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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
03/12/2014 |
Data da última atualização: |
03/12/2014 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BEVITORI, R.; OLIVEIRA, M. B.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; LANNA, A. C.; SILVEIRA, R. D. da; PETROFEZA, S. |
Afiliação: |
ROSANGELA BEVITORI, CNPAF; MARILIA BARROS OLIVEIRA, doutoranda UFG; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN; ANNA CRISTINA LANNA, CNPAF; RICARDO DIÓGENES DA SILVEIRA; SILVANA PETROFEZA, UFG. |
Título: |
Selection of optimized candidate reference genes for qRT-PCR normalization in rice (Oryza sativa L.) during Magnaporthe oryzae infection and drought. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 9795-9805, 2014. |
ISSN: |
1676-5680 |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/2014.November.27.7 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Drought and rice blast disease caused by Magnaporthe oryzae are two of the most serious threats to global rice production. To explore the mechanisms underlying gene expression induced in rice by stresses, studies involving transcriptome analyses have been conducted over the past few years. Thus, it is crucial to have a reliable set of reference genes to normalize the expression levels of rice genes affected by different stresses. To identify potential reference genes for studies of the differential expression of target genes in rice under M. oryzae infection and drought conditions, the present study evaluated five housekeeping genes for the normalization of gene expression. The stability of the expression of these genes was assessed using the analytical software packages geNorm and NormFinder. For all samples analyzed, the stability rank was UBQ5 > GAPDH > eIF-4α > β-TUB > 18S rRNA. The data showed that the UBQ5, GAPDH, and eIF-4α genes are appropriate, high-performing reference genes and will be highly useful in future expression studies of fungal infections and drought in rice. |
Thesagro: |
Arroz; Brusone; Doença de planta; Genética molecular; Oryza sativa; Seca. |
Thesaurus Nal: |
Blast disease; Gene expression; Magnaporthe oryzae; Rice. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112900/1/gmr4195.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179634/1/gmr4195.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Registros recuperados : 61 | |
42. | | DELTEIL, A.; BLEIN, M.; FAIVRE-RAMPANT, O.; GUELLIM, A.; ESTEVAN, J.; HIRSCH, J.; BEVITORI, R.; MICHEL, C.; MOREL, J.-B. Building a mutant resource for the study of disease resistance in rice reveals the pivotal role of several genes involved in defence. Molecular Plant Pathology, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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43. | | BEVITORI, R.; MARGIS, M. M. P.; SILVEIRA, R. D. D.; ABREU, J.; SILVA, A. B.; ORTEGA, J. M. Genômica funcional: mutagênese insercional como fonte de descoberta de novos genes para o melhoramento de arroz (Oryza sativa (L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CADEIA PRODUTIVA DE ARROZ, 2.; REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ, 8., 2006, Brasília, DF. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2006. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 196).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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44. | | BEVITORI, R.; OLIVEIRA, M. B.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; LANNA, A. C.; SILVEIRA, R. D. da; PETROFEZA, S. Selection of optimized candidate reference genes for qRT-PCR normalization in rice (Oryza sativa L.) during Magnaporthe oryzae infection and drought. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 9795-9805, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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45. | | BEVITORI, R.; MEYERS, B.; NAKANO, M.; JAIN, G.; PAPPAS, G. J.; FRAGOSO, R.; TRISTAN, I.; SÁ, M. F. G. de. Transcriptome profiling of Magnaporthe grisea-infected rice using next-generation sequencing. In: INTERNATIONAL PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 9., 2009, St. Louis. Conference program. St. Louis: International Society for Plant Molecular Biology; University of Missouri, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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46. | | BEVITORI, R.; MEYERS, B. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; NAKANO, M.; JAIN, G.; FRAGOSO, R. R.; LOURENCO, I. T.; GROSSI-DE-SA, M. F. Application of next generation sequencing to study rice blast disease. In: INTERNATIONAL RICE BLAST CONFERENCE, 5., 2010, Little Rock, Arkansas. Proceedings... Little Rock, Arkansas: USDA-ARS: University of Arkansas, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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47. | | BEVITORI, R.; MEYERS, B. C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; NAKANO, M.; JAIN, G.; FRAGOSO, R. R.; LOURENCO, I. T.; GROSSI-DE-SA, M. F. Application of next generation sequencing to study rice blast disease. In: INTERNATIONAL RICE BLAST CONFERENCE, 5., 2010, Little Rock, Arkansas. Proceedings... Little Rock, Arkansas: USDA-ARS: University of Arkansas, 2010. p. 69.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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48. | | BEVITORI, R.; REIS, M. S.; DIÓGENES, R.; BRONDANI, R. V.; DA SILVA, F. R.; DE PAULA, A. W. M; GROSSI DE SÁ, M. F. Identificação de seqüências expressas etiquetadas (ESTs) envolvidas na interação de arroz e do fungo causador da brusone (Magnaphorte grisea). In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGAS, 2., 2007, Brasília, DF. II Workshop Interação Molecular Planta-Praga. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 144-146. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 229).Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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49. | | BEVITORI, R.; SIRCAR, S.; TOGAWA, R. C.; CÔRTES, M. V. de C. B.; OLIVEIRA, T. S.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; PAREKH, N. Identification of co-expression gene networks controlling rice blast disease during an incompatible reaction. Genetics and Molecular Research, v. 19, n. 3, gmr18579, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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50. | | BEVITORI, R.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; GRYNBERG, P.; GUIMARÃES, L. S. M.; ABREU, A. G. de; MELLO, R.; GROSSI DE SÁ, M. F. Transcriptome profiling of twonear-isogenic rice lines infected by Magnaporthe oryzae using RNA-SEQ. In: CONFERENCIA INTERNACIONAL DO ARROZ PARA AMÉRICA LATINA E CARIBE, 12., 2015, Porto Alegre. Horizonte para a competitividade: anais. Porto Alegre: IRGA, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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51. | | BEVITORI, R.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; GRYNBERG, P.; GUIMARÃES, L. S. M.; ABREU, A. G. de; MELLO, R.; GROSSI DE SÁ, M. F. Transcriptome profiling of twonear-isogenic rice lines infected by Magnaporthe oryzae using RNA-SEQ. In: CONFERENCIA INTERNACIONAL DO ARROZ PARA AMÉRICA LATINA E CARIBE, 12., 2015, Porto Alegre. Horizonte para a competitividade: anais. Porto Alegre: IRGA, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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52. | | NEPOMUCENO, A. L.; VELOSO, J. F.; CARNEIRO, N.; BINNECK, E.; PEDROSO, J.; MARIN, S. R.; BRETON, M.; MARTINS, P. K.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A.; BEVITORI, R.; STRALIOTTO, R.; BOITEAUX, L.; FONSECA, M. E. N. Genoma funcional de raízes de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 2.; MERCOSOJA 2002, 2002, Foz do Iguaçu. Perspectivas do agronegócio da soja: resumos. Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 15. (Embrapa Soja. Documentos, 181). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann-Campo.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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53. | | NEPOMUCENO, A. L.; VELOSO, J. F.; CARNEIRO, N.; BINNECK, E.; PEDROSO, J.; MARIN, S. R.; BRETON, M.; MARTINS, P. K.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A.; BEVITORI, R.; STRALIOTTO, R.; BOITEAUX, L.; FONSECA, M. E. N. Genoma funcional de raízes de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 2.; MERCOSOJA 2002, 2002, Foz do Iguaçu. Perspectivas do agronegócio da soja: resumos. Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 15. (Embrapa Soja. Documentos, 181). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann-Campo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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54. | | MEHTA, A.; BRASILEIRO, A. C. M.; SOUZA, D. S. L.; ROMANO, E.; CAMPOS, M. A.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; SILVA, M. S.; FRANCO, O. L.; FRAGOSO, R. R.; BEVITORI, R.; ROCHA, T. L. Plant-pathogen interactions: what is proteomics telling us? The FEBS Journal, v. 275, n. 15, p. 3731-3746, Aug. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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55. | | MEHTA, A.; BRASILEIRO, A. C. M.; SOUZA, D. S. L.; ROMANO, E.; CAMPOS, M. A.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; SILVA, M. S.; FRANCO, O. L.; FRAGOSO, R. R.; BEVITORI, R.; ROCHA, T. L. Plant-pathogen interactions: what is proteomics telling us? The FEBS Journal, v. 275, n. 15, p. 3731-3746, Aug. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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56. | | TÁVORA, F. T. P. K.; BEVITORI, R.; MELLO, R. N. de; CINTRA, M. M. D. F.; OLIVEIRA NETO, O. B.; FONTES, W.; CASTRO, M. S.; SOUSA, M. V.; FRANCO, O. L.; REIS, A. M. dos. Shotgun proteomics coupled to transient-inducible gene silencing reveal rice susceptibility genes as new sources for blast disease resistance. Journal of Proteomics, v. 241, 104223, June 2021. Na publicação: Angela Mehta.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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57. | | NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C. Aluminum-induced genes in grass species. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 185. AB3C X-meeting 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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58. | | NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R. D.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C. Aluminum-induced genes in grass species. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 185. AB3C X-meeting 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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59. | | NODA, R. W.; GUIMARÃES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. P.; MAGALHÃES, J. V. D.; COSTA, M. M. C.; SILVA, F. R. D.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C. Aluminum-induced genes in grass species. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 185.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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60. | | NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; CARNEIRO, N.; NINNECK, E.; PEDROSO, J.; MARIN, S. R.; BRETON, M.; MARTINS, P. K.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A. A.; BEVITORI, R.; STRALIOTTO, R.; BOITEUX, L.; FONSECA, M. E. N.; PAIVA, G.; CASTRO, L. A. B. Análise genômica funcional em soja. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 24., 2002, São Pedro, SP. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 206-207. (Embrapa Soja. Documentos, 185).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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