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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
19/12/2022 |
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Data da última atualização: |
19/12/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
BARRO, M. P. |
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Afiliação: |
MATHEUS POTSCLAM BARRO, INSTITUTO BIOLÓGICO SÃO PAULO. |
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Título: |
Carga viral das estirpes de Citrus Leprosis Virus C e seu potencial impacto na epidemiologia da leprose dos citros. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Dissertação (Mestrado Segurança Alimentar e Sanidade no Agroecossistema) - UInstituto Biológico São Paulo, 2022. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Orientadora: Juliana Freitas-Astúa (CNPMF); Coorientador: Pedro Luis Ramos-González. |
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Conteúdo: |
RESUMO BARRO, Matheus Potsclam. Carga viral das estirpes de citrus leprosis virus C e seu potencial impacto na epidemiologia da leprose dos citros. 2022. Dissertação (Mestrado em Sanidade, Segurança Alimentar e Ambiental no Agronegócio) ? Instituto Biológico, Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios, Secretaria de Agricultura e Abastecimento do Estado de São Paulo, São Paulo. 2022.A leprose dos citros (LC) é a doença viral que mais afeta a citricultura brasileira. Embora causada por diferentes patógenos, o cilevírus citrus leprosis virus C (CiLV-C) é o agente prevalente no país. Duas linhagens deste vírus, CiLV-C_SJP (São José do Rio Preto) e CiLV-C_CRD (Cordeirópolis), têm sido identificadas nos pomares comerciais do cinturão citrícola brasileiro, situado nos estados de São Paulo e Minas Gerais. Os sintomas característicos da infecção por CiLV-C são manchas necróticas e/ou cloróticas localizadas nos frutos, ramos e folhas principalmente de laranjeiras doce (Citrus xsinensis L. Osbeck). A estirpe CiLV-C_SJP foi identificada pela primeira vez no Estado de São Paulo em 2016. Após o sequenciamento do seu genoma e estabelecimento de um método específico de detecção, percebeu-se que a estirpe SJP é prevalente dentro do cinturão citrícola, mas ausente das outras áreas de produção de citros no Brasil e no exterior. Visando contribuir e esclarecer as bases moleculares desta distribuição diferencial das estirpes, o objetivo deste trabalho foi estudar a carga viral das estirpes SJP e CRD mediante a quantificação absoluta do genoma viral nos tecidos de frutos e folhas de laranjeiras doce. Para isso, foi desenvolvido um método de detecção baseado em PCR quantitativo com sondas de hidrólise (RT-qPCR). Os iniciadores e as sondas foram desenhados tomando em conta a variabilidade genética reconhecida em mais de 70isolados virais das duas estirpes. Para o desenvolvimento e a caracterização do método foram construídas curvas padrão para cada estirpe utilizando plasmídeos recombinantes. Os iniciadores específicos para os segmentos alvo dentro do gene RdRp das estirpes SJP e CRD foram validados mediante RT-PCR de ponto final e RT-qPCR com fluoróforos intercalantes. Por fim, o método RT-qPCR por sondas de hidrólise demonstrou ter alto coeficiente de determinação (> 0,9) e eficiências de amplificação de E= 1,0 e E= 0,99 para as estirpes CRD e SJP, respectivamente. Duzentas e quatorze amostras de frutos de laranjas doce com sintomas de leprose, coletadas entre 2017 e 2022 em pomares comerciais ou não, e 140 lesões obtidas de folhas de diferentes locais foram avaliadas mediante ensaios de RT-qPCR com sondas específicas. Observou-se que a estirpe SJP alcança um acúmulo de até nove vezes mais moléculas virais que a CRD, e sua carga viral nos frutos é ao menos três vezes superior que em folhas. Baseado nesses resultados, discutiu-se a possível vantagem adaptativa da estirpe SJP e a sua relação com a epidemiologia do CiLV-C. O estudo provê, ainda, dados que podem contribuir com a compreensão da interação das estirpes de CiLV-C com as variedades de copa e sua relação com possíveis fatores agroambientais dos diferentes setores do cinturão citrícola de São Paulo e Minas Gerais. MenosRESUMO BARRO, Matheus Potsclam. Carga viral das estirpes de citrus leprosis virus C e seu potencial impacto na epidemiologia da leprose dos citros. 2022. Dissertação (Mestrado em Sanidade, Segurança Alimentar e Ambiental no Agronegócio) ? Instituto Biológico, Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios, Secretaria de Agricultura e Abastecimento do Estado de São Paulo, São Paulo. 2022.A leprose dos citros (LC) é a doença viral que mais afeta a citricultura brasileira. Embora causada por diferentes patógenos, o cilevírus citrus leprosis virus C (CiLV-C) é o agente prevalente no país. Duas linhagens deste vírus, CiLV-C_SJP (São José do Rio Preto) e CiLV-C_CRD (Cordeirópolis), têm sido identificadas nos pomares comerciais do cinturão citrícola brasileiro, situado nos estados de São Paulo e Minas Gerais. Os sintomas característicos da infecção por CiLV-C são manchas necróticas e/ou cloróticas localizadas nos frutos, ramos e folhas principalmente de laranjeiras doce (Citrus xsinensis L. Osbeck). A estirpe CiLV-C_SJP foi identificada pela primeira vez no Estado de São Paulo em 2016. Após o sequenciamento do seu genoma e estabelecimento de um método específico de detecção, percebeu-se que a estirpe SJP é prevalente dentro do cinturão citrícola, mas ausente das outras áreas de produção de citros no Brasil e no exterior. Visando contribuir e esclarecer as bases moleculares desta distribuição diferencial das estirpes, o objetivo deste trabalho foi estudar a carga viral das estirpes... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Fruta Cítrica. |
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650 $aDoença de Planta
650 $aFruta Cítrica
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Origem |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
24/09/2019 |
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Data da última atualização: |
16/04/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
NORIEGA, D. D.; ARIAS, P. L.; BARBOSA, H. R.; ARRAES, F. B. M.; OSSA, G. A.; VILLEGAS, B.; COELHO, R. R.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; WANG, H.; VÉLEZ, A. M.; ARBOLEDA, J. W.; GROSSI-DE-SA, M. F.; SILVA, M. C. M.; VALENCIA-JIMÉNEZ, A. |
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Afiliação: |
DANIEL D. NORIEGA, UNB; PAULA L. ARIAS, UNIVERSIDAD DE CALDAS, COLOMBIA; HELENA R. BARBOSA, UFRGS; FABRICIO B. M. ARRAES, UFRGS; GUSTAVO A. OSSA, UNIVERSIDAD DE CALDAS, COLOMBIA; BERNARDO VILLEGAS, UNIVERSIDAD DE CALDAS, COLOMBIA; ROBERTA R. COELHO; ERIKA VALERIA SALIBA ALBUQUERQUE FR, Cenargen; ROBERTO COITI TOGAWA, Cenargen; PRISCILA GRYNBERG, Cenargen; HAICHUAN WANG, UNIVERSITY OF NEBRASKA-LINCOLN, USA; ANA M. VÉLEZ, UNIVERSITY OF NEBRASKA-LINCOLN, USA; JORGE W. ARBOLEDA, UNIVERSIDAD DE MANIZALES, MANIZALES, COLOMBIA; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, Cenargen; MARIA CRISTINA MATTAR DA SILVA, Cenargen; ARNUBIO VALENCIA-JIMÉNEZ, UNIVERSIDAD DE CALDAS, COLOMBIA. |
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Título: |
Transcriptome and gene expression analysis of three developmental stages of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v.9, n. 1, article 12804, 2019. |
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DOI: |
10.1038/s41598-019-49178-x |
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Idioma: |
Inglês |
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Palavras-Chave: |
Coffea spp; Coffee; Coffee berry borer. |
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Thesagro: |
Hypothenemus Hampei. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/202256/1/s41598-019-49178-x.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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