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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
10/06/2016 |
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Data da última atualização: |
08/11/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TUPINAMBÁ, D. D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y. A.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. |
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Afiliação: |
DAIVA DOMENECH TUPINAMBÁ, UCB; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; OHANA YONARA ASSIS COSTA, UCB; JÉSSICA CARVALHO BERGMANN, UCB; RICARDO HENRIQUE KRUGER, UNB; CYNTHIA MARIA KYAW, UNB; CRISTINE CHAVES BARRETO, UCB; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE. |
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Título: |
Archaeal community changes associated with cultivation of amazon forest soil with oil palm. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Archaea, Cairo, v. 2016, article ID 3762159, 14 p., 2016. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1155/2016/3762159 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: This study compared soil archaeal communities of the Amazon forest with that of an adjacent area under oil palm cultivation by 16S ribosomal RNA gene pyrosequencing. Species richness and diversity were greater in native forest soil than in the oil palm-cultivated area, and 130 OTUs (13.7%) were shared between these areas. Among the classified sequences, Thaumarchaeota were predominant in the native forest, whereas Euryarchaeota were predominant in the oil palm-cultivated area. Archaeal species diversity was 1.7 times higher in the native forest soil, according to the Simpson diversity index, and the Chao1 index showed that richness was five times higher in the native forest soil. A phylogenetic tree of unclassified Thaumarchaeota sequences showed that most of the OTUs belong to Miscellaneous Crenarchaeotic Group. Several archaeal genera involved in nutrient cycling (e.g., methanogens and ammonia oxidizers) were identified in both areas, but significant differences were found in the relative abundances of Candidatus Nitrososphaera and unclassified Soil Crenarchaeotic Group (prevalent in the native forest) and Candidatus Nitrosotalea and unclassified Terrestrial Group (prevalent in the oil palm-cultivated area). More studies are needed to culture some of these Archaea in the laboratory so that their metabolism and physiology can be studied. |
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Palavras-Chave: |
Archaeal; Área adjacente sob cultivo; Comunidades arcaicas; Comunidades microbianas; Floresta amazônica; Genômica; Mata nativa; Óleo de palma; Palma de óleo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02341naa a2200325 a 4500
001 2046765
005 2016-11-08
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1155/2016/3762159$2DOI
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520 $aAbstract: This study compared soil archaeal communities of the Amazon forest with that of an adjacent area under oil palm cultivation by 16S ribosomal RNA gene pyrosequencing. Species richness and diversity were greater in native forest soil than in the oil palm-cultivated area, and 130 OTUs (13.7%) were shared between these areas. Among the classified sequences, Thaumarchaeota were predominant in the native forest, whereas Euryarchaeota were predominant in the oil palm-cultivated area. Archaeal species diversity was 1.7 times higher in the native forest soil, according to the Simpson diversity index, and the Chao1 index showed that richness was five times higher in the native forest soil. A phylogenetic tree of unclassified Thaumarchaeota sequences showed that most of the OTUs belong to Miscellaneous Crenarchaeotic Group. Several archaeal genera involved in nutrient cycling (e.g., methanogens and ammonia oxidizers) were identified in both areas, but significant differences were found in the relative abundances of Candidatus Nitrososphaera and unclassified Soil Crenarchaeotic Group (prevalent in the native forest) and Candidatus Nitrosotalea and unclassified Terrestrial Group (prevalent in the oil palm-cultivated area). More studies are needed to culture some of these Archaea in the laboratory so that their metabolism and physiology can be studied.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 57 | |
| 23. |  | SILVA, M. V. G. B. da; BERGMANN, J. A. G.; MARTINEZ, M. L.; PEREIRA, C. S.; FERRAZ, J. B. S.; SILVA, H. C. M. da. Associação genética, fenotípica e de ambiente entre medidas de eficiência reprodutiva e produção de leite na raça Holandesa. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 27, n. 6, p. 1115-1122, 1998.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 24. | | TUPINAMBÁ, D. D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y. A.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Archaeal community changes associated with cultivation of amazon forest soil with oil palm. Archaea, Cairo, v. 2016, article ID 3762159, 14 p., 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 25. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBA, D. D.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Avaliação da diversidade microbiana do processo de produção de etanol de cana-de-açúcar por meio de abordagem independente de cultivo. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. 111 - 112| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 28. | | SALES, R. M. M.; SOUTO, B. de M.; BERGMANN, J. C.; LACERDA, V. A. M.; CARVALHO JÚNIOR, A. R. de; BARBOSA, M. F.; QUIRINO, B. F. Caracterização da [Beta]glicosidase Bgl08 de rúmen de caprino com potencial uso na indústria de alimentos. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 23.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 29. | | FREITAS, L. S.; VERNEQUE, R. S.; SILVA, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TEODORO, R. L.; VALENTE, B. D.; BERGMANN, J. A. G. Avaliação da persistência na lactação da raça Guzerá utilizando modelos de regressão aleatória. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 30. | | QUIRINO, B. F.; BERGMANN, J. C.; RAMOS, N. S. P. L.; PALUAN, S. de F.; SOUTO, B. de M.; RODRIGUES, L. P.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H. Colocando a biodiversidade microbiana brasileira a serviço da indústria de biocombustíveis. In: SIMPÓSIO MICRORGANISMOS EM AGROENERGIAS, 2012, Brasília, DF. Da prospecção aos bioprocessos: anais. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2013. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 15). p. 23-30.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 31. | | ASSIS, J. B. de; LAAT, D. M. de; PEIXOTO, M. G. C. D.; BERGMANN, J. A. G.; FONSECA, C. G.; CARVALHO, M. R. S. Genetic diversity and population structure in Brazilian Mangalarga Marchador horses. Genetics and Molecular Research, v. 8, n. 4, p. 1519-1524, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 32. | | TRICHEZ, D.; STEINDORFF, A. S.; MORAIS JÚNIOR, W. G. de; VILELA, N.; BERGMANN, J. C.; FORMIGHIERI, E. F.; GONCALVES, S. B.; ALMEIDA, J. R. M. de. Identification of traits to improve co-assimilation of glucose and xylose by adaptive evolution of Spathaspora passalidarum and Scheffersomyces stipitis yeasts. Applied Microbiology and Biotechnology, n. 107, p. 1143?1157, Feb. 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 33. | | RIBEIRO, S. H. A.; PEREIRA, J. C. C.; VERNEQUE, R. da S.; SILVA, M. A.; BERGMANN, J. A. G.; LEDIC, I. L.; MORAIS, O. R. Efeitos da origem e da linhagem do DNA mitocondrial sobre características produtivas e reprodutivas de bovinos leiteiros da raga Gir. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 61, n. 1, p. 232-242, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 34. | | GLADDEN, J. M.; PARK, J. I.; BERGMANN, J.; ORTIZ, V. R.; D'HAESELEER, P.; QUIRINO, B. F.; SALE, K. L.; SIMMONS, B. A.; SINGER, S. W. Discovery and characterization of ionic liquid-tolerant thermophilic cellulases from a switchgrass-adapted microbial community. Biotechnology for Biofuels, v. 7, n. 15, p. 1-12, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 35. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; GLADDEN, J. M.; SINGER, S.; HEINS, R.; D'HAESELEER, P.; SIMMONS, B. A.; QUIRINO, B. F. Discovery of two novel b-glucosidases from an amazon soil metagenomic library. FEMS Microbiology Letters, 16 de dezembro, p. 1-9, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 36. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, O. Y. A.; RAMOS, N. S. P. L.; FURTADO, R. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construction of metagenomic libraries with large inserts of DNA from the Amazonian soil microbiota and screening for enzymes with biotechnological potential. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programas e resumos... [Brasília, DF]: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 64-65.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 37. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 38. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES, P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 39. | | QUIRINO, B. F.; BARRETO, C.; COSTA, O. Y.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBA, D.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. Microbial diversity in different stages of the ethanol production process using culture-independent techniques. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 37., 2015, San Diego, California. [Resumos ...] Fairfax: Society for Industrial Microbiology and Biotechnology, 2015. Resumo T45| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 40. | | COSTA, O. Y. A.; SOUTO, B. de M.; TUPINAMBÁ, D. D.; BERGMANN, J. C.; KYAW, C. M.; KRUGGER, R. H.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. Microbial diversity in sugarcane ethanol production in a Brazilian distillery using a culture-independent method. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, Epub ahead of print, 18 Nov. 2014. Não paginado.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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