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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
22/03/2007 |
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Data da última atualização: |
25/05/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FIGUEIREDO, J. E. F.; DEPAOLI, H. C.; COELHO, V. T. da S.; CASELA, C. R.; FERREIRA, A. da S.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; BRESSAN, W. |
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Afiliação: |
JOSE EDSON FONTES FIGUEIREDO, CNPMS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; ELIANE APARECIDA GOMES, CNPMS. |
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Título: |
Genetic diversity among Colletotrichum sublineolum pathotypes isolated from sorghum (Sorghum bicolor). |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 5, n. 2, p. 304-318, 2006. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.18512/1980-6477/rbms.v5n2p304-318 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Sorghum anthracnose, caused by Colletotrichum sublineolum is a serious disease in Brazil. The fungus is highly variable pathogenically with many physiological races. The present study was made to evaluate the usefulness of molecular methods (SDS-PAGE, RAPD, ARDRA and rDNA sequencing) for identifying C. sublineolum pathotypes isolated from sorghum. Although protein profile (SDS-PAGE) showed a relative low level of polymorphism, differences could be observed due to presence/absence of some polypeptides as well as to intensity of some bands among pathotypes. DNA profile of arbitrarily amplified sequences (RAPD) using sixteen random primers revealed a high degree of polymorphism while amplified rDNA (ITS region and 18S gene) digested with six different restriction enzymes (ARDRA) showed similar patterns. Nucleotide sequencing analysis of the complete ITS region and partial sequencing of 18S rRNA gene were useful for revealing genetic differences among the five pathotypes. In the present study, RAPD and rDNA sequencing were the most profitable methods for identifying C. sublineolum pathotypes. A antracnose do sorgo, causada por Colletotrichum sublineolum, é séria doença, no Brasil. O fungo é altamente variável do ponto de vista patogênico e várias raças têm sido noticiadas. Este estudo foi realizado com o objetivo de avaliar a utilidade de métodos moleculares (SDS-PAGE, RAPD, ARDRA e seqüenciamento de rDNA) para identificar patótipos de C. sublineolum isolados do sorgo. Embora o perfil protéico (SDS-PAGE) tenha mostrado baixo grau de polimorfismo, foi possível observar diferenças devido à presença/ausência de alguns polipeptídios, bem como diferenças quanto à intensidade de algumas bandas. O perfil de DNA amplificado arbitrariamente (RAPD), usando dezeseis primers aleatórios, revelou elevado grau de polimorfismo entre os patótipos, enquanto que o produto da amplificação de rDNA (região ITS e gene 18S), digerido com seis enzimas de restrição diferentes (ARDRA), apresentou padrão similar. Análise de nucleotídeos da seqüência completa da região ITS e do seqüenciamento parcial do gene 18S rRNA revelaram diferenças genéticas entre os cinco patótipos. Entre os métodos testados no presente estudo, RAPD e seqüenciamento de rDNA foram mais efetivos para identificar patótipos de C. sublineolum. MenosSorghum anthracnose, caused by Colletotrichum sublineolum is a serious disease in Brazil. The fungus is highly variable pathogenically with many physiological races. The present study was made to evaluate the usefulness of molecular methods (SDS-PAGE, RAPD, ARDRA and rDNA sequencing) for identifying C. sublineolum pathotypes isolated from sorghum. Although protein profile (SDS-PAGE) showed a relative low level of polymorphism, differences could be observed due to presence/absence of some polypeptides as well as to intensity of some bands among pathotypes. DNA profile of arbitrarily amplified sequences (RAPD) using sixteen random primers revealed a high degree of polymorphism while amplified rDNA (ITS region and 18S gene) digested with six different restriction enzymes (ARDRA) showed similar patterns. Nucleotide sequencing analysis of the complete ITS region and partial sequencing of 18S rRNA gene were useful for revealing genetic differences among the five pathotypes. In the present study, RAPD and rDNA sequencing were the most profitable methods for identifying C. sublineolum pathotypes. A antracnose do sorgo, causada por Colletotrichum sublineolum, é séria doença, no Brasil. O fungo é altamente variável do ponto de vista patogênico e várias raças têm sido noticiadas. Este estudo foi realizado com o objetivo de avaliar a utilidade de métodos moleculares (SDS-PAGE, RAPD, ARDRA e seqüenciamento de rDNA) para identificar patótipos de C. sublineolum isolados do sorgo. Embora o ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
ARDRA; RAPD; SDS-PAGE; seqüenciamento de rDNA. |
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Thesagro: |
Antracnose; Doença de planta; Sorghum Bicolor. |
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Thesaurus Nal: |
Colletotrichum sublineolum. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/35275/1/Genetic-diversity-2.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| Registros recuperados : 70 | |
| 61. |  | FIGUEIREDO, J. E. F.; TEIXEIRA, M. A.; LIMA, G. V. C.; BRESSAN, W.; PINTO, N. F. J. de; CASELA, C. R. Atividade antagonista in vitro de Bacillus subtilis contra fungos fitopatogênicos do milho e sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 28.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA DO CARTUCHO, 4., 2010, Goiânia. Potencialidades, desafios e sustentabilidade: resumos expandidos... Sete Lagoas: ABMS, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 63. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; DEPAOLI, H. C.; COELHO, V. T. da S.; CASELA, C. R.; FERREIRA, A. da S.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; BRESSAN, W. Genetic diversity among Colletotrichum sublineolum pathotypes isolated from sorghum (Sorghum bicolor). Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 5, n. 2, p. 304-318, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 65. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; GOMES, E. A.; GUIMARAES, C. T.; LANA, U. G. de P.; TEIXEIRA, M. A.; LIMA, G. V. C.; BRESSAN, W. Molecular analysis endophytic bacteria from the genus Bacillus isolated from tropical maize (Zea mays L.). Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v. 40, n. 3, p. 522-534, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 66. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; DE PAOLI, H. C.; COELHO, V. T. da S.; PINTO, N. F. J. de A.; FERNANDES, F. T.; BRESSAN, W.; GUIMARAES, C. R.; GOMES, E. A. Caracterização molecular de microorganismos do ecossistema agricola do cerrado. III. Acremonium strictum. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2003. 10p. (Embrapa Milho e Sorgo. Comunicado Tecnico, 69).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 67. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; DE PAOLI, H. C.; QUINTAO, P. L.; COELHO, V. T. da S.; CASELA, C. R.; FERREIRA, A. C.; BRESSAN, W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A. Caracterização molecular de microrganismos do ecossistema agrícola do cerrado. II. Colletotrichum graminicola. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2003. 9 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Comunicado técnico, 68).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 68. | | COELHO, V. T. S.; QUINTÃO, P. L.; PAOLI, H. C.; MELO, M. A. V.; LAGE, G. A.; FONSECA, P. C.; BRESSAN, W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; FIGUEIREDO, J. E. F. Caracterização de bactérias endofíticas isoladas do milho cultivado no agroecossistema cerrado. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 24., 2002, Florianópolis, SC. Meio ambiente e a nova agenda para o agronegócio de milho e sorgo: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Florianópolis: Epagri, 2002. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 69. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; TEIXEIRA, M. A.; LIMA, G. V. C.; SILVA, C. H. C.; LOPES, S. C.; GOMES, E. A.; GUIMARAES, C. T.; LANA, U. G. de P.; FLATSCHART, A. V. F.; BRESSAN, W. Estudo da diversidade ecológica de bactérias endofíticas, por análise molecular, em germoplasma de milho tropicais. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 7., 2009, Pucón, Chile. Proceeding... Santiago de Chile: Ministério de Agricultura, Instituto de Investigaciones Agropecuarias, 2009. p. 75-76.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 70. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; TEIXEIRA, M. A.; LIMA, G. V. C.; NEVES, N. A.; MARRA, L. M.; SILVA, C. H. C.; LOPES, S. C.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; GRAZIOTTI, P. H.; FLATSCHART, A. V. F.; BRESSAN, W. Identificação molecular da comunidade bacteriana associada à rizosfera de plantas sempre-viva (Syngonanthus elegans var. elegans) endêmica de campos rupestres brasileiros. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 7., 2009, Pucón, Chile. Proceeding... Santiago de Chile: Ministério de Agricultura, Instituto de Investigaciones Agropecuarias, 2009. p. 77-78.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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