barcellos.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 29. | | BCHARA, M.; MCMANUS, C.; BLACKBURN, H.; AZEVEDO, H. C.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Validação de um painel reduzido de marcadores moleculares associados com susceptibilidade ao vírus da pneumonia ovina. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 83, 2018. Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 30. | | BCHARA, M.; MCMANUS, C.; BLACKBURN, H.; AZEVEDO, H. C.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Validação de um painel reduzido de marcadores moleculares associados com susceptibilidade ao vírus da pneumonia ovina. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 83, 2018. Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 32. | | RIPAMONTE, P.; MERIGHE, G. K. F.; CAETANO, A. R.; WATANABE, Y. F.; MEIRELLES, F. V. Uso da técnica de differential display PCR (DDPCR) na identificação de genes expressos diferencialmente em embriões bovinos produzidos in vitro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. p. 111| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 36. | | FERNANDES, A.; MAGNABOSCO, C. U.; OJALA, M.; CAETANO, A. R.; FAMULA, T. R. Estimativas de parametros geneticos e ambientais de medidas corporais e peso em bovinos da raca Brahman nos tropicos. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 33., 1996, Fortaleza, CE. Anais... Fortaleza: SBZ, 1996. p. 136-138.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 37. | | ALMEIDA, I. G. de; FARIA, M. T. de; IANELLA, P.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estrutura genética do pirarucu (Arapaima gigas) na região de Santarém, PA, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 38. | | ALMEIDA, I. G. de; FARIA, M. T. de; IANELLA, P.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estrutura genética do pirarucu (Arapaima gigas) na região de Santarém, PA, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação. Brasília, DF: SBZ, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 39. | | SILVA, E. C. da; PIOVEZAN, U.; MCMANUS, C. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estrutura genética do suíno Monteiro (Sus scrofa) em regiões do Pantanal, MS, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012. 3p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 40. | | SILVA, E. C. da; PIOVEZAN, U.; MCMANUS, C. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estrutura genética do suíno Monteiro (Sus scrofa) em regiões do Pantanal, MS, Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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