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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
28/06/2017 |
Data da última atualização: |
06/05/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOUZA, E. B.; NICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M.; SILVA, J. M. F.; BARROS, D. R. |
Afiliação: |
Elen B. Souza, Departamento de Biologia Celular, Universidade de Brasília, Brasília, DF 70910-900, Brazil; OSMAR NICKEL, CNPUV; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; João M. F. Silva, Departamento de Biologia Celular, Universidade de Brasília, Brasília, DF 70910-900, Brazil; Danielle R. Barros, Departamento de Fitossanidade, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, RS 96010-900, Brazil. |
Título: |
Biological and molecular characterization of two Brazilian isolates of Apple stem grooving virus. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 42, n. 5, p. 391-396, 2017. |
DOI: |
10.1007/s40858-017-0163-3 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Apple stem grooving virus (ASGV, genus Capillovirus) is disseminated worldwide, usually causing a latent infection in most commercial apple cultivars. However, infected scions grafted onto sensitive material display reduction of yield, loss of fruit quality and tree decline. In Brazil ASGV is associated with severe phloem necrosis, xylem pitting and decline of apple trees on Maruba-kaido (Malus prunifolia cv. Ringo) rootstocks usually in a complex with other latent viruses. Two Brazilian ASGV isolates from a mixed infection causing differing reactions on apple cv. Fuji on Maruba-kaido rootstocks, i.e., normal growth vs. tree decline, have been completely sequenced. The differing intensity of symptoms they co-induced on several woody indicator species/cultivars are indicative of biological differences between the two inocula. Their nucleotide sequences are 92.2% identical and display between 79.2% and 97.1% identity with other ASGV isolates available in GenBank. The two isolates (M219-3 and M220) shared 92.3% deduced amino acid (daa) sequence identity for ORF1, 95.3% for ORF2 and 93.3% for the CP gene. A high degree of daa identity, 95.8% and 96.6%, was ob- served between the CPs of M219 ? 3 and M220, respectively, with the Brazilian isolate UV01. Potential recombination events and phy logenetic relationships to major parents were investigated in isolates M219 ? 3and M220. Keywords ASGV . Apple virus . Phylogenetic analysis . Recombination |
Palavras-Chave: |
Apple virus; ASGV (Apple stem grooving virus); Phylogenetic analysis; Recombination. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/161136/1/TPP-Biological-molecular-characterization-ASGV-2017.pdf
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Marc: |
LEADER 02176naa a2200229 a 4500 001 2071609 005 2019-05-06 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s40858-017-0163-3$2DOI 100 1 $aSOUZA, E. B. 245 $aBiological and molecular characterization of two Brazilian isolates of Apple stem grooving virus.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aApple stem grooving virus (ASGV, genus Capillovirus) is disseminated worldwide, usually causing a latent infection in most commercial apple cultivars. However, infected scions grafted onto sensitive material display reduction of yield, loss of fruit quality and tree decline. In Brazil ASGV is associated with severe phloem necrosis, xylem pitting and decline of apple trees on Maruba-kaido (Malus prunifolia cv. Ringo) rootstocks usually in a complex with other latent viruses. Two Brazilian ASGV isolates from a mixed infection causing differing reactions on apple cv. Fuji on Maruba-kaido rootstocks, i.e., normal growth vs. tree decline, have been completely sequenced. The differing intensity of symptoms they co-induced on several woody indicator species/cultivars are indicative of biological differences between the two inocula. Their nucleotide sequences are 92.2% identical and display between 79.2% and 97.1% identity with other ASGV isolates available in GenBank. The two isolates (M219-3 and M220) shared 92.3% deduced amino acid (daa) sequence identity for ORF1, 95.3% for ORF2 and 93.3% for the CP gene. A high degree of daa identity, 95.8% and 96.6%, was ob- served between the CPs of M219 ? 3 and M220, respectively, with the Brazilian isolate UV01. Potential recombination events and phy logenetic relationships to major parents were investigated in isolates M219 ? 3and M220. Keywords ASGV . Apple virus . Phylogenetic analysis . Recombination 653 $aApple virus 653 $aASGV (Apple stem grooving virus) 653 $aPhylogenetic analysis 653 $aRecombination 700 1 $aNICKEL, O. 700 1 $aFAJARDO, T. V. M. 700 1 $aSILVA, J. M. F. 700 1 $aBARROS, D. R. 773 $tTropical Plant Pathology$gv. 42, n. 5, p. 391-396, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Registros recuperados : 17 | |
3. | | NICKEL, O.; SOUZA, E. B. de; FAJARDO, T. V. M.; BARROS, D. R. de. Comparison of the nucleotide sequences of two isolates of apple stem grooving virus from apple plants. Virus Reviews and Research, Belo Horizonte, v. 20, p. 201, 2015. Suplemento. Abstract PIV 48. Edição dos Resumos do XXVI Brazilian Congress of Virology, X Mercour Meeting of Virology, 2015, Florianópolis.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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4. | | FAJARDO, T. V. M.; BARROS, D. R.; NICKEL, O.; KUHN, G. B.; ZERBINI, F. M. Expression of grapevine leafroll-associated virus 3 coat protein gene in Escherichia coli and production of polyclonal antibodies. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 32, n. 6, p. 43-47, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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5. | | FAJARDO, T. V. M.; BARROS, D. R.; NICKEL, O.; KUHN, G.; ZERBINI, M. Expression of grapevine leafroll-associated virus 3 coat protein gene in Escherichia coli and production of polyclonal antibodies. Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 32, n. 6, p. 496-500, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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7. | | BARROS, D. R.; SILVA, E. R. da; ARAÚJO, M. I. de; SOUSA, S. G. A. de; ALFAIA, S. S. Desenvolvimento da tachi sob efeito do el niño em Manaus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS, 10., 2016, Cuiabá. SAF: aprendizados, desafios e perspectivas: anais. Cuiabá: SBSAF, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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9. | | BELLÉ, C.; BRUM, D.; GROTH, M. Z.; BARROS, D. R.; KASPARY, T. E.; SCHAFER, J. T.; GOMES, C. B. First Report of Meloidogyne luci Parasitizing Glycine max in Brazil. Plant Disease, v. 100, n. 10, p. 2174, Oct. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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10. | | SOUZA, E. B.; BARROS, D. R.; CASTRO, L. A. S. de; CALDERAN, A.; MAICH, S.; NEVES, C. G. Levantamento de PLRV, PVX e PVS em batata, nas regiões central e sul do Rio Grande do Sul. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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11. | | SILVA, E. R. da; BARROS, D. R.; SOUSA, S. G. A. de; ARAÚJO, M. I. de; ALFAIA, S. S. Frutíferas cultivadas, nativas e exóticas suscetíveis às mudanças climáticas em Manaus-AM. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 24., 2016, São Luis. Fruticultura: fruteiras nativas e sustentabilidade. São Luis, MA: SBF, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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12. | | SOUZA, E. B.; NICKEL, O.; NAGATA, T.; SILVA, J. M. F.; FAJARDO, T. V. M.; BARROS, D. R. Recombination events in full genome sequences of apple stem grooving virus. Virus Reviews and Research, v. 20, n. 2, p. 146, 2016. (Annals of the XXVII Brazilian Congress of Virology & XI Mercosur Meeting of Virology). Annals of the XXVII Brazilian Congress of Virology & XI Mercosur Meeting of Virology, Pirienópolis, GO, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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13. | | SCHAFER, J. T.; GOMES, C. B.; PEREIRA, A. da S.; CRUZ, F. F.; BARROS, D. R. de. Resistance of potato genotypes to Meloidogyne javanica. Revista Caatinga, Mossoró, v. 30, n. 2, p. 536-540, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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15. | | VIDEIRA, S. S.; OLIVEIRA, D. M. de; BARROS, D. R.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, V. L. D. Diversidade morfológica de bactérias diazotróficas oriundas de plantas de capim-elefante no Estado do rio de Janeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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16. | | ORILIO, A. F.; LIMA, A. T. M.; ALMEIDA, M. M. S.; ROCHA, C. da S.; BARROS, D. R.; URQUIZA, G. P. C.; SILVA, F. N.; ZERBINI, P. A.; BARBOSA, J. C.; ALBUQUERQUE, L. C.; INOUE-NAGATA, A. K.; KITAJIMA, E. W.; ZERBINI, F. M. Malvaviscus yellow mosaic virus, a begomovirus carrying a nanovirus-like nonanucleotide and a modified stem-loop structure. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 30.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 14., 2019, Cuiabá. Resumos... Brasília, DF: SBV, 2019. p. 8.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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17. | | LIMA, A. T. M.; ORÍLIO, A. F.; ALMEIDA, M. M. S.; ROCHA, C. S.; BARROS, D. R.; CASTILLO-URQUIZA, G. P.; SILVA, F. N.; XAVIER, C. A. D.; BRUCKNER, F. P.; ALFENAS-ZERBINI, P.; BARBOSA, J. C.; ALBUQUERQUE, L. C.; INOUE-NAGATA, A. K.; KITAJIMA, E. W.; ZERBINI, F. M. Malvaviscus yellow mosaic virus, a divergent begomovirus carrying a nanovirus-like nonanucleotide and a modified stem-loop structure. Annals of Applied Biology, v. 179, p. 96-107, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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