Portal do Governo Brasileiro
BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
Home Bibliotecas Itens selecionados Créditos Ajuda
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  26/12/2018
Data da última atualização:  24/01/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ALMEIDA, A. L.; SCHETTINO, V. J.; BARBOSA, T. J. R.; FREITAS, P. F.; GUIMARÃES, P. G. S.; ARBEX, W. A.
Afiliação:  WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL.
Título:  Relative scalability of NoSQL databases for genotype data manipulation.
Ano de publicação:  2018
Fonte/Imprenta:  Revista de Informática Teórica e Aplicada, v. 25, n. 2, p. 93-100, 2018.
DOI:  10.22456/2175-2745.79334
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Abstract Genotype data manipulation is one of the greatest challenges in bioinformatics and genomics mainly because of high dimensionality and unbalancing characteristics. These peculiarities explains why Relational Database Management Systems (RDBMSs), the "de facto" standard storage solution, have not been presented as the best tools for this kind of data. However, Big Data has been pushing the development of modern database systems that might be able to overcome RDBMSs deficiencies. In this context, we extended our previous works on the evaluation of relative performance among NoSQLs engines from different families, adapting the schema design in order to achieve better performance based on its conclusions, thus being able to store more SNP markers for each individual. Using Yahoo! Cloud Serving Benchmark (YCSB) benchmark framework, we assessed each database system over hypothetical SNP sequences. Results indicate that although Tarantool has the best overall throughput, MongoDB is less impacted by the increase of SNP markers per individual.
Palavras-Chave:  Data Science; Database; NoSQL; SNP.
Thesaurus Nal:  Bioinformatics; Genotype.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189325/1/Artigo-RevInfTeorApl-Arbex-Relative.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL24402 - 1UPCAP - DD
Voltar






Ordenar por: RelevânciaAutorTítuloAnoImprime registros no formato resumido      Imprime registros no formato resumido
Registros recuperados : 193
Primeira ... 123456789 ... Última
1.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A. FuzzyMorphic Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2009. 1 CD-ROM. Versão 1.0 Release 20090111
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
2.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A. Melhoramento genético High-tech. Animal Business Brasil, v. 3, n. 12, p. 31-36, 2013.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
3.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A. Modelagem difusa e implementação de sistemas de inferência com o fuzzyMorphic.pl. In: ENCONTRO MINEIRO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL, 2011, Juiz de Fora. Resumos... Juiz de Fora: Universidade Federal de Juiz de Fora, 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
4.Imagem marcado/desmarcadoBITTENCOURT, P.; ALMEIDA, F.; ARBEX, W. A. Applications of graph theory of verify the family relationship for genetic evaluations through the Animal Model In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 11., 2015, São Paulo. Proceedings... São Paulo: Universidade de São Paulo, 2015. p. 125.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
5.Imagem marcado/desmarcadoCARVALHO, B. de S.; ARBEX, W. A. Desafios e perspectivas da bioinformática. In: ARBEX, A.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics - TACG vol.1: Modelos e métodos computacionais em Bioinformática. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 19-40
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
6.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; CARVALHO, L. A. Inferência fuzzy para suporte a decisão na descoberta de SNPs. In: CONFERÊNCIA IBÉRICA DE SISTEMAS E TECNOLOGIAS DE INFORMAÇÃO, 7., 2012, Madri. Proceedings… [S.l.:s.n.], 2012. p. 421-426.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
7.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; MARTINS, P. do C. O leite e o protagonismo na Revolução 4.0 . In: Anuário Leite 2019. Juiz de Fora-MG: Texto Comunicação Corporativa. 70-72. 2019.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
8.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS, P. do C.; ARBEX, W. A. Ideas for milk: o leite entre startups. In: Anuário Leite 2018. São Paulo-SP: Embrapa. 74-75. 2018.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, R.; ALMEIDA, F.; ARBEX, W. A. Storage and recovery of dairy cattle genotype data from the data science approach. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 11., 2015, São Paulo. Proceedings... São Paulo: Universidade de São Paulo, 2015. X-Meeting 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
10.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; CARVALHO, L. A. V. DE. Desenvolvimento de sistemas de inferencia difusa com fuzzymorphic PL. Encontro Academico de Modelagem Computacional do LNCC, 3., 2010, Petropolis.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
11.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; ARBEX, W. A. Genômica funcional aplicada à nutrição. In: SIMPÓSIO MINEIRO DE NUTRIÇÃO DE GADO DE LEITE, 7.; SIMPÓSIO NACIONAL DE PRODUÇÃO E NUTRIÇÃO DE GADO DE LEITE, 2., 2014, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: FEPMVZ Editora, 2014. p. 130-133
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
12.Imagem marcado/desmarcadoZONOVELLI, B.; BORGES, C. C. H.; ARBEX, W. A. NeuroSNP: Tool to Filter SNPs in Whole Genomic DNA. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ARTIFICIAL INTELLIGENCE - ICAI, 2014, Las Vegas. Proceedings... Las Vegas: CSREA Press, 2014. v. 2. p. 497-503. WORLDCOMP'14
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
13.Imagem marcado/desmarcadoZONOVELLI, B.; BORGES, C. C. H.; ARBEX, W. A. On the robustness of SNPs filtering using computational intelligence. In: CONFERÊNCIA IBÉRICA DE SISTEMAS E TECNOLOGIAS DE INFORMAÇÃO, 10., 2015, Águeda, Portugal. Atas... Águeda: Universidade de Aveiro, 2015.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
14.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics - TACG vol. 1: modelos e métodos computacionais em bioinformática. Brasília, DF: Embrapa, 2014. 199 p.
Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
15.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; ARBEX, W. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, M. V. G. B.; CARVALHO, L. A. V. DE. Inferência difusa como suporte à descoberta de possíveis SNPs em sequências de cDNA. In: ENCONTRO ACADÊMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL DO LNCC, 2., 2009, Petrópolis. Anais... Petropolis: Laboratório Nacional de Computação Científica, 2009. p. 19-20
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
16.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; ARBEX, W. A.; CARVALHO, L. A.; SILVA, M. V. G. B.; SILVA, M. V. G. B. SNP discovery in CDNA sequences with fuzzymorphic. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Meeting... Angra dos Reis: ABCB, 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
17.Imagem marcado/desmarcadoSCHETTINO, V. J.; ALMEIDA, A. L.; SILVA, L. R. M.; ARBEX, W. A. Avaliação do desempenho relativo de bancos de dados NoSQL para arquivos de genótipos. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO, 36., 2016, Porto Alegre. Anais... Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2016. p. 306-309
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
18.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; OLIVEIRA, F. C. DE; CARVALHO, L. A. V. DE. Aplicação de inferência difusa em bioinformática para identificação de SNPs. In: Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 31., 2011, Natal. Anais...
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
19.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; OLIVEIRA, F. C. DE; CARVALHO, L. A. V. DE. Aplicação de sistemas de inferência nebulosa com o fuzzymorphic.PL. In: Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente, 10., 2011, São João del Rei. Anais...
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
20.Imagem marcado/desmarcadoARBEX, W. A.; MARTINS, P. do C.; COSTA, C. N.; ALVARENGA, M. B. Controle inteligente da qualidade do leite. In: Anuário Leite 2019. Juiz de Fora-MG: Texto Comunicação Corporativa. 88-89. 2019.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
Registros recuperados : 193
Primeira ... 123456789 ... Última
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada.
  
 

Embrapa
Todos os direitos reservados, conforme Lei n° 9.610
Política de Privacidade
Área Restrita
Embrapa Agricultura Digital
Av. André Tosello, 209 - Barão Geraldo
Caixa Postal 6041- 13083-886 - Campinas, SP
SAC: https://www.embrapa.br/fale-conosco

Valid HTML 4.01 Transitional