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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Territorial. |
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Data corrente: |
20/07/2018 |
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Data da última atualização: |
30/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. |
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Afiliação: |
IVAN MAZONI, CNPTIA; LUIZ CÉSAR BORRO, IB/Unicamp; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPM; INACIO HENRIQUE YANO, CNPTIA; JOSÉ AUGUSTO SALIM, USP; GORAN NESIC, CNPTIA. |
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Título: |
Study of specific nanoenvironments containing [alfa]-helices in all-[alfa] and ([alfa]+[beta])+([alfa]/[beta]) proteins. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 13, n. 7, p. 1-25, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0200018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Artigo e0200018. |
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Conteúdo: |
Protein secondary structure elements (PSSEs) such as [alfa]-helices, [beta]-strands, and turns are the primary building blocks of the tertiary protein structure. Our primary interest here is to reveal the characteristics of the nanoenvironment formed by both PSSEs and their surrounding amino acid residues (AARs), which might contribute to the general understanding of how proteins fold. |
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Palavras-Chave: |
Amino acid residues; Blue Star STING; Estrutura secundária de proteína; Kolmogorov-Smirnov test; MANOVA; Protein secondary structure elements; Student's t-test; Teste estatístico. |
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Thesagro: |
Aminoácido; Proteína. |
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Thesaurus Nal: |
Amino acids; Proteins; Statistical analysis. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180038/1/journal.pone.0200018.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registro |
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URL |
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| Registros recuperados : 42 | |
| 7. |  | SANTOS, R. V. dos; VILLALTA-ROMERO, F.; STANISIC, D.; BORRO, L.; NESHICH, G.; TASIC, L. Citrus bioflavonoid, hesperetin, as inhibitor of two thrombin-like snake venom serine proteases isolated from Crotalus simus. Toxicon, v. 143, p. 36-43, Mar. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 8. | | FULAZ, S. F.; CABRINI, F. M.; BORRO, L.; TASIC, L.; NESHICH, G. Computational Biology tools in design of an agrochemical against Xylella fastidiosa. In: CONGRESS OF THE INTERNATIONAL UNION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 23.; ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN SOCIETY FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 44., 2015, Foz do Iguaçu. Biochemistry for a better world: abstracts book. [Foz do Iguaçu]: SBBq, 2015. p. 143. C.016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; NESHICH, G. Electrostatic potential at the alpha carbon atoms along the alpha helices and beta strands. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 37.; CONGRESS OF THE PAN-AMERICAN ASSOCIATION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 11, 2008, Águas de Lindóia. Program and index... Águas de Lindóia, Program and index... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. Não paginado. PABMB.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 11. | | SCHULTZ, L. G.; VILLALTAROMERO, F.; BORRO, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G.; TASIC, L. The host/guest interactions of the key protein for the bipolar disorder. In: ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN SOCIETY FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 45., 2016, Natal. Livro de resumos... [Natal]: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2016. Não paginado. Na publicação: José Jardine.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 13. | | BORRO, L. C.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Improving binding affinity prediction by using a rule-based model with physical-chemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. In: CONGRESS OF THE INTERNATIONAL UNION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 23.; ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN SOCIETY FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 44., 2015, Foz do Iguaçu. Biochemistry for a better world: abstracts book. [Foz do Iguaçu]: SBBq, 2015. p. 153. C.047.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 14. | | SALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Multiple structure single parameter: analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins. Bioinformatics, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 16. | | MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Studying structure function relationship of proteins using "remediated" PDB files. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 37.; CONGRESS OF THE PAN-AMERICAN ASSOCIATION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 11, 2008, Águas de Lindóia. Program and index... Águas de Lindóia, Program and index... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. Não paginado. PABMB.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 17. | | JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; NESHICH, G. Signature contact coordination patterns for secondary structure elements in protein structures. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 37.; CONGRESS OF THE PAN-AMERICAN ASSOCIATION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 11, 2008, Águas de Lindóia. Program and index... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. Não paginado. PABMB.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | MAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Study of specific nanoenvironments containing [alfa]-helices in all-[alfa] and ([alfa]+[beta])+([alfa]/[beta]) proteins. Plos One, v. 13, n. 7, p. 1-25, 2018. Artigo e0200018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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