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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
10/08/2018 |
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Data da última atualização: |
24/09/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; Giovanna Gabrielle Cruvinel, UNICEP; Caroline Valério Moraes, UFSCar; FLAVIA ALINE BRESSANI DONATONI, CPPSE; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v.45, n.4, p.651-654, aug. 2018. |
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ISSN: |
1573-4978 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays. |
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Palavras-Chave: |
PCR RFLP; Resistência nematódeo gastrintestinal; Tetra primer ARMS PCR. |
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Thesagro: |
Marcador Molecular; Ovino. |
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Thesaurus Nal: |
Genome. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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700 1 $aCHAGAS, A. C. de S.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| 81. |  | SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. do N.; GULIAS GOMES, C. C.; GASPAR, E. B.; BENAVIDES, M. V. Tristeza parasitária bovina: avanços no controle. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos no Brasil. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 51-71.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 82. | | SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. do N.; GULIAS-GOMES, C. C.; GASPAR, E. B.; BENAVIDES, M. V. Tristeza parasitária bovina: resistência genética. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos no Brasil: biologia, controle e doenças transmitidas. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 73-84.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 83. | | SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. do N.; GULIAS-GOMES, C. C.; GASPAR, E. B.; BENAVIDES, M. V. Tristeza parasitária bovina: resistência genética. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos no Brasil. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 75-84.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 84. | | RASSIER, G. L.; BORSUK, S.; PAPPEN, F.; SCAINI, C. J.; GALLINA, T.; VILLELA, M. M.; FARIAS, N. A. da R.; BENAVIDES, M. V.; BERNE, M. E. A. Toxocara spp. seroprevalence in sheep from southern Brazil. Parasitology Research, v. 112, n. 9, p. 3181-3186, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 85. | | GIRALDELO, L. A.; LOPES, L. G.; SILVA, M. H. da; TOSCANO, J. H. B; BENAVIDES, M. V.; THOLON, P.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Impacto da infecção por nematoides gastrintestinais em cordeiros morada nova. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 20., 2018, Londrina. Anais...Londrina: CBPV, 2018. p. 374.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 86. | | NICIURA, S. C. M.; BENAVIDES, M. V.; OKINO, C. H.; IBELLI, A. M. G.; MINHO, A. P.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Genome-wide association study for Haemonchus contortus resistance in Morada Nova sheep. Pathogens, v. 11, n. 8, aug. 2022, 939. 12 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 87. | | SOUZA, B. M. P. da S.; LAMBERT, S. M.; NISHI, S. M.; BENAVIDES, M. V.; BERNE, M. E. A.; MADRUGA, C. R.; ALMEIDA, M. A. O. de. Galectins and collectinis expression are increased in Haemonchus contortus-infected corriedale sheep. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 24, n. 3, p. 317-323, jul./set. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 88. | | SOUZA, B. M. P. da S.; LAMBERT, S. M.; NISHI, S. M.; BENAVIDES, M. V.; BERNE, M. E. A.; MADRUGA, C. R.; ALMEIDA, M. A. O. de. Galectins and collectinis expression are increased in Haemonchus contortus-infected corriedale sheep. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 24, n. 3, p. 317-323, jul./set. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 89. | | HAEHLING, M. B.; TOSCANO, J. H. B.; GIRALDELO, L. A.; SANTOS, I. B.; ESTEVES, S. N.; BENAVIDES, M. V.; THOLON, P.; CHAGAS, A. C. de S. Is selection for resistance and resilience to Haemonchus contortus possible in Morada Nova sheep? Small Ruminant Research, v.201, aug. 2021, 106447. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 90. | | SILVEIRA, J. C. da; FERRONATO, G. de A.; OLIVEIRA, J. F. C. de; HENKES, L. E.; BENAVIDES, M. V.; CESAR, A. S. M. Marcadores moleculares aplicados à seleção animal. In: GONÇALVES, P. B. D.; FIGUEIREDO, J. R. de; GASPERIN, B. G. (ed.). Biotécnicas aplicadas à reprodução animal e à humana. 3. ed. Rio de Janeiro: Roca, 2021. p. 323-340.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 91. | | BENAVIDES, M. V.; MILANO, L. R.; MUÑOZ, F. P.; FRANCK, B. M.; ILHA, G. C.; ALMEIDA, L. S.; CORRÊA, A. P. R.; SACCO, A. M. S. Identificação do estado de portador sadio de Babesia bigemina em bovinos através da técnica de PCR In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Florianópolis. 50 anos desvendando a genética: resumos. Florianópolis: SGB, 2004. p. 837.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 93. | | REINIGER, R. C. P.; CASTRO, L. L. D. de; PINTO, N. B.; BOTELHO, F. B.; BENAVIDES, M. V.; BERNE, M. E. A. Resposta de cordeiros ao parasitismo por Haemonchus contortus previamente infectados com Haemonchus placei. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINARIA, 38., 2011, Florianópolis, SC. [Anais...]. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Medicina Veterinária, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 95. | | BENAVIDES, M. V.; SANTOS, V. R. V. dos; SIMON, J.; SANTOS, D.; ALCANTARA, P. H. R. de; CARDOSO, D. da S.; QUEIROZ, F. M.; MONTEIRO, H. C. Presença de larvas de Tricostrongilídeos e de larvas de vida livre em pastagens de capim-massai irrigadas na região de Palmas, Tocantins. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2017. 24 p. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 19).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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| 96. | | CHAGAS, A. C. de S.; LOPES, L. G.; SILVA, M. H.; GIRALDELO, L. A.; TOSCANO, J. H. B.; OKINO, C. H.; BENAVIDES, M. V.; ESTEVES, S. N. Phenotypic characterization of the parasite resistance in Morada Nova sheep. In: ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE, 69., 2018, Dubrovnik, Croatia. Proceedings... Dubrovnik, Croatia: Wageningen Academic Publishers, 2018. p.308. 27-31 august 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 97. | | NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. Molecular Biology Reports, v.45, n.4, p.651-654, aug. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 98. | | NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. Molecular Biology Reports, v. 45, n. 4, p. 651-654, Aug. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 99. | | NICIURA, S. C. M.; OKINO, C. H.; NUCCI, A. DA S.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Polymorphisms in exon 11 of the mptl-1 gene and monepantel resistance in Haemonchus contortus. Parasitology Research, v. 121, p. 3581-3588, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 100. | | SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; GASPAR, E. B.; GULIAS-GOMES, C. C.; SACCO, A. M. S.; BENAVIDES, M. V.; RAMOS, C. A. do N. Protocolos para diagnóstico de babesiose e anaplasmose. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos: protocolos e técnicas para estudo. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 75-97.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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