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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
20/07/2021 |
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Data da última atualização: |
20/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KIWUKA, C.; GOUDSMIT, E.; TOURNEBIZE, R.; AQUINO, S. O. de; DOUMA, J. C.; BELLANGER, L.; CROUZILLAT, D.; STOFFELEN, P.; SUMIRAT, U.; LEGNATÉ, H.; MARRACCINI, P.; KOCHKO, A. de; ANDRADE, A. C.; MULUMBA, J. W.; MUSOLI, P.; ANTEN, N. P. R.; PONCET, V. |
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Afiliação: |
CATHERINE KIWUKA, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; EVA GOUDSMIT, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; RÉMI TOURNEBIZE, UNIV. MONTPELLIER - CIRAD; SINARA OLIVEIRA DE AQUINO, UNIV. MONTPELLIER - CIRAD; JACOB C. DOUMA, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; LAURENCE BELLANGER, NESTLÉ RESEARCH; DOMINIQUE CROUZILLAT, NESTLÉ RESEARCH; PIET STOFFELEN, MEISE BOTANIC GARDEN; UCU SUMIRAT, ICCRI; HYACINTHE LEGNATÉ, CNRA; PIERRE MARRACCINI, UNIV. MONTPELLIER; ALEXANDRE DE KOCHKO, UNIV. MONTPELLIER; ALAN CARVALHO ANDRADE, CNPCa; JOHN WASSWA MULUMBA, NATIONAL AGRICULTURAL RESEARCH ORGANIZATION; PASCAL MUSOLI, NATIONAL AGRICULTURAL RESEARCH ORGANIZATION; NIELS P. R. ANTEN, WAGENINGEN UNIVERSITY & RESEARCH; VALÉRIE PONCET, UNIV. MONTPELLIER - CIRAD. |
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Título: |
Genetic diversity of native and cultivated Ugandan Robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner): Climate influences, breeding potential and diversity conservation. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 16, n. 2, p. e0245965, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0245965 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Wild genetic resources and their ability to adapt to environmental change are critically important in light of the projected climate change, while constituting the foundation of agricultural sustainability. To address the expected negative effects of climate change on Robusta coffee trees (Coffea canephora), collecting missions were conducted to explore its current native distribution in Uganda over a broad climatic range. Wild material from seven forests could thus be collected. We used 19 microsatellite (SSR) markers to assess genetic diversity and structure of this material as well as material from two ex-situ collections and a feral population. The Ugandan C. canephora diversity was then positioned relative to the species? global diversity structure. Twenty-two climatic variables were used to explore variations in climatic zones across the sampled forests. Overall, Uganda's native C. canephora diversity differs from other known genetic groups of this species. In northwestern (NW) Uganda, four distinct genetic clusters were distinguished being from Zoka, Budongo, Itwara and Kibale forests A large southern-central (SC) cluster included Malabigambo, Mabira, and Kalangala forest accessions, as well as feral and cultivated accessions, suggesting similarity in genetic origin and strong gene flow between wild and cultivated compartments. We also confirmed the introduction of Congolese varieties into the SC region where most Robusta coffee production takes place. Identified populations occurred in divergent environmental conditions and 12 environmental variables significantly explained 16.3% of the total allelic variation across populations. The substantial genetic variation within and between Ugandan populations with different climatic envelopes might contain adaptive diversity to cope with climate change. The accessions that we collected have substantially enriched the diversity hosted in the Ugandan collections and thus contribute to ex situ conservation of this vital genetic resource. However, there is an urgent need to develop strategies to enhance complementary in-situ conservation of Coffea canephora in native forests in northwestern Uganda. MenosWild genetic resources and their ability to adapt to environmental change are critically important in light of the projected climate change, while constituting the foundation of agricultural sustainability. To address the expected negative effects of climate change on Robusta coffee trees (Coffea canephora), collecting missions were conducted to explore its current native distribution in Uganda over a broad climatic range. Wild material from seven forests could thus be collected. We used 19 microsatellite (SSR) markers to assess genetic diversity and structure of this material as well as material from two ex-situ collections and a feral population. The Ugandan C. canephora diversity was then positioned relative to the species? global diversity structure. Twenty-two climatic variables were used to explore variations in climatic zones across the sampled forests. Overall, Uganda's native C. canephora diversity differs from other known genetic groups of this species. In northwestern (NW) Uganda, four distinct genetic clusters were distinguished being from Zoka, Budongo, Itwara and Kibale forests A large southern-central (SC) cluster included Malabigambo, Mabira, and Kalangala forest accessions, as well as feral and cultivated accessions, suggesting similarity in genetic origin and strong gene flow between wild and cultivated compartments. We also confirmed the introduction of Congolese varieties into the SC region where most Robusta coffee production takes place. Identified popu... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Canephora; Genética Vegetal; Mudança Climática; Variação Genética; Variedade. |
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Thesaurus Nal: |
Climate change; Coffea canephora var. ugandae; Genetic variation. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224555/1/Genetic-diversity-of-native.pdf
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Marc: |
LEADER 03463naa a2200421 a 4500
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005 2021-07-20
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 2. |  | REICHEL, T.; ALVES, G. S. C.; AQUINO, S. O.; CARNEIRO, F.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P. Expression analysis ofdrebsubfamily genes in leaves and roots of Coffea canephora Conilon subjected to Drought. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFE SCIENCE, 26., 2016, China. The programm & abstrcets... China: Asic, 2016. p. 183.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 3. | | AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, E. C. S.; DUARTE, K. E.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P. Análise de promotores do gene CcDREBID de Coffea canephora via transformação genética de Nicotiana tabacum. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 4. | | AQUINO, S. O.; CARNEIRO, FERNANDA A; REGO, E. C. S.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Functional analysis of different promoter haplotypes of the coffee (Coffea Canephora) CcDREB1D gene through genetic transformation of Nicotiana tabacum. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFE SCIENCE, 26., 2016, China. The programm & abstrcets... China: Asic, 2016. p. 184.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 5. | | COTTA, M. G.; BOCS, S.; REGO, E. C. S.; COSTA, T. S.; AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. De A.; THIS, D.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Estudo das famílias gênicas CcPYL, CcPP2C e CcSnRK2: componentes centrais na via aba-dependente para a resposta ao déficit hídrico em Coffea Canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., Curitiba. Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 6. | | AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, E. C. S.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI. P.; ANDRADE, A. C. Functional analysis of CcDREB1D promoter region from haplotypes of Coffea canephora through genetic transformation of Nicotiana tabacum. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-46.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | VALERIANO, J. C.; LIMA, E. A. de; AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. de A.; CARNEIRO, W. W. de J.; MATTOS, N. G.; CARNEIRO, R. M. D. G.; ANDRADE, A. C. Expressão alelo específica em Coffea canephora associados à resistência a nematoides. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação de uma plataforma de genotipagem em larga escala para Coffea canéfora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | CARNEIRO, F. A.; RÊGO, É. C. S.; COSTA, T. S.; LIMA, E. A.; AQUINO, S. O.; ROCHA, O. C.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. F.; BARTHOLO, G. F.; GUERRA, A. F.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Phenotyping and genotyping a Coffea canephora population, cultivated at high altitude, aiming at a GWS program for coffee. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-46. PB235.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | AQUINO, S. O. de; KIWUKA, C.; TOURNEBIZE, R.; GAIN, C.; MARRACCINI, P.; MARIAC, C.; BETHUNE, K.; COUDERC, M.; CUBRY, P.; ANDRADE, A. C.; LEPELLEY, M.; DARRACQ, O.; CROUZILLAT, D.; ANTEN, N.; MUSOLI, P.; VIGOUROUX, Y.; KOCHKO, A. de; MANEL, S.; FRANÇOIS, O.; PONCET, V. Adaptive potential of Coffea canephora from Uganda in response to climate change. Molecular ecology, v. 31, n. 6, p. 180-1819, Jan. 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 11. | | CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, É. C. S.; AQUINO, S. O. de; COSTA, T. S.; LIMA, E. A. de; ROCHA, O. C.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; MARRACCINI, P.; BARTHOLO, G. F.; GUERRA, A. F.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Estrutura e diversidade genética de uma população de Coffea canephora conilon utilizando marcadores SNPs identificados por nextRAD. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Consórcio pesquisa café: oportunidades e novos desafios: anais. Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 12. | | CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, É. C. S.; AQUINO, S. O. de; COSTA, T. S.; LIMA, E. A. de; ROCHA, O. C.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; MARRACCINI, P.; BARTHOLO, G. F.; GUERRA, A. F.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Estrutura e diversidade genética de uma população de Coffea canephora conilon utilizando marcadores SNPs identificados por nextRAD. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Consórcio pesquisa café: oportunidades e novos desafios: anais. Brasília, DF: Embrapa Café, 2015. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 13. | | CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, É. C. S.; AQUINO, S. O. de; COSTA, T. S.; LIMA, E. A. de; ROCHA, O. C.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; MARRACCINI, P.; BARTHOLO, G. F.; GUERRA, A. F.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Estrutura e diversidade genética de uma população de Coffea canephora conilon utilizando marcadores SNPs identificados por nextRAD. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., 2015, Curitiba. Consórcio pesquisa café: oportunidades e novos desafios: anais. Brasília, DF: Embrapa Café, 2015. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 14. | | CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; VIEIRA JUNIOR, I. C.; BALESTRE, M.; ANDRADE, A. C. Estudo de associação genômica ampla para importantes características agronômicas em Coffea canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. 5 p. Título em inglês: Genome-wide association studies for important agronomic traits in Coffea canephora.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; VIEIRA JUNIOR, I. C.; BALESTRE, M.; ANDRADE, A. C. Estudo de associação genômica ampla para importantes características agronômicas em Coffea canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. 5 p. Título em inglês: Genome-wide association studies for important agronomic traits in Coffea canephora.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 16. | | TORRES, L. F.; REICHEL, T.; DECHAMP, E.; AQUINO, S. O. de; DUARTE, K. E.; ALVES, G. S. C.; SILVA, A. T.; COTTA, M. G.; COSTA, T. S.; DINIZ, L. E. C.; BREITLER, J. C.; COLLIN, M.; PAIVA, P. V.; ANDRADE, A. C.; ETIENNE, H.; MARRACCINI, P. Expression of DREB-Like genes in coffea canephora and C. arabica subjected to various types of abiotic stress. Tropical Plant Biology, March, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 17. | | CARNEIRO, F. A.; RÊGO, E. C. S.; AQUINO, S. O.; COSTA, T. S.; LIMA, E. A.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GUERRA, A. F.; BARTHOLO, G. F.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Genome wide association study for drough toerance and other agronomic trais of a Coffea canephora opulation. In: THE SOLANACEAE CONFERENCE, 12., 2015. Bourdeaux, France. Book of abstracts... Bourdeaux, France, 2015 p. 59| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 18. | | KIWUKA, C.; GOUDSMIT, E.; TOURNEBIZE, R.; AQUINO, S. O. de; DOUMA, J. C.; BELLANGER, L.; CROUZILLAT, D.; STOFFELEN, P.; SUMIRAT, U.; LEGNATÉ, H.; MARRACCINI, P.; KOCHKO, A. de; ANDRADE, A. C.; MULUMBA, J. W.; MUSOLI, P.; ANTEN, N. P. R.; PONCET, V. Genetic diversity of native and cultivated Ugandan Robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner): Climate influences, breeding potential and diversity conservation. Plos One, v. 16, n. 2, p. e0245965, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 19. | | MARRACCINI, P.; VIEIRA, N. G.; DUARTE, K. E.; AQUINO, S. O.; CARNEIRO, F. A.; COSTA, T. S.; SUJII, P. S.; VINECKY, F.; ALEKCEVETCH, J. C.; ALVES, G. S. C.; LEROY, T.; BELLIS, F. de; FERRÃO, M. A. G.; DAMATTA, F. M.; POT, D.; SILVA, V. A.; RODRIGUES, G. C.; ANDRADE, A. C. Molecular responses of coffee plants to drought stress. In: WORKSHOP ON BIOTIC AND ABIOTIC STRESS TOLERANCE IN PLANTS, 2013, Ilheus. The challenge for the 21st century: book of abstracts. Ilhéus: International Advanced Biology Consortium, 2013. p. 29. Resumo S04T04.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 20. | | CARNEIRO, F. A.; RÊGO, É. C. S.; COSTA, T. S.; LIMA, E. A.; AQUINO, S. O.; ROCHA, O. C.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. F.; ROCHA, A. N.; BARTHOLO, G. F.; MARRACCINI, P.; GUERRA, A. F.; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Phenotyping and genotyping a Coffea canephora population, cultivated at high altitude, aiming at a GWS program for coffee. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. Leveraging Knowledge for coffee sustainability: programme & abstracts. [Armenia]: ASIC, 2014. p. 269-270. PB235.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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