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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
09/06/2021 |
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Data da última atualização: |
09/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PESSOA, D. D. V.; SANTOS, C. M. dos; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
DANIELLA DUARTE VILLARINHO PESSOA, UFRRJ; CARLOS MAGNO DOS SANTOS, UFRRJ; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR, UFPR; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFPR; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 expression profile in response to sugarcane apoplastic fluid. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
3 Biotech, v. 11, Article number 292, 2021. |
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ISSN: |
2190-5738 |
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DOI: |
10.1007/s13205-021-02848-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial transcriptome profiling in the presence of plant fluids or extracts during microbial growth may provide relevant information on plant?bacteria interactions. Here, RNA sequencing (RNA-Seq) was used to determine the transcriptomic profile of Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 at the early stages of response to sugarcane apoplastic fluid. Differentially expressed gene (DEG) analysis was performed using the DESeq2 and edgeR packages, followed by functional annotation using Blast2GO and gene ontology enrichment analysis using the COG and KEGG databases. After 2 h of sugarcane apoplastic fluid addition to the H. seropedicae HRC54 culture, respectively, 44 and 45 genes were upregulated and downregulated. These genes were enriched in bacterial metabolism (e.g., oxidoreductase and transferase), ABC transporters, motility, secretion systems, and signal transduction. RNA-Seq expression profiles of 12 genes identified in data analyses were verified by RT-qPCR. The results suggested that H. seropedicae HRC54 recognized sugarcane apoplastic fluid as the host signal, and some DEGs were closely involved at the early stages of the establishment of plant?bacteria interactions. |
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Palavras-Chave: |
Plant bacteria interactions. |
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Thesaurus Nal: |
Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 163 | |
| 81. |  | MATOS, G. F. de; ZILLI, J. E.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Bradyrhizobium isolates from sugarcane roots represent a nex phylogenetic group with potential for the development fo inoculants. In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION WITH NON-LEGUMES, 15.; SYMPOSIUM OF THE EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 12., 2016, Hungary. Book of abstracts. Hungary: Biological Research Center, 2016. P. 38| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 82. | | ROUWS, L. F. M.; FISCHER, D.; ARAUJO, J. L. S. de; SCHMID, M.; SCHLOTER, M.; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; HARTMANN, A. Bradyrhizobium spp. are part of the nitrogen-fixing bacterial community associated with the field grown sugar cane Seropédica/ Rio de Janeiro, Brasil. EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 10., 2012, Munich. Abstract.... Munich: German Research Center for Environmental Health, 2012. 72 p. PP3-30| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 83. | | DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; ROUWS, L. F. M.; ZILLI, J. E.; PARMA, M. M.; MELO, I. S. de; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium stylosanthis sp. nov., comprising nitrogen-fixing symbionts isolated from nodules of the tropical forage legume Stylosanthes spp. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 66, n. 8, p. 3078-3087, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 86. | | FERREIRA, E. P. de B.; MERCANTE, F. M.; HUNGRIA, M.; MENDES, I. de C.; ARAÚJO, J. L. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ARAÚJO, A. P. Contribuições para melhoria da eficiência da fixação biológica de nitrogênio no feijoeiro comum no Brasil. Tópicos em Ciência do Solo, v. 8, p. 251-323, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 87. | | FERREIRA, E. P. de B.; MERCANTE, F. M.; HUNGRIA, M.; MENDES, I. de C.; ARAÚJO, J. L. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ARAÚJO, A. P. Contribuições para melhoria da eficiência da fixação biológica de nitrogênio no feijoeiro comum no Brasil. In: ARAÚJO, A. P.; ALVES, B. J. R. (Ed.). Tópicos em ciência do solo. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013. v. 8. p. 251-323.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Soja. |
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| 88. | | FERREIRA, E. P. de B.; MERCANTE, F. M.; HUNGRIA, M.; MENDES, I. de C.; ARAÚJO, J. L. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ARAÚJO, A. P. Contribuições para melhoria da eficiência da fixação biológica de nitrogênio no feijoeiro comum no Brasil. In: ARAÚJO, A. P.; ALVES, B. J. R. (Ed.). Tópicos em ciência do solo. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013. v. 8. p. 251-323.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 90. | | SILA, H. A. P. da; GALISA, P. de S.; SILVA, J. R.; GONÇALO, T. P.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Prospecção de genes diferencialmente expressos em nódulos de feijão-caupi submetido a estresse térmico e déficit hídrico. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 92. | | SILVA, P. R. A. da; VIDAL, M. S.; SOARES, C. de P.; POLESE, V.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. Selection and evaluation of reference genes for RT-qPCR expression studies on Burkholderia tropica strain Ppe8, a sugarcane-associated diazotrophic bacterium grown with different carbon sources or sugarcane juice Antonie van Leeuwenhoek, v. 109, n. 111, p. 1493-1502, 2016. Epub, 17 Aug., 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 93. | | POLESE, V.; SOARES, C. de P.; SILVA, P. R. A. da; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S. Selection and validation of reference genes for RT-qPCR indicates that juice of sugarcane varieties modulate the expression of C metabolism genes in the endophytic diazotrophic Herbaspirillum rubrisubalbicans strain HCC103. Antonie van Leeuwenhoekv, 110, n. 12, p. 1555-1568, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 94. | | GONÇALO, T. P.; SILVA, J. R. da; SILVA, H. A.; P. da; GALISA, P. de S.; VIDAL, M. S.; ARAÚJO, J. L. S. de. Isolamento e caracterização de genes do feijoeiro envolvidos na simbiose com Rhizobium tropici. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DOBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 96. | | BALDANI, J. I.; VIDEIRA, S. S.; QUESSADA, D.; BALDANI, V. L. D.; VIDAL, M. S.; SCHWAB, S.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. BNF in the bioenergy Pennisetum purpureum In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION WITH NON-LEGUMES, 15.; SYMPOSIUM OF THE EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 12., 2016, Hungary. Book of abstracts. Hungary: Biological Research Center, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 97. | | SILVA, J. R. da; GONÇALO, T. P.; GALISA, de S.; SILVA, H. A P. da; SCORTECCI, K. C.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S. Identificação de genes diferencialmente expressos em cana-de-açúcar submetida a estresse hídrico. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 98. | | GOLÇALO, T. P.; SILVA, R. da; SILVA, H. A. P. da; GALISA, P. de S.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Identificação de genes do feijoeiro envolvidos na simbiose com o Rhizobium tropici. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 99. | | RODRIGUES, E. P.; COELHO, M. S.; SOARES, C. de P.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. Identificação e quantificação de compostos indólicos no sobrenadante de Gluconacetobacter diazotrophicus, cultivada em meio liquido, por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009. 25 p. (Embrapa Agrobiologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 52).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 100. | | PESSOA, D. D. V.; SANTOS, C. M. dos; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de. Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 expression profile in response to sugarcane apoplastic fluid. 3 Biotech, v. 11, Article number 292, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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