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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
26/08/2014 |
Data da última atualização: |
19/06/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
GOMES, D. F.; BATISTA, J. S. da S.; ROLLA, A. A. P.; SILVA, L. P. da; BLOCH, C.; GALLI-TARASAWA, L. V.; HUNGRIA, M. |
Afiliação: |
DOUGLAS FABIANO GOMES, Departamento de Génetica UFPR; JESSIANE STEFÂNIA DA SILVA BATISTA, DEBIOGEM UEPG; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA; LUCIANO PAULINO DA SILVA, CENARGEN; CARLOS BLOCH JUNIOR, Cenargen; LYGIA VITORIA GALLI TERASAWA, Departamento de Génetica UFPR; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
Título: |
Proteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens: highlighting potential determinants of a successful symbiosis |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 15, n. 643, 2014. |
DOI: |
10.1186/1471-2164-15-643 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Strain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics and gene-expression assays ? resulted in new information about unknown genes that might play important roles in the establishment of the symbiosis with soybean. MenosStrain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
RT-qPCR; Two-dimensional proteomics. |
Thesaurus Nal: |
Bradyrhizobium; nitrogen fixation; symbiosis. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160837/1/12864-2014-Article-6775.pdf
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Marc: |
LEADER 02463naa a2200265 a 4500 001 1993458 005 2017-06-19 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1186/1471-2164-15-643$2DOI 100 1 $aGOMES, D. F. 245 $aProteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens$bhighlighting potential determinants of a successful symbiosis$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aStrain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics and gene-expression assays ? resulted in new information about unknown genes that might play important roles in the establishment of the symbiosis with soybean. 650 $aBradyrhizobium 650 $anitrogen fixation 650 $asymbiosis 653 $aRT-qPCR 653 $aTwo-dimensional proteomics 700 1 $aBATISTA, J. S. da S. 700 1 $aROLLA, A. A. P. 700 1 $aSILVA, L. P. da 700 1 $aBLOCH, C. 700 1 $aGALLI-TARASAWA, L. V. 700 1 $aHUNGRIA, M. 773 $tBMC Genomics$gv. 15, n. 643, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
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Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
Data corrente: |
03/04/2017 |
Data da última atualização: |
04/07/2017 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
FARIA, M. R.; GUIMARÃES, R. A.; PEREIRA, P. F.; PINTO, F. A. M. F.; BETTIOL, W.; MEDEIROS, H. V. |
Afiliação: |
M. R. FARIA, UFV; R. A. GUIMARÃES, UFV; P. F. PEREIRA, UFV; F. A. M. F. PINTO, UFV; WAGNER BETTIOL, CNPMA; H. V. MEDEIROS, UFV. |
Título: |
Contribuição de resíduos orgânicos nas propriedades do solo e sobrevivência de Stenocarpella em colmos de milho. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO BRASILEIRA DE CONTROLE BIOLÓGICO DE DOENÇAS DE PLANTAS, 12.; SIMPÓSIO DE MANEJO DE DOENÇAS DE PLANTAS, 16., 2016, Lavras. Integrando técnicas para entregar resultados: resumos... Lavras: NEFIT, 2016. |
Páginas: |
p. 206. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Sistema de plantio direto de milho associado ao monocultivo pode contribuir para o aumento da sobrevivência de patógenos na palhada da cultura no campo, o que ocasiona elevação da incidência de doenças como as causadas por fungos do gênero Stenocarpella. Uma estratégia para reduzir o tempo de sobrevivência destes agentes patogênicos é através da aplicação de microrganismos e matéria orgânica no solo. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da aplicação de resíduos orgânicos no solo e sobre a sobrevivência de Stenocarpella em caules de milho em Lavras e Sete Lagoas. Os caules de milho infestado com o patógeno foram mantidos no campo por três meses após a aplicação de resíduos orgânicos [cama de frango (CF), esterco de suínos (ES), hidrolisado de peixe (HP), lodo de esgoto (LE)] e ureia. Colmos com o patógeno, mas sem a adição de resíduos foram mantidos na superfície ou incorporados ao solo representando os controle negativo e positivo. Foram feitas avaliações da atividade microbiana [B-glicosidase e Hidrolise de diacetato de fluoresceína (FDA)], análise química do solo e dinâmica da população do patógeno através de qPCR. Em Lavras e Sete Lagoas o teor de cálcio aumentou quando CF foi aplicada no solo e em Sete Lagoas, ES também elevou o fator de Ca no solo. CF contribuiu para aumento no teor de N e C total do solo, em Sete Lagoas e Lavras. O aumento da atividade B-glicosidase ocorreu para HP, LE, CF e ureia em Lavras e em Sete Lagoas somente HP e ureia. Ocorreu aumento da hidrólise da FDA em Lavras para CF, ureia, e os controles negativo e positivo. Em Sete Lagoas, a hidrólise FDA aumentou no solo com CF, HP, ES e ureia. Os tratamentos com colmo na superfície e colmos enterrados nos dois locas apresentaram a maior redução do patógeno, seguido por LE em Lavras e, HP e LE em Sete Lagoas. Hidrolisado de peixe e lodo de esgoto são promissores na indução de supressividade, pois elevaram a atividade enzimática do solo e reduziram a quantidade de patógeno. MenosSistema de plantio direto de milho associado ao monocultivo pode contribuir para o aumento da sobrevivência de patógenos na palhada da cultura no campo, o que ocasiona elevação da incidência de doenças como as causadas por fungos do gênero Stenocarpella. Uma estratégia para reduzir o tempo de sobrevivência destes agentes patogênicos é através da aplicação de microrganismos e matéria orgânica no solo. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da aplicação de resíduos orgânicos no solo e sobre a sobrevivência de Stenocarpella em caules de milho em Lavras e Sete Lagoas. Os caules de milho infestado com o patógeno foram mantidos no campo por três meses após a aplicação de resíduos orgânicos [cama de frango (CF), esterco de suínos (ES), hidrolisado de peixe (HP), lodo de esgoto (LE)] e ureia. Colmos com o patógeno, mas sem a adição de resíduos foram mantidos na superfície ou incorporados ao solo representando os controle negativo e positivo. Foram feitas avaliações da atividade microbiana [B-glicosidase e Hidrolise de diacetato de fluoresceína (FDA)], análise química do solo e dinâmica da população do patógeno através de qPCR. Em Lavras e Sete Lagoas o teor de cálcio aumentou quando CF foi aplicada no solo e em Sete Lagoas, ES também elevou o fator de Ca no solo. CF contribuiu para aumento no teor de N e C total do solo, em Sete Lagoas e Lavras. O aumento da atividade B-glicosidase ocorreu para HP, LE, CF e ureia em Lavras e em Sete Lagoas somente HP e ureia. Ocorreu aumento d... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Stenocarpella macrospora. |
Thesagro: |
Resteva; Zea Mays. |
Thesaurus NAL: |
Stenocarpella maydis. |
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/161301/1/2016RA-015.pdf
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Marc: |
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Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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