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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
Data corrente: |
17/02/2016 |
Data da última atualização: |
17/02/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MÜLLER, B. S. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; ABREU, A. G.; BORBA, T. C. O.; SAKAMOTO, T.; BRONDANI, C.; BARROS, E. G.; VIANELLO, R. P. |
Afiliação: |
BARBARA S. F. MÜLLER, BIOAGRO; GEORGIOS J. PAPPAS JUNIOR, UNB; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; GESIMARIA RIBEIRO COSTA COELHO, CNPAF; IVANDILSON P. P. DE MENEZES, INSTITUTO FEDERAL GOIANO, Urutaí-GO; ALUANA GONCALVES DE ABREU, CNPAF; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; TETSU SAKAMOTO, UFMG; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; EVERALDO G. BARROS, BIOAGRO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
Título: |
An operational SNP panel integrated to SSR marker for the assessment of genetic diversity and population structure of the common bean. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporter, v. 33, n. 6, p. 1697-1711, Dec. 2015. |
DOI: |
10.1007/s11105-015-0866-x |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The common bean, an important source of protein and minerals for humans, complements cereals both nutritionally and as a rotation crop, supplying nitrogen and reducing soil pathogens. The aim of this study was to develop an operational SNP-based panel for common bean in order to facilitate SSR employment in genetic diversity and population structure analyses, and its use in breeding programs. A set of 88 diverse and important common bean cultivars/lines (53), landraces (33) and wild accessions (2) were genotyped. Overall, the 58 SSRs performed better at evaluating genetic diversity (Ā=7.38; He=58.7 %; PI=1.20E−45) than the 345 SNPs, of which the SSRs dinucleotides (SSR-di) were more informative (Ā=9.92; He=72.5 %; PI=3.40E−26) and a selected set of 13 SSRs (Ā=15.31/locus; He=84.5 %; PI=1.03E−19) allowed for the discrimination of all individuals. For the 345 high-quality scored SNPs a low combined PI (4.70E −119) and high PE (100 %) was obtained for the assessment of parentage and identity. The SNPs were very useful for linkage mapping in inter- (78.2 %) and intra-gene pool (17.7 %) crosses. Both markers afforded high resolution detection of inter-gene pool structure, with greater differentiation based on SNPs (K=2, FST=0.759). The SSRs-di differentiated cultivars/lines and landraces (K=3) of Mesoamerican origin. A set of 16 SSRs was selected to establish a routine and operational analysis of Genbank accessions allowing an efficient origin-based discrimination of common bean accessions. Operational genotyping panels based on SSRs and SNPs were derived, contributing to the growing integration of genomics with molecular breeding programs of the common bean. MenosThe common bean, an important source of protein and minerals for humans, complements cereals both nutritionally and as a rotation crop, supplying nitrogen and reducing soil pathogens. The aim of this study was to develop an operational SNP-based panel for common bean in order to facilitate SSR employment in genetic diversity and population structure analyses, and its use in breeding programs. A set of 88 diverse and important common bean cultivars/lines (53), landraces (33) and wild accessions (2) were genotyped. Overall, the 58 SSRs performed better at evaluating genetic diversity (Ā=7.38; He=58.7 %; PI=1.20E−45) than the 345 SNPs, of which the SSRs dinucleotides (SSR-di) were more informative (Ā=9.92; He=72.5 %; PI=3.40E−26) and a selected set of 13 SSRs (Ā=15.31/locus; He=84.5 %; PI=1.03E−19) allowed for the discrimination of all individuals. For the 345 high-quality scored SNPs a low combined PI (4.70E −119) and high PE (100 %) was obtained for the assessment of parentage and identity. The SNPs were very useful for linkage mapping in inter- (78.2 %) and intra-gene pool (17.7 %) crosses. Both markers afforded high resolution detection of inter-gene pool structure, with greater differentiation based on SNPs (K=2, FST=0.759). The SSRs-di differentiated cultivars/lines and landraces (K=3) of Mesoamerican origin. A set of 16 SSRs was selected to establish a routine and operational analysis of Genbank accessions allowing an efficient orig... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Diversity pattern; Genetic structure; Molecular breeding. |
Thesagro: |
Feijão; Phaseolus vulgaris; Variação genética. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
LEADER 02750naa a2200325 a 4500 001 2037381 005 2016-02-17 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11105-015-0866-x$2DOI 100 1 $aMÜLLER, B. S. F. 245 $aAn operational SNP panel integrated to SSR marker for the assessment of genetic diversity and population structure of the common bean.$h[electronic resource] 260 $c2015 520 $aThe common bean, an important source of protein and minerals for humans, complements cereals both nutritionally and as a rotation crop, supplying nitrogen and reducing soil pathogens. The aim of this study was to develop an operational SNP-based panel for common bean in order to facilitate SSR employment in genetic diversity and population structure analyses, and its use in breeding programs. A set of 88 diverse and important common bean cultivars/lines (53), landraces (33) and wild accessions (2) were genotyped. Overall, the 58 SSRs performed better at evaluating genetic diversity (Ā=7.38; He=58.7 %; PI=1.20E−45) than the 345 SNPs, of which the SSRs dinucleotides (SSR-di) were more informative (Ā=9.92; He=72.5 %; PI=3.40E−26) and a selected set of 13 SSRs (Ā=15.31/locus; He=84.5 %; PI=1.03E−19) allowed for the discrimination of all individuals. For the 345 high-quality scored SNPs a low combined PI (4.70E −119) and high PE (100 %) was obtained for the assessment of parentage and identity. The SNPs were very useful for linkage mapping in inter- (78.2 %) and intra-gene pool (17.7 %) crosses. Both markers afforded high resolution detection of inter-gene pool structure, with greater differentiation based on SNPs (K=2, FST=0.759). The SSRs-di differentiated cultivars/lines and landraces (K=3) of Mesoamerican origin. A set of 16 SSRs was selected to establish a routine and operational analysis of Genbank accessions allowing an efficient origin-based discrimination of common bean accessions. Operational genotyping panels based on SSRs and SNPs were derived, contributing to the growing integration of genomics with molecular breeding programs of the common bean. 650 $aFeijão 650 $aPhaseolus vulgaris 650 $aVariação genética 653 $aDiversity pattern 653 $aGenetic structure 653 $aMolecular breeding 700 1 $aPAPPAS JUNIOR, G. J. 700 1 $aVALDISSER, P. A. M. R. 700 1 $aCOELHO, G. R. C. 700 1 $aMENEZES, I. P. P. de 700 1 $aABREU, A. G. 700 1 $aBORBA, T. C. O. 700 1 $aSAKAMOTO, T. 700 1 $aBRONDANI, C. 700 1 $aBARROS, E. G. 700 1 $aVIANELLO, R. P. 773 $tPlant Molecular Biology Reporter$gv. 33, n. 6, p. 1697-1711, Dec. 2015.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado. |
Data corrente: |
20/11/2020 |
Data da última atualização: |
20/11/2020 |
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Autoria: |
AGUILA, L. S. H. D.; COSTA, V. S. da; VASQUES, S. R.; SILVA, S. M. da; VIEIRA, P. A.; SINNEMANN, C.; CAMPOS, A. D. S. de; ÁVILA, A. F.; LEITE, T. M.; SOARES, V. de A.; ALVES, A. C. de O.; ALVES, B. R. S. |
Afiliação: |
LILIA SICHMANN HEIFFIG DEL AGUILA, CPACT; VAGNER SCOUTO DA COSTA; SHAMILY RODRIGUES VASQUES; SABRINA MONCKS DA SILVA; PAOLA ACOSTA VIEIRA; CAMILA SINNEMANN; ALEXSSANDRA DAYANE SOARES DE CAMPOS; AMANDA FISS ÁVILA; THALIA MARTINS LEITE; VANESSA DE ÁVILA SOARES; ANA CAROLINA DE OLIVEIRA ALVES; BRUNA REGINA SOUZA ALVES. |
Título: |
Efeito do arranjo de plantas e do sistema de cultivo na produtividade da soja em condições ambientais de terras baixas. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2020. |
Páginas: |
14 p. |
Série: |
(Embrapa Clima Temperado. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 335). |
ISSN: |
1678-2518 |
Idioma: |
Português |
Notas: |
ODS. |
Conteúdo: |
Os planossolos das terras baixas do Rio Grande do Sul caracterizam-se por apresentar horizonte A superficial e horizonte B com capacidade de percolação muito baixa, o que provoca longos períodos de encharcamento após chuvas e prejudica o desenvolvimento e a produtividade da soja. Para evitar esses problemas, são necessários sistemas de drenagem adequados e o aprimoramento de sistemas de preparo do solo e de cultivo que proporcionem condições mais secas na lavoura. O presente trabalho teve por ob-jetivo determinar o arranjo espacial de plantas e o sistema de cultivo de soja mais adequado para as terras baixas do Rio Grande do Sul. Dois experimentos foram conduzidos na Estação Experimental Terras Baixas da Embrapa Clima Temperado, em Capão do Leão, RS. O primeiro, na safra 2016/2017, diferenciou o potencial produtivo de cultivares indicadas para terras baixas, sendo a cultivar BMX Icone RR a mais produtiva, com 4.073 kg ha1 de grãos, enquanto outras dez cultivares produziram em média 3.021 kg ha1. No segundo experimento, na safra 2018/2019, somente a cultivar BMX Icone RR foi adotada. Foram avaliados dois preparos de solo (convencional e sulco/camalhão) e três arranjos de plantas (230 mil, 330 mil e 430 mil plantas ha1). Os parâmetros avaliados foram: altura de plantas; altura de inserção da primeira vagem; número de ramificações da haste principal; massa de grãos; número de grãos e vagens por planta e produtividade de grãos. O sulco-camalhão com 330 mil plantas ha1, com espaçamento entrelinhas de 35 cm sobre camalhão propiciou o melhor desempenho geral da cultura e melhor produtividade. MenosOs planossolos das terras baixas do Rio Grande do Sul caracterizam-se por apresentar horizonte A superficial e horizonte B com capacidade de percolação muito baixa, o que provoca longos períodos de encharcamento após chuvas e prejudica o desenvolvimento e a produtividade da soja. Para evitar esses problemas, são necessários sistemas de drenagem adequados e o aprimoramento de sistemas de preparo do solo e de cultivo que proporcionem condições mais secas na lavoura. O presente trabalho teve por ob-jetivo determinar o arranjo espacial de plantas e o sistema de cultivo de soja mais adequado para as terras baixas do Rio Grande do Sul. Dois experimentos foram conduzidos na Estação Experimental Terras Baixas da Embrapa Clima Temperado, em Capão do Leão, RS. O primeiro, na safra 2016/2017, diferenciou o potencial produtivo de cultivares indicadas para terras baixas, sendo a cultivar BMX Icone RR a mais produtiva, com 4.073 kg ha1 de grãos, enquanto outras dez cultivares produziram em média 3.021 kg ha1. No segundo experimento, na safra 2018/2019, somente a cultivar BMX Icone RR foi adotada. Foram avaliados dois preparos de solo (convencional e sulco/camalhão) e três arranjos de plantas (230 mil, 330 mil e 430 mil plantas ha1). Os parâmetros avaliados foram: altura de plantas; altura de inserção da primeira vagem; número de ramificações da haste principal; massa de grãos; número de grãos e vagens por planta e produtividade de grãos. O sulco-camalhão com 330 mil plantas ha1, com espaç... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Drenagem; Soja; Solo Hidromórfico. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/218059/1/Boletim-335.pdf
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Marc: |
LEADER 02619nam a2200325 a 4500 001 2126890 005 2020-11-20 008 2020 bl uuuu u0uu1 u #d 022 $a1678-2518 100 1 $aAGUILA, L. S. H. D. 245 $aEfeito do arranjo de plantas e do sistema de cultivo na produtividade da soja em condições ambientais de terras baixas.$h[electronic resource] 260 $aPelotas: Embrapa Clima Temperado$c2020 300 $a14 p. 490 $a(Embrapa Clima Temperado. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 335). 500 $aODS. 520 $aOs planossolos das terras baixas do Rio Grande do Sul caracterizam-se por apresentar horizonte A superficial e horizonte B com capacidade de percolação muito baixa, o que provoca longos períodos de encharcamento após chuvas e prejudica o desenvolvimento e a produtividade da soja. Para evitar esses problemas, são necessários sistemas de drenagem adequados e o aprimoramento de sistemas de preparo do solo e de cultivo que proporcionem condições mais secas na lavoura. O presente trabalho teve por ob-jetivo determinar o arranjo espacial de plantas e o sistema de cultivo de soja mais adequado para as terras baixas do Rio Grande do Sul. Dois experimentos foram conduzidos na Estação Experimental Terras Baixas da Embrapa Clima Temperado, em Capão do Leão, RS. O primeiro, na safra 2016/2017, diferenciou o potencial produtivo de cultivares indicadas para terras baixas, sendo a cultivar BMX Icone RR a mais produtiva, com 4.073 kg ha1 de grãos, enquanto outras dez cultivares produziram em média 3.021 kg ha1. No segundo experimento, na safra 2018/2019, somente a cultivar BMX Icone RR foi adotada. Foram avaliados dois preparos de solo (convencional e sulco/camalhão) e três arranjos de plantas (230 mil, 330 mil e 430 mil plantas ha1). Os parâmetros avaliados foram: altura de plantas; altura de inserção da primeira vagem; número de ramificações da haste principal; massa de grãos; número de grãos e vagens por planta e produtividade de grãos. O sulco-camalhão com 330 mil plantas ha1, com espaçamento entrelinhas de 35 cm sobre camalhão propiciou o melhor desempenho geral da cultura e melhor produtividade. 650 $aDrenagem 650 $aSoja 650 $aSolo Hidromórfico 700 1 $aCOSTA, V. S. da 700 1 $aVASQUES, S. R. 700 1 $aSILVA, S. M. da 700 1 $aVIEIRA, P. A. 700 1 $aSINNEMANN, C. 700 1 $aCAMPOS, A. D. S. de 700 1 $aÁVILA, A. F. 700 1 $aLEITE, T. M. 700 1 $aSOARES, V. de A. 700 1 $aALVES, A. C. de O. 700 1 $aALVES, B. R. S.
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