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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
18/06/2012 |
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Data da última atualização: |
03/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GUIMARÃES-DIAS, F.; NEVES-BORGES, A. C.; VIANA, A. A. B.; MESQUITA, R. O.; ROMANO, E.; GROSSI-DE-SÁ, M. de F.; NEPOMUCENO, A. L.; LOUREIRO, M. E.; ALVES-FERREIRA, M. |
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Afiliação: |
FÁBIA GUIMARÃES DIAS, UFRJ; ANNA CRISTINA NEVES-BORGES, UNIRIO; ANTONIO AMERICO BARBOSA VIANA, CENARGEN; ROSILENE OLIVEIRA MESQUITA, UFV; EDUARDO ROMANO DE CAMPOS PINTO, CENARGEN; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; MARCELO EHLERS LOUREIRO, UFV; MÁRCIO ALVES-FERREIRA, UFRJ. |
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Título: |
Expression analysis in response to drought stress in soybean: shedding light on the regulation of metabolic pathway genes. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 222-232, May 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Metabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plants. MenosMetabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plan... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; QPCR. |
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Thesagro: |
Gene; Genoma; Resistência a seca; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Biochemical pathways; Bioinformatics; Drought tolerance; Genes; Genome; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61069/1/gmb.expression.anal.v35n1s.222-232.2012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
20/10/2011 |
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Data da última atualização: |
20/10/2011 |
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Autoria: |
REIS, I. P. dos; MARTINS-DA-SILVA, R. C. V. |
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Afiliação: |
Ilka Pinto dos Reis, Bolsista do PIBIC/Fapespa/Embrapa; REGINA CELIA VIANA MARTINS DA SILVA, CPATU. |
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Título: |
Levantamento das papilionoideae (Leguminosae) ocorrentes no estado do Pará. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO CIENTÍFICO DA UFRA, 7.; SEMINÁRIO [DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA] DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 13.; SEMINÁRIO DE PESQUISA DA UFRA, 1., 2009, Belém, PA. Pesquisa e desenvolvimento tecnológico na formação do jovem cientista: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A família Leguminosae está representada por três subfamílias (Mimosoideae, Caesalpinioideae e Faboideae ou Papilionoideae), 727 gêneros e 19.325 espécies. A subfamília Papilionoideae reúne 28 tribos, 500 gêneros e 13.800 espécies. Devido à ampla distribuição geográfica das leguminosas na Amazônia e ao potencial econômico, o estudo dessa família torna-se muito importante para a região. Este trabalho objetivou realizar o levantamento das Papilionoideae ocorrentes no estado do Pará, registradas nos Herbários IAN da Embrapa Amazônia Oriental e MG do Museu Paraense Emílio Goeld. A coleção de Papilionoideae do Herbário IAN tem cerca de 8.000 exemplares disponíveis no banco de dados do sistema BRAHMS (Botanical Research and Herbarium Mangement System). Porém havia necessidade de conferir essas informações e corrigi-las quando necessário a fim de aprimorar essa base de dados. Procedeu-se a correção, conferindo os dados diretamente com as imagens das exsicatas. A seguir, foi realizado o levantamento no Herbário MG (Museu Paraense Emílio Goeldi), durante o qual, foram fotografadas 4.000 exsicatas de Paplilionoideae coletadas no Pará e das quais não se encontravam duplicatas no acervo do Herbário IAN. No acervo IAN existem 3.161 exemplares de Papilionoideae coletados no estado do Pará, os quais correspondem a 12 tribos, 77 gêneros e 434 espécies. |
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Palavras-Chave: |
Inventário florístico. |
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Thesagro: |
Herbário; Taxonomia. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/44060/1/27.pdf
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Marc: |
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300 $c1 CD-ROM.
520 $aA família Leguminosae está representada por três subfamílias (Mimosoideae, Caesalpinioideae e Faboideae ou Papilionoideae), 727 gêneros e 19.325 espécies. A subfamília Papilionoideae reúne 28 tribos, 500 gêneros e 13.800 espécies. Devido à ampla distribuição geográfica das leguminosas na Amazônia e ao potencial econômico, o estudo dessa família torna-se muito importante para a região. Este trabalho objetivou realizar o levantamento das Papilionoideae ocorrentes no estado do Pará, registradas nos Herbários IAN da Embrapa Amazônia Oriental e MG do Museu Paraense Emílio Goeld. A coleção de Papilionoideae do Herbário IAN tem cerca de 8.000 exemplares disponíveis no banco de dados do sistema BRAHMS (Botanical Research and Herbarium Mangement System). Porém havia necessidade de conferir essas informações e corrigi-las quando necessário a fim de aprimorar essa base de dados. Procedeu-se a correção, conferindo os dados diretamente com as imagens das exsicatas. A seguir, foi realizado o levantamento no Herbário MG (Museu Paraense Emílio Goeldi), durante o qual, foram fotografadas 4.000 exsicatas de Paplilionoideae coletadas no Pará e das quais não se encontravam duplicatas no acervo do Herbário IAN. No acervo IAN existem 3.161 exemplares de Papilionoideae coletados no estado do Pará, os quais correspondem a 12 tribos, 77 gêneros e 434 espécies.
650 $aHerbário
650 $aTaxonomia
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773 $tIn: SEMINÁRIO CIENTÍFICO DA UFRA, 7.; SEMINÁRIO [DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA] DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 13.; SEMINÁRIO DE PESQUISA DA UFRA, 1., 2009, Belém, PA. Pesquisa e desenvolvimento tecnológico na formação do jovem cientista: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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