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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
Data corrente: |
07/11/2016 |
Data da última atualização: |
08/11/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BARAÚNA, A. C.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS JUNIOR, F. B. dos; IANNETTA, P. P. M.; MALUK, M.; GOI, S. R.; REIS, V. M.; JAMES, E. K.; ZILLI, J. E. |
Afiliação: |
ALEXANDRE C. BARAÚNA, UFRRJ; LUC FELICIANUS MARIE ROUWS, CNPAB; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; FABIO BUENO DOS REIS JUNIOR, CPAC; PIETRO P. M. IANNETA, THE JAMES HUTTON INSITTITUE, INVERGOWRIE, DUNDEE, UK; MARTA MALUC, THE JAMES HUTTON INSTITUTE, INVERGOWRIE, DUNDEE, UK; SILVIA R. GOI, UFRRJ; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; EUAN K. JAMES, THE JAMES HUTTON INSTITUTE, INVERGOWRIE, DUNDEE, UK; JERRI EDSON ZILLI, CNPAB. |
Título: |
Rhizobium altiplani sp. nov., isolated from effective nodules on Mimosa pudica growing in untypically alkaline soil in central Brazil. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 66, p. 1-7, 2016. |
DOI: |
10.1099/ijsem.0.001322 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Root nodule bacteria were isolated from nodules on Mimosa pudica L. growing in neutral?alkaline soils from the Distrito Federal in central Brazil. The 16S rRNA gene sequence analysis of 10 strains placed them into the genus Rhizobium with the closest neighbouring species (each with 99% similarity) being Rhizobium grahamii, Rhizobium cauense, Rhizobium mesoamericanum and Rhizobium tibeticum. This high similarity, however, was not confirmed by multi-locus sequence analysis (MLSA) using three housekeeping genes (recA, glnII and rpoB), which revealed R. mesoamericanum CCGE 501T to be the closest type strain (92% sequence similarity or less). Chemotaxonomic data, including fatty acid profiles [with majority being C19 : 0cyclo !8c and ummed feature 8 (C18 : 1!7c/C18 : 1!6c)], DNA G+C content (57.6 mol%), and carbon compound utilization patterns supported the placement of the novel strains in the genus Rhizobium. Results of average nucleotide identity (ANI) differentiated the novel strains from the closest species of the genus Rhizobium, R. mesoamericanum, R. grahamii and R. tibeticum with 89.0, 88.1 and 87.8% similarity, respectively. The symbiotic genes essential for nodulation (nodC) and nitrogen fixation (nifH) were most similar (99?100 %) to those of R. mesoamericanum, another Mimosa-nodulating species. Based on the current data, these 10 strains represent a novel species of the genus Rhizobium for which the name Rhizobium altiplanisp. nov. is proposed. The type strain is BR 10423T (=HAMBI 3664T). MenosRoot nodule bacteria were isolated from nodules on Mimosa pudica L. growing in neutral?alkaline soils from the Distrito Federal in central Brazil. The 16S rRNA gene sequence analysis of 10 strains placed them into the genus Rhizobium with the closest neighbouring species (each with 99% similarity) being Rhizobium grahamii, Rhizobium cauense, Rhizobium mesoamericanum and Rhizobium tibeticum. This high similarity, however, was not confirmed by multi-locus sequence analysis (MLSA) using three housekeeping genes (recA, glnII and rpoB), which revealed R. mesoamericanum CCGE 501T to be the closest type strain (92% sequence similarity or less). Chemotaxonomic data, including fatty acid profiles [with majority being C19 : 0cyclo !8c and ummed feature 8 (C18 : 1!7c/C18 : 1!6c)], DNA G+C content (57.6 mol%), and carbon compound utilization patterns supported the placement of the novel strains in the genus Rhizobium. Results of average nucleotide identity (ANI) differentiated the novel strains from the closest species of the genus Rhizobium, R. mesoamericanum, R. grahamii and R. tibeticum with 89.0, 88.1 and 87.8% similarity, respectively. The symbiotic genes essential for nodulation (nodC) and nitrogen fixation (nifH) were most similar (99?100 %) to those of R. mesoamericanum, another Mimosa-nodulating species. Based on the current data, these 10 strains represent a novel species of the genus Rhizobium for which the name Rhizobium altiplanisp. nov. is proposed. The type strain is BR 1... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Average nucleotide identity; Bacterial species; BR 10423; Multi locus sequence analysis; Rizóbio. |
Thesagro: |
Taxonomia. |
Thesaurus Nal: |
Taxonomy. |
Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
Marc: |
LEADER 02517naa a2200325 a 4500 001 2055950 005 2016-11-08 008 2016 bl --- 0-- u #d 024 7 $a10.1099/ijsem.0.001322$2DOI 100 1 $aBARAÚNA, A. C. 245 $aRhizobium altiplani sp. nov., isolated from effective nodules on Mimosa pudica growing in untypically alkaline soil in central Brazil. 260 $c2016 520 $aRoot nodule bacteria were isolated from nodules on Mimosa pudica L. growing in neutral?alkaline soils from the Distrito Federal in central Brazil. The 16S rRNA gene sequence analysis of 10 strains placed them into the genus Rhizobium with the closest neighbouring species (each with 99% similarity) being Rhizobium grahamii, Rhizobium cauense, Rhizobium mesoamericanum and Rhizobium tibeticum. This high similarity, however, was not confirmed by multi-locus sequence analysis (MLSA) using three housekeeping genes (recA, glnII and rpoB), which revealed R. mesoamericanum CCGE 501T to be the closest type strain (92% sequence similarity or less). Chemotaxonomic data, including fatty acid profiles [with majority being C19 : 0cyclo !8c and ummed feature 8 (C18 : 1!7c/C18 : 1!6c)], DNA G+C content (57.6 mol%), and carbon compound utilization patterns supported the placement of the novel strains in the genus Rhizobium. Results of average nucleotide identity (ANI) differentiated the novel strains from the closest species of the genus Rhizobium, R. mesoamericanum, R. grahamii and R. tibeticum with 89.0, 88.1 and 87.8% similarity, respectively. The symbiotic genes essential for nodulation (nodC) and nitrogen fixation (nifH) were most similar (99?100 %) to those of R. mesoamericanum, another Mimosa-nodulating species. Based on the current data, these 10 strains represent a novel species of the genus Rhizobium for which the name Rhizobium altiplanisp. nov. is proposed. The type strain is BR 10423T (=HAMBI 3664T). 650 $aTaxonomy 650 $aTaxonomia 653 $aAverage nucleotide identity 653 $aBacterial species 653 $aBR 10423 653 $aMulti locus sequence analysis 653 $aRizóbio 700 1 $aROUWS, L. F. M. 700 1 $aARAUJO, J. L. S. de 700 1 $aREIS JUNIOR, F. B. dos 700 1 $aIANNETTA, P. P. M. 700 1 $aMALUK, M. 700 1 $aGOI, S. R. 700 1 $aREIS, V. M. 700 1 $aJAMES, E. K. 700 1 $aZILLI, J. E. 773 $tInternational Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology$gv. 66, p. 1-7, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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141. | | SILVA, F. V.; de MEYER, S. E.; ARAUJO, J. L. S. de; BARBÉ, T. da C.; XAVIER, G. R.; O'HARA, J. K. A.; RUMJANEK, N. G.; WILLEMS, A.; ZILLI, J. E. Bradyrhizobium manausense sp. nov., isolated from effective nodules of Vigna unguiculata grown in Brazilian Amazonian rainforest soils. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 64, p. 2358-2363, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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142. | | MATOS, G. F. de; ZILLI, J. E.; ARAUJO, J. L. S. de; LEME, M. M. P.; MELO, I. S. de; RADL, V.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Bradyrhizobium sacchari sp. nov., a legume nodulating bacterium isolated from sugarcane roots Archives of Microbiology, 10 June 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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143. | | MATOS, G. F. de; ZILLI, J. E.; ARAUJO, J. L. S. de; LEME, M. M. P.; MELO, I. S. de; RADL, V.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Bradyrhizobium sacchari sp. nov., a legume nodulating bacterium isolated from sugarcane roots. Archives of Microbiology, v. 199, n. 9, p. 1251-1258, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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144. | | FERREIRA, J. de P.; PEIXOTO, R. C. L.; SOARES, C. de P.; MENESES, C. H. S. D. de; GALVÃO, P. G.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S. Caracterização funcional das ORFs GDI_0803 e GDI_1384 no transporte de ferro em Gluconacetobacter diazotrophicus In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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145. | | SERRATO, R. V.; MENESES, C. H. G de; SASSAKI, G. L; SANTANA FILHO, A. P.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; CHAVES, M. S.; IACOMINI, M.; BALDANI, J. I. Chemical and structural analysis on the exopolysaccharide produced by the nitrogen-fixing bacterium Gluconacetobacter diazotrophicus Pal5 In: ANNUAL MEETING OF BRAZILIAN BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY, 40., 2011, Foz do Iguaçu. Abstracts. São Paulo: SBBq, 2011Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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146. | | SILVA, C. F. da; ARAUJO, J. L. S. de; SILVA, E. M. R. da; PEREIRA, M. G.; SCHIAVO, J. A.; FREITAS, M. S. M. de; SAGGIN JUNIOR, O. J.; MARTINS, M. A. Comunidade de fungos micorrízicos arbusculares: diversidade, composição e glomalina em área revegetada com sesbânia. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 38, n. 2, p. 423-431, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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147. | | BARAÚNA, A. C.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS JUNIOR, F. B. dos; IANNETTA, P. P. M.; MALUK, M.; GOI, S. R.; REIS, V. M.; JAMES, E. K.; ZILLI, J. E. Rhizobium altiplani sp. nov., isolated from effective nodules on Mimosa pudica growing in untypically alkaline soil in central Brazil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 66, p. 1-7, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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148. | | BARAÚNA, A. C.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS JUNIOR, F. B. dos; IANNETTA, P. P. M.; MALUK, M.; GOI, S. R.; REIS, V. M.; JAMES, E. K.; ZILLI, J. E. Rhizobium altiplani sp. nov., isolated from effective nodules on Mimosa pudica growing in untypically alkaline soil in central Brazil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 66, p. 1-7, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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149. | | SILVA, C. F. da; ARAUJO, J. L. S. de; SILVA, E. M. R. da; PEREIRA, M. G.; SAGGIN JUNIOR, O. J.; FREITAS, M. S. M. de; MARTINS, M. A. Fungos micorrízicos arbusculares e proteína do solo relacionada à glomalina em àrea degradada por extração de argila e revegetada com Eucalipto e Acácia. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 22, n. 4, p. 757-769, out. dez., 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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150. | | SILVA, H. A. P da; OLIVEIRA, R. S. da S. de; GONÇALO, T. P.; SILVA, J. R. da; GALISA, P. de S.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Identificação de genes expressos em nódulos de feijão-caupi (Vigna unguiculata) submetido ao déficit hídrico. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 5 p. Trab. 843. 1 CD-ROM. FERTBIO 2010Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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151. | | RODRIGUES, E. P.; SOARES, C. de P.; GALVÃO, P. G.; IMADA, E. L.; ARAUJO, J. L. S. de; ROUWS, L. F. M.; OLIVEIRA, A. M. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Identification of genes involved in indole-3-acetic acid biosynthesis by Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 strain using transposon mutagenesis Frontiers in Microbiology, 7 oct., 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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152. | | MARTINS, E. M.; MARTINELLI, G.; ARBETMAN, M P.; LAMONT, R. W.; ARAUJO, J. L. S. de; POWELL, D.; CIAMPI-GUILLARDI, M.; BALDAUF, C.; QUINET, A.; GALISA, P.; SHAPCOTT, A. Development and characterization of microsatellite loci for Ocotea species (Lauraceae) threatened with extinction. Genetic and Molecular Research, v. 13, n. 3, p. 5138-5242, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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153. | | PEIXOTO, R. C. L.; FERREIRA, J. de P.; SOARES, C. de P.; MENESES, C. H. S. G. de; GALVÃO, P. G.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S. Envolvimento das ORFs GDI_1385 e GDI_1386 no transporte de ferro em Gluconacetobacter diazotrophicus. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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154. | | GALISA, P. S.; PEREIRA, W.; SILVA, H. A. P.; MOREIRA, I. M.; GONÇALO, T. P.; SILVA, J. R.; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M. Indentification of differential gene expression in sugarcane root inoculated with endophytic bacteria. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. SlV. 17Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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155. | | FISCHER, D.; PFITZNER, B.; SCHMID, M; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M.; PEREIRA, W.; ORMEÑO-ORRILO; HAI, B.; HOFMANN, A.; SCHLOTER, M.; MARTINEZ-ROMERO, E.; BALDANI, J. I.; HARTMANN, A. Molecular characterization of the diazotrophic bacterial community in uninoculated and inoculate field-grown sugarcane (Saccharum sp.). Plant and Soil, v. 356, p. 83-99, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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156. | | SOARES, C. de P.; GALVÃO, P. G.; MENESES, C. H. G.; RODRIGUES, E. P.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Mutação na região regulatória do grupo gênico tonB-exBD1D2 afeta a formação de biofilme em Gluconacetobacter diazotrophicus. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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157. | | GALISA, P. de S. G.; PEREIRA, W.; SILVA, H. A. P. da; MOREIRA, I. M.; GONÇALO, T. P.; SILVA, J. R. da; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M. Obtenção de fragmentos derivados de transcritos diferencialmente expressos em raízes de cana-de-açúcar inoculada com bactérias diazotróficas. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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158. | | SILVA, P. R. A. da; VIDAL, M. S.; SOARES, C. de P.; POLESE, V.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. Sugarcane apoplast fluid modulates the global transcriptional profile of the diazotrophic bacteria Paraburkholderia tropica strain Ppe8. PLOS ONE, v. 13, n. 12, e0207863, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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159. | | SOARES, C. de P.; TRADA-SFEIR, M. Z.; TERRA, L. A.; FERREIRA, J. de P.; SANTOS, C. M. dos; OLIVEIRA, I. G. B. de; ARAUJO, J. L. S. de; MENESES, C. H. S. G.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S. Transcriptomic Response of the Diazotrophic Bacteria Gluconacetobacter diazotrophicus strain PAL5 to Iron limitation and characterization of the fur regulatory network International Journal Of Molecular Sciences, v. 23, n. 15, e8533, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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160. | | TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; TEIXEIRA, K. R. dos S.; ARAUJO, J. L. S. de; CHAVES, M. S.; FREITAS, H. R. B. de; CRIVELARO, A. L. R.; NUNES, A. B. de C.; SANTOS, C. M. dos; ROSA, D. P. da S.; PADILHA, D. da S.; SILVA, E. da; MENDES, V. S.; FARINELLI, L.; CRUZ, L. M.; BALDANI, J. I. Draft genome sequence of Nitrospirillum amazonense strain CBAmC, a nitrogen fixer and plant growth promoter isolated from sugarcane, reveal bacterial potential benefits to cane culture In: INTERNATIONAL PGPR WORKSHOP, 10., Liége, 2015. Program and abstract book. Liége: Université de Liége, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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