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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
06/11/2023 |
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Data da última atualização: |
07/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SUELA, M. M.; AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; MOMEN, M.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CAIXETA, E. T.; MOROTA, G.; NASCIMENTO, M. |
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Afiliação: |
MATHEUS MASSARIOL SUELA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; CAMILA FERREIRA AZEVEDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; ANA CAROLINA CAMPANA NASCIMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; MEHDI MOMEN, UNIVERSITY OF WISCONSIN-MADISON; ANTONIO CARLOS BAIAO DE OLIVEIRA, CNPCa; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; GOTA MOROTA, VIRGINIA POLYTECHNIC INSTITUTE AND STATE UNIVERSITY; MOYSÉS NASCIMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
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Título: |
Genome-wide association study for morphological, physiological, and productive traits in Coffea arabica using structural equation models. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 3, 2023. |
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Páginas: |
17 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11295-023-01597-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Yield is one of the most important traits of arabica coffee. Plant breeders seek to maximize yield directly or indirectly, using other related traits. The standard multi-trait genome-wide association study (MTM-GWAS) does not accommodate the network structure of phenotypes, therefore, does not address how traits are interrelated. We applied structural equation modeling (SEM) to GWAS to explore interrelated dependencies between phenotypes related to morphology (fruit size and number of reproductive nodes), physiology (vegetative vigor), and productivity (yield) traits using 195 Coffea arábica individuals genotyped with 21,211 single-nucleotide polymorphism markers. We inferred the probabilistic phenotypic network by the Hill-Climbing algorithm to estimate the structural coefficients. The integration of multivariate GWAS and SEM (SEM-GWAS) identified a positive interrelationship between vegetative vigor and yield, and vegetative vigor and the number of reproductive nodes. Among those traits, yield and number of reproductive nodes presented indirect SNP effects. There was no evidence of a single quantitative trait locus controlling all the traits jointly. We identified three genes (Stress enhanced protein 1, Abscisic stress-ripening protein 5, and SAR?SNI1) that acted directly on yield. In summary, SEM-GWAS offered new insights into the relationship between the traits linked to coffee yield, providing useful information for arabica coffee breeding programs. |
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Thesaurus Nal: |
Coffea arabica var. arabica; Genome-wide association study; Single nucleotide polymorphism; Structural equation modeling. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157822/1/Genome-wide-association.pdf
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Marc: |
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700 1 $aNASCIMENTO, M.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Caprinos e Ovinos. Para informações adicionais entre em contato com cnpc.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
17/05/2022 |
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Data da última atualização: |
17/05/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SOUZA, I. M. de; MELO, M. D.; PRIMO, A. A.; LIMA, A. de R.; TONUCCI, R. G.; SOUZA, H. A. de. |
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Afiliação: |
IVANDERLETE MARQUES DE SOUZA, UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ; MARIA DIANA MELO, UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ; ANACLAUDIA ALVES PRIMO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ; ADRIANO RODRIGUES LIMA, CNPC; RAFAEL GONCALVES TONUCCI, CNPC; HENRIQUE ANTUNES DE SOUZA, CPAMN. |
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Título: |
Atributos químicos do solo em função de manejos praticados por agricultores familiares no Semiárido. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO PIAUIENSE DE AGROECOLOGIA, 3.; SIMPÓSIO DE SABERES AGROECOLÓGICOS DO NORTE DO PIAUÍ, 2., 2017, Cocal. [Anais...]. Cocal: IFPI, 2017. |
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Páginas: |
p. 69-72. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: A manutenção e a melhoria da qualidade do solo são determinantes para a estabilidade, sustentabilidade e produtividade de ecossistemas naturais e de agroecossistemas. Compreender a fertilidade dos solos sob diferentes manejos praticados auxilia na verificação e adoção de sistemas mais conservacionistas. Objetivou-se avaliar atributos químicos do solo (M.O, P, K, Ca, Mg e pH) sob diferentes manejos praticados na agricultura familiar de sequeiro em região semiárida Foram avaliados os manejos: cultivo tradicional ou cultivo convencional/intensive (CT) e limpeza (roça) da área com capina, ou seja, a limpeza/abertura de área de pasto nativo, sem a manutenção dos resíduos orgânicos (LA). De posse dos resultados das análises químicas do solo os nutrientes foram agrupados de acordo com as classes de interpretação definidas para o estado do Ceará e realizaramse os cálculos do intervalo de segurança de cada manejo. A prática de cultivo tradicional resultou em menores teores de matéria orgânica e fósforo disponível. Contrariarmente, a prática da limpeza de área proporcionou valores médios de atributos químicos do solo superiores ao manejo cultivo tradicional, mostrando-se como o sistema de manejo mais adequado, dentre os avalaidos no presente trabalho. |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Intervalo de confiança e nutrientes; Região Nordeste; Semiárido. |
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Thesagro: |
Fertilidade do Solo. |
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Thesaurus NAL: |
Brazil; Semiarid soils; Soil fertility. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
LEADER 02217nam a2200277 a 4500
001 2143089
005 2022-05-17
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245 $aAtributos químicos do solo em função de manejos praticados por agricultores familiares no Semiárido.$h[electronic resource]
260 $aIn: SEMINÁRIO PIAUIENSE DE AGROECOLOGIA, 3.; SIMPÓSIO DE SABERES AGROECOLÓGICOS DO NORTE DO PIAUÍ, 2., 2017, Cocal. [Anais...]. Cocal: IFPI$c2017
300 $ap. 69-72.
520 $aResumo: A manutenção e a melhoria da qualidade do solo são determinantes para a estabilidade, sustentabilidade e produtividade de ecossistemas naturais e de agroecossistemas. Compreender a fertilidade dos solos sob diferentes manejos praticados auxilia na verificação e adoção de sistemas mais conservacionistas. Objetivou-se avaliar atributos químicos do solo (M.O, P, K, Ca, Mg e pH) sob diferentes manejos praticados na agricultura familiar de sequeiro em região semiárida Foram avaliados os manejos: cultivo tradicional ou cultivo convencional/intensive (CT) e limpeza (roça) da área com capina, ou seja, a limpeza/abertura de área de pasto nativo, sem a manutenção dos resíduos orgânicos (LA). De posse dos resultados das análises químicas do solo os nutrientes foram agrupados de acordo com as classes de interpretação definidas para o estado do Ceará e realizaramse os cálculos do intervalo de segurança de cada manejo. A prática de cultivo tradicional resultou em menores teores de matéria orgânica e fósforo disponível. Contrariarmente, a prática da limpeza de área proporcionou valores médios de atributos químicos do solo superiores ao manejo cultivo tradicional, mostrando-se como o sistema de manejo mais adequado, dentre os avalaidos no presente trabalho.
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650 $aSemiarid soils
650 $aSoil fertility
650 $aFertilidade do Solo
653 $aBrasil
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653 $aSemiárido
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700 1 $aTONUCCI, R. G.
700 1 $aSOUZA, H. A. de
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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