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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Rondônia; Embrapa Roraima; Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. MenosEmbrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Rondônia... Mostrar Todas |
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Data corrente: |
27/04/2000 |
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Data da última atualização: |
23/09/2014 |
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Autoria: |
CIAMPI, A. Y.; BRONDANI, R. P. V.; GRATTAPAGLIA, D. |
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Afiliação: |
Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia. |
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Título: |
Otimizacao de sistemas fluorescentes de genotipagem multiloco e desenvolvimento de marcadores microssatelites para Copaifera langsdorffii desf.(Copaiba) Leguminosae - Caesalpinoideae. |
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Ano de publicação: |
2000 |
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Fonte/Imprenta: |
Brasilia: Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, 2000 |
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Páginas: |
40p. |
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Série: |
(Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa, 16) |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Microssatélites constituem genéticos altamente informativos para estudos de genética de populações pela sua natureza co-dominante, multialélica e pela ampla distribuição do genoma. Marcadores microssatélites foram desenvolvidos para copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para sequências simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridização de colônia e sequenciados. Para 34% dos clones sequenciados foi possível desenhar pares de "primers" específicos (de 17 a 20 bases) complementares as sequências únicas que flanqueiam o microssatélite. Utilizando-se um único programa de PCR, 26 locos microssatélites foram verificados a partir dos 45 pares de ""primers" desenhados. Uma resolução e identificação robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com detecção a laser de fluorescência multi coloridas em sequenciador automático. Oito locos resolvidos em três sistemas "multiplex" foram caracterizados para conteúdo informativo a partir de genótipos obtidos para 96 indivíduos adultos das populações de matas de galeria. Verificou-se uma média de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteúdo informativo com heterozigosidade média observada de 0,89 e heterozigosidade média esperada de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de Copaíba, foram stimados a probabilidade de identificar (I) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11 x 10 elevado a -15 e o poder de exclusão (Q) de 0,7093 a 0,88536, com o valor combinado de 99,999993%. Marcadores SSR para copaíba abrem uma ampla perpectiva para a geração de daos precisos sobre estrutura genética, fuxo gênico e paternidade em populações naturais. Estas informações serão fundamentais para dar suporte a programas de coleta e conservação in situ e ex situ desta espécie. MenosMicrossatélites constituem genéticos altamente informativos para estudos de genética de populações pela sua natureza co-dominante, multialélica e pela ampla distribuição do genoma. Marcadores microssatélites foram desenvolvidos para copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para sequências simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridização de colônia e sequenciados. Para 34% dos clones sequenciados foi possível desenhar pares de "primers" específicos (de 17 a 20 bases) complementares as sequências únicas que flanqueiam o microssatélite. Utilizando-se um único programa de PCR, 26 locos microssatélites foram verificados a partir dos 45 pares de ""primers" desenhados. Uma resolução e identificação robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com detecção a laser de fluorescência multi coloridas em sequenciador automático. Oito locos resolvidos em três sistemas "multiplex" foram caracterizados para conteúdo informativo a partir de genótipos obtidos para 96 indivíduos adultos das populações de matas de galeria. Verificou-se uma média de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteúdo informativo com heterozigosidade média observada de 0,89 e heterozigosidade média esperada de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de Copaíba, foram stimados a probabilidade de identificar (I) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11 x 10 elevado a -15 e o poder de exclusão (Q) de 0,7093 a 0,88536... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Brasilia; Breeeding; Coleta de germoplasma; Conservacao de germoplasma; Copaifera langsddorfii; Copaifera largsdorffii; Genetics markers; Genomes; Marcadores Genéticos; Melhoramento genetico; Microsatélite; microsatellite; Microssatélite; Microssatélites; Microssatpelite; SSR; Transgênicos. |
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Thesagro: |
Conservação; Copaíba; Copaifera Langsdorffii; Genética; Genoma; Germoplasma; Marcador Genético; Recurso Genético. |
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Thesaurus Nal: |
genetic markers; genetic resources; germplasm conservation. |
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Categoria do assunto: |
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X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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