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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
26/01/2022 |
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Data da última atualização: |
21/02/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, T. L. C. da; SILVA, V. N. B.; BRAGA, I. de O.; RODRIGUES NETO, J. C.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; VALADARES, L. F.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
THALLITON LUIZ CARVALHO DA SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; VIVIANNY NAYSE BELO SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; ÍTALO DE OLIVEIRA BRAGA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; JORGE CANDIDO RODRIGUES NETO, Instituto de Química, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; LEONARDO FONSECA VALADARES, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE; CARLOS ANTONIO FERREIRA DE SOUSA, CPAMN; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
Integration of metabolomics and transcriptomics data to further characterize Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth under high salinity stress. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Genome, e20182, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response. MenosSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and gen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adaptation; Salinization protocol. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230514/1/The-Plant-Genome-2022-Integration.pdf
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Marc: |
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520 $aSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 222 | |
| 121. |  | CALDERANO FILHO, B.; BACA, J. F. M.; FREITAS, A. C. R. de; COSTA, B.; FONTANA, A.; BALIEIRO, F. de C.; CHAER, G. M.; DONAGEMMA, G. K. Caracterização de pedoambientes da mesorregião oeste maranhense, microrregião de Pindaré sob diferentes níveis de pastagens. São Luís: Embrapa Cocais, 2018. 51 p. (Embrapa Cocais. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 02; Embrapa Solos. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 266).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Solos. |
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| 122. | | CALDERANO FILHO, B.; BACA, J. F. M.; FREITAS, A. C. R. de; COSTA, B.; FONTANA, A.; BALIEIRO, F. de C.; CHAER, G. M.; DONAGEMMA, G. K. Caracterização de pedoambientes da mesorregião oeste maranhense, microrregião de Pindaré sob diferentes níveis de pastagens. São Luís, MA: Embrapa Cocais, 2018. 51 p. (Embrapa Cocais. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 02)| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Cocais. |
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| 123. | | MACEDO, J. R. de; DONAGEMMA, G. K.; SCHULER, A. E.; PRADO, R. B.; POLI, R. de; SILVA, N. T. da; JUSTIN, R. Caracterização da adequação de usos agrícolas em solos coesos na microbacia do Brejo da Cobiça - Município de São Francisco de Itabapoana - RJ. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 17., 2008, Rio de Janeiro. Manejo e conservação do solo e da água no contexto das mudanças ambientais. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2008. 1 CD-ROM. (Embrapa Solos. Documentos, 101).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 124. | | DONAGEMMA, G. K.; SILVA, M. N. G.; FREITAS, P. L. de; GONÇALVES, A. O.; SIMÕES, M.; FERRAZ, R. P. D.; DINIZ, Y. V. de F. Controle de erosão hídrica para os solos de textura leve sob diferentes usos. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE CIÊNCIA DO SOLO, 23.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 38., 2023, Florianópolis. Anais [...]. Florianópolis: Epagri, 2023. p. 63. Ref. ID 817.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 125. | | DONAGEMMA, G. K.; BECKER, A. A. D.; BALIEIRO, F. de C.; GONÇALVES, A. O.; FREITAS, P. L. de; MESQUITA JUNIOR, A.; PENA, I. Controle de erosão em sistemas agroflorestais manejados por comunidades quilombolas, na cidade do Rio de Janeiro. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE CIÊNCIA DO SOLO, 23.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 38., 2023, Florianópolis. Anais [...]. Florianópolis: Epagri, 2023. p. 1006. Ref. ID 626.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 126. | | FREITAS, P. L. de; DONAGEMMA, G. K.; CALDERANO, S. B.; MANZATTO, C. V.; BERNARDI, A. C. de C.; GREGORIS, G.; DOWICH, I. Comportamento físico-químico, aspecto mineralógicos e resposta ao manejo de latossolos de textura média do Oeste da Bahia. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 2010, Teresina. Novos caminhos para agricultura conservacionista no Brasil. Anais. Teresina: Embrapa Meio-Norte; Viçosa: UFV, 2010| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 127. | | FREITAS, P. L. de; DONAGEMMA, G. K.; CALDERANO, S. B.; MANZATTO, C. V.; BERNARDI, A. C. de C.; GREGORIS, G.; DOWICH, I. Comportamento físico-químico, aspectos mineralógicos e resposta ao manejo de Latossolos de textura média do Oeste da Bahia. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 18., 2010, Teresina. Novos caminhos para a agricultura conservacionista no Brasil. Teresina: Embrapa Meio-Norete: Universidade Federal do Piauí, 2010. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 128. | | DONAGEMMA, G. K.; RUIZ, H. A.; ALVAREZ V., V. H.; FERREIRA, P. A.; CANTARUTTI, R. B.; SILVA, A. T. da; FIGUEIREDO, G. C. Distribuição do amônio, nitrato, potássio e fósforo em colunas de latossolos fertirrigadas. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 32, n. 6, p. 2493-2504, dez. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 129. | | PRATES, F. B. S.; FERRARI, A. C.; GENÚNCIO, G. C.; ZONTA, E.; LIMA, E.; DONAGEMMA, G. K.; MARTINS, C. C.; PALERMO, D. P. Crescimento inicial de pinhão manso em função de diferentes formas de correção do solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO v.33, 2011, Uberlândia, MG.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 134. | | GUIMARÃES, M. G.; RODRIGUES, N. F.; ALONSO, J. M.; CLEMENTE, E. de P.; STRALIOTTO, R.; DONAGEMMA, G. K.; TEIXEIRA, P. C. Efeito da aplicação de fertilizante à base de coprodutos de siderurgia na produção de matéria seca e acúmulo de nutrientes em Panicum maximum. Contribuciones a Las Ciencias Sociales, v. 16, n. 11, p. 26194-26211, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
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| 135. | | BRAGA, N. S.; DONAGEMMA, G. K.; LAVIOLA, B. G.; POLIDORO, J. C.; BALIEIRO, F. de C.; ANDRADE, D. S.; PINTO, R. W. P.; GASPARELLO, P. A. Concentração de nitrogênio em folhas de genótipos de pinhão manso no Estado do Rio de Janeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., 2008; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR: UEL, 2008. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 136. | | BRAGA, N. S.; DONAGEMMA, G. K.; LAVIOLA, B. G.; POLIDORO, J. C.; BALIEIRO, F. de C.; ANDRADE, D. S.; PINTO, R. W. P.; GASPARELLO, P. A. Concentração de nitrogênio em folhas de genótipos de pinhão manso no Estado do Rio de Janeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., 2008; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., 2008; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR: UEL, 2008. 4 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 137. | | SANTOS, F. C. dos; VIANA, J. H. M.; ALBUQUERQUE FILHO, M. R. de; FRANCELINO, M. R.; THOMAZINI, A.; DONAGEMMA, G. K. Mapas de atributos químicos e físicos de solo arenoso do Sudoeste baiano. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SOLOS ARENOSOS, 3., 2019, Campo Grande, MS. Intensificação agropecuária sustentável em solos arenosos: anais... Brasília, DF: Embrapa, 2019. E-book.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
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| 138. | | BEZERRA, M. A. da S.; SILVA, L. M. da; PEREIRA, M. G.; VIANA, J. H. M.; DONAGEMMA, G. K.; WADT, P. G. S. Método de referência para determinação das frações de areia, silte e argila em solos do Estado do Acre. In: WORKSHOP DE CADEIAS DE PRODUÇÃO AGROFLORESTAL PRIORITÁRIAS DA AMAZÔNIA, 1., 2021, Porto Velho. Caminhos da produção agroflorestal na Amazônia: anais. Porto Velho: Núcleo Regional Noroeste SBCS, 2021. p. 93-104. Editores: Luciélio Manoel da Silva; Paulo Guilherme Salvador Wadt; Karina Thais Lima Buriti; Elaine Almeida Delarmelinda Honoré; Marcos Gervasio Pereira.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Rondônia; Embrapa Solos. |
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| 139. | | BEZERRA, M. A. da S.; SILVA, L. M. da; PEREIRA, M. G.; VIANA, J. H. M.; DONAGEMMA, G. K.; WADT, P. G. S. Método de referência para determinação das frações de areia, silte e argila em solos do Estado do Acre. In: WORKSHOP DE CADEIAS DE PRODUÇÃO AGROFLORESTAL PRIORITÁRIAS DA AMAZÔNIA, 1., 2021, Porto Velho. Caminhos da produção agroflorestal na Amazônia: anais. Porto Velho: Núcleo Regional Noroeste SBCS, 2021. p. 93-104. Editores: Luciélio Manoel da Silva; Paulo Guilherme Salvador Wadt; Karina Thais Lima Buriti; Elaine Almeida Delarmelinda Honoré; Marcos Gervasio Pereira.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 140. | | PRATES, F. B. de S.; PALERMO, D. P.; SILVA, J. C. R. da; DONAGEMMA, G. K.; CRUZ, G. G. da; ZONTA, E. Teores de Fósforo em Plantas de Pinhão Manso submetido a doses de Alumínio em cultivo Hidropônico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIAS DO SOLO, 34., 2013. Florianópolis. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Cência do Solo, 2013. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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