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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
09/08/2013 |
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Data da última atualização: |
13/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SANTOS, R.; BASANTE, C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; NEPOMUCENO, A.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A. |
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Afiliação: |
RENATO SANTOS, UFPE; CAROLINA BASANTE, UFRPE; JOSÉ R. C. FERREIRA NETO, UFPE; VALESCA PANDOLFI, UFPE; MAURISRAEL DE MOURA ROCHA, CPAMN; KAESEL JACKSON DAMASCENO E SILVA, CPAMN; ALEXANDRE NEPOMUCENO, CNPSO; ROSANA P. V. BRONDANI, CNPAF; ANA M. BENKO-ISEPPON, UFPE; EDERSON A. KIDO, UFPE. |
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Título: |
Mineração de motivos SSR em sequências expressas de feijão-caupi contendo TAGS supersage diferecialmente expressas sob desidratação radicular. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/344a.pdf. Acesso em: 09 ago. 2013. |
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Conteúdo: |
O feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram ancoradas em ESTs de feijão-caupi. Essas ESTs contendo as tags induzidas foram mineradas quanto à presença de motivos SSR. Os motivos identificados em 135 ESTs permitiram desenhar pares de primers para desenvolvimento de marcadores moleculares SSR, agora baseados em DNA, e não mais anônimos, visando aproveitar esse tipo de polimorfismos para genotipagem de materiais do melhoramento. Sua associação com resposta a estresses está sendo investigada. |
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Palavras-Chave: |
Biblioteca genômica; Bioinformática; Estresse abiótico. |
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Thesagro: |
Vigna Unguiculata. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/87366/1/344a.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/88741/1/conacsantos.pdf
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Marc: |
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520 $aO feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram ancoradas em ESTs de feijão-caupi. Essas ESTs contendo as tags induzidas foram mineradas quanto à presença de motivos SSR. Os motivos identificados em 135 ESTs permitiram desenhar pares de primers para desenvolvimento de marcadores moleculares SSR, agora baseados em DNA, e não mais anônimos, visando aproveitar esse tipo de polimorfismos para genotipagem de materiais do melhoramento. Sua associação com resposta a estresses está sendo investigada.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Biblioteca |
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Registro |
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URL |
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| Registros recuperados : 58 | |
| 5. |  | SILVA, M. L. da; QUEIROZ, M. A. de; FERREIRA, M. A. J. F.; BENKO-ISEPPON, A. M. Caracterização molecular por ISSR de acessos de melancia do Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas. Horticultura Brasileira, v. 30, n. 2, p. S4445-S4451, jul. 2012. 1 CD-R0M. Suplemento. Edição dos Anais do 52 Congresso Brasileiro de Olericultura, Salvador, jul. 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 6. | | VASCONCELOS, S.; SOUZA, A. A. de; GUSMÃO, C. L. S.; MILANI, M.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. Heterochromatin and rDNA 5S and 45S sites as reliable cytogenetic markers for castor bean (Ricinus communis, euphorbiaceae). Micron, n. 41, p. 746-753, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 7. | | ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M. Bulked segregant analysis for identification of DAF markers linked to resistance to CPSMV in cowpea. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S162, ago. 2009. Suplemento. Ref. 562. Edição dos Resumos do 42° Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 8. | | LIMA, B. E. de A.; SILVA, J. S. da; BARBOZA, J.; MELO, N. F. de; BENKO-ISEPPON, A. M.; SILVA, R. L. de O. Caracterização estrutura da família gênica GRAS em Vitis spp. inoculadas com Xanthomona citri. In: CURSO DE VERÃO EM GENÉTICA, 4., 2021, Goiânia. Anais... Goiânia: Universidade Federal de Goiás, 2021.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 9. | | OLIVEIRA, M. F. de; SILVA, R. L. de O.; BEZERRA NETO, J. P.; ARAÚJO, A, C. C. de; MELO, N. F. de; BENKO-ISEPPON, A. M. Caracterização estrutural de peptídeos antimicrobianos da classe cistatina em acessos de videira inoculados com Xanthomonas citri pv. viticola. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 22., 2018, Natal. Anais... Natal: UFRN: Sociedade Brasileira de Genética Regional Nordeste, 2018. p. 201.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 10. | | SILVA, J. B. da; SILVA, R. L. de O.; BEZERRA NETO, J. P.; ABURJAILE, F. F.; MELO, N. F. de; BENKO-ISEPPON, A. M. Validação de genes NBS-LRR em duas cultivares de Vitis infectadas pela bactéria Xanthomonas citri pv. viticola In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 22., 2018, Natal. Anais... Natal: UFRN: Sociedade Brasileira de Genética Regional Nordeste, 2018. p. 147.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 11. | | KIDO, E. A.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; BINNECK, E.; SILVA, M. da; SILVA JUNIOR, W. da; BENKO-ISEPPON, A. M. Explore the RNA-sequencing and the next-generation sequencing in crops responding to abiotic stress. In: SHARMA, P.; YADAV, D.; GAUR, R. K. (ed.). Bioinformatics in Agriculture: Next Generation Sequencing Era. [S. l.]: Elsevier Academic Press, c2022. CHAP. 10, p. 161-175.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | SODRZEIESKI, P. A.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; ABURJAILE, F. F.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; SILVA, C. A. S.; BENKO-ISEPPON, A. M. Genome sequencing of soybean (Glycine max) access resistant to asian soybean rust (Phakopsora pachyrhizi). In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 68., 2023, Ouro Preto, MG. Paleogenomics sequencing ancient DNA. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2023. e-book. p. 421.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 14. | | BORTOLETI, K. C. A.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BELARMINO, L. C. S.; OLIVEIRA, A. R. S.; NASCIMENTO, I. R.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. Distribuição de microssatélites no genoma de leguminosas mediante hibridização in situ fluorescente. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... [Curitiba]: UFPR, 2010. p. 115.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 15. | | SILVA, J. B.; SILVA, R. L. de O.; BARROS, A. A. G. de; ABURJAILE, F. F.; MELO, N. F. de; BENKO-ISEPPON, A. M. Receptor-like proteins (RLPs) in the transcriptome of Vitis spp. under inoculation of Xanthomonas citri. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 66.; SIMPÓSIO DE CITOGENÉTICA E GENÉTICAS DE PEIXES, 19.; REUNIÃO DE GENÉTICA DE MICRORGANISMOS, 32.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE GENÉTICA PARA CONSERVAÇÃO, 2., 2021, Ribeirão Preto. Abstracts. Ribeirão Preto: SBG, 2021. p. 590.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 16. | | FERREIRA-NETO, J. R. C.; SILVA, M. D. da; BENKO-ISEPPON, A. M.; PANDOLFI, V.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; KIDO, E. A. Inositol phosphates and Raffinose family oligosaccharides pathways: Structural genomics and transcriptomics in soybean under root dehydration Plant Gene, v. 20, 100202, 2019. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 18. | | BELARMINO, L. C.; OLIVEIRA, A. R. da S.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C.; BORTOLETI, K. C. de A.; BEZERRA-NETO, J. P.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M. Mining plant genome browsers as a means for efficient connection of physical, genetic and cytogenetic mapping: an example using soybean. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 335-347, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 19. | | SOARES-CAVALCANTI, N. M.; BELARMINO, L. C.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; RODRIGUES, F. A.; PEREIRA, G. A. G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Overall picture of expressed Heat Shock Factors in Glycine max, Lotus japonicus and Medicago truncatula. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 247-259, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; HOULLOU-KIDO, L. M.; ANDRADE, F. C.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BURNQUIST, W. L.; BENKO-ISEPPON, A. M. Plant antimicrobial peptides: an overview of superSAGE transcriptional profile and a functional review. Current Protein & Peptide Science, v. 11, n. 3, p. 220-230, May 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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