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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
11/05/2017 |
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Data da última atualização: |
09/05/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PERTILLE, F.; MOREIRA, G. C. M. M.; ZANELLA, R.; NUNES, J. de R. da S.; BOSCHIERO, C.; ROVADOSCKI, G. A.; MOURÃO, G. B.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
FÁBIO PÉRTILLE, ESALQ; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; RICARDO ZANELLA, UPF; JOSÉ DE RIBAMAR DA SILVA NUNES, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; GREGORI ALBERTO ROVADOSCKI, ESALQ; GERSON BARRETO MOURÃO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
Genome-wide association study for performance traits in chickens using genotype by sequencing approach. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 7, n. 41748, 2017. |
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DOI: |
10.1038/srep41748 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Performance traits are economically important and are targets for selection in breeding programs, especially in the poultry industry. To identify regions on the chicken genome associated with performance traits, different genomic approaches have been applied in the last years. The aim of this study was the application of CornellGBS approach (134,528 SNPs generated from a PstI restriction enzyme) on Genome-Wide Association Studies (GWAS) in an outbred F2 chicken population. We have validated 91.7% of these 134,528 SNPs after imputation of missed genotypes. Out of those, 20 SNPs were associated with feed conversion, one was associated with body weight at 35 days of age (P < 7.86E-07) and 93 were suggestively associated with a variety of performance traits (P < 1.57E-05). The majority of these SNPs (86.2%) overlapped with previously mapped QTL for the same performance traits and some of the SNPs also showed novel potential QTL regions. The results obtained in this study suggests future searches for candidate genes and QTL refinements as well as potential use of the SNPs described here in breeding programs. |
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Palavras-Chave: |
Ave. |
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Thesagro: |
Galinha; Genoma; Melhoramento genético animal. |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Chickens; Genome. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159737/1/final8329.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 50 | |
| 1. |  | BOSCHIERO, C.; NONES, K.; ROSÁRIO, M. F.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; MOURA, A. S. M. T. Análise de meio-irmãos para o mapeamento fino de uma região associada a QTLs no cromosso 1 da galinha. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Anais. Salvador: SBG, 2008 p. 241. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 2. | | MOREIRA, G. C. M.; PÉRTILLE, F.; GODOY, T. F.; BRASSOLOTI, R.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Discovery of candidate genes for fatness in chickens based on genotyping with 600K SNP chip in a QTL region. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos? Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 64| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 3. | | BOSCHIERO, C.; NONES, K.; ROSÁRIO, M. F. do; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; MOURA, A. S. A. M. T. Mapeamento fino de uma região associada a QTLs no cromossomo 1 da galinha. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais. São Carlos, SP: SBMA, 2008. 4 p. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | FELÍCIO, A. M.; BOSCHIERO, C.; SILVA, N. A.; LEDUR, M. C.; JORGE, E. C.; COUTINHO, L. L. Identificação de polimorfismos nos genes MC4R, FGFBP1 e FGFBP2 em galinhas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010. Resumos. Guarujá: SBG , 2010. p. 80. Projeto/Plano de Ação: 01.06.10.602-02.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | TREVISOLI, P. A.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; PETRINI, J.; MOURÃO, G. B.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Single nucleotide polymorphism associated with breast trait in chickens. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Abstracts... [S.l. : s.n.], 2018. Paper 29820. Organizers: Sébastien Praud and Kellye Eversole. PAG XXVI.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | BOSCHIERO, C.; CAMPOS, R. L. R.; AMBO, M.; ROSÁRIO, M. F.; NONES, K.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; MOURA, A. S. A. M. T. Associações entre marcadores microssatélites do cromossomo 13 e características de desempenho, carcaça e órgãos em galinhas. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE AVICULTURA, 20., 2007, Porto Alegre. Memorias. Porto Alegre: UBA : FIERGS, 2007. p. 255-257. Projeto n. 01.02.10.210-10.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 9. | | BOSCHIERO, C.; JORGE, E. C.; NINOV, K.; NONES, K.; ROSÁRIO, M. F. do; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C.; BURT, D. W.; MOURA, A. S. A. M. T. Association of IGF1 and KDM5A polymorphisms with performance, fatness and carcass traits in chickens. Journal of Applied Genetics, 6 dez. 2012. Projeto: 01.06.01.006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 10. | | BOSCHIERO, C.; ROSÁRIO, M. F.; LEDUR, M. C.; CAMPOS, R. L. R.; AMBO, M.; COUTINHO, L. L.; MOURA, A. S. A. M. T. Associations between microsatellite markers and traits related to performance, carcass and organs in chickens International Journal of Poultry Science, v. 8, n. 7, p. 615-620. 2009. Disponível em: . Acesso em: 09 fev. 2010 Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 11. | | ROSÁRIO, M. F.; MARGARIDO, G. R. A.; BOSCHIERO, C.; NONES, K.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Mapa consenso brasileiro do cromossomo 1 oriundo de cruzamentos recíprocos entre linhagens de corte e postura. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 27., 2009, Porto Alegre. Anais [dos] trabalhos de pesquisa José Maria Lamas de Silva. [Campinas]: FACTA, 2009. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10. Publicado em CD-ROM (CD00156).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 12. | | MOREIRA, G. C. M.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D. J.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association studies reveal genomic windows and candidate genes related to fat deposition in chickens. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0647.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 13. | | AMBO, M.; CAMPOS, R. de L. R.; MOURA, A. S. M. T.; BOSCHIERO, C.; ROSÁRIO, M. F. do; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COUTINHO, L. L. Genetic linkage maps of chicken chromosomes 6, 7, 8, 11 and 13 from a brazilian resource population. Scientia Agrícola, v.65, n.5, p.447-452, 2008. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 14. | | ROSÁRIO, M. F.; LEDUR, M. C.; BOSCHIERO, C.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Mapeamento de QTLs para características de desempenho em galinhas. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE AVICULTURA, 20., 2007, Porto Alegre. Memorias. Porto Alegre: UBA : FIERGS, 2007. p. 272-274. Projeto n. 01.02.10.210-10.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 15. | | GODOY, T. F.; SILVA, V. H. da; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; CROOIJAMANS, R. P.; GROENEN, M. A. M.; COUTINHO, L. L. Inherited CNVs in regions related to breast muscle development in a broiler population. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Abstracts... [S.l. : s.n.], 2018. Paper 29816. Organizers: Sébastien Praud and Kellye Eversole. PAG XXVI.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 16. | | FELÍCIO, A. M.; BOSCHIERO, C.; BALIEIRO, J. C. C.; LEDUR, M. C.; FERRAZ J. B. S.; MICHELAN FILHO, T.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Identification and association of polymorphisms in CAPN1 and CAP3 candidate genes related to performance and meat quality traits in chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 12, n. 1, p. 472-482, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 17. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; SILVA, V. H.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Identification of CNVs on the genome of Brazilian chicken lines. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0646.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 18. | | MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of mutations in a QTL region on chromosome 3 associated with fatness in chickens. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 38. ISAFG 2013. AB.31| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 19. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of polymorphisms in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 39. ISAFG 2013.AB.32| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; BOSCHIERO, C.; NONES, K.; PINTO, L. F. B.; JAENISCH, F. R. F.; BURT, D. W.; COUTINHO, L. L. Quantitative trait loci with sex-specific effects for internal organs weights and hematocrit value in a broiler-layer cross. Journal of Applied Genetics, v. 57, n. 2, p. 215–224, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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