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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
04/01/2023 |
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Data da última atualização: |
04/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BARBOSA, E. A.; ALVES, G. S. C.; COURA, M. de M. A.; SILVA, H. de L. e; ROCHA, F. S. da; NUNES, J. B.; WATANABE, M. de S.; ANDRADE, A. C.; BRANDA, G. D. |
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Afiliação: |
EDER ALVES BARBOSA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; GABRIEL SÉRGIO COSTA ALVES, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; MARCELO DE MELO ANDRADE COURA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; HIGOR DE LIMA E SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; FILIPE SOUZA DA ROCHA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; JOÃO BUENO NUNES, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; MATHEUS DE SOUZA WATANABE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALAN CARVALHO ANDRADE, CNPCa; GUILHERME DOTTO BRANDA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
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Título: |
A first look at the N- and O-glycosylation landscape in anuran skin secretions. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Biochimie, v. 197, Jun., p.19-37, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.biochi.2022.01.008 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Amphibians secrete a complex array of molecules that shape their interactions with coinhabiting microorganisms and macroscopic predators. Glycans are a rapidly evolving and complex class of biomolecules implicated in intrinsic and extrinsic recognition events. Despite the numerous studies aiming at the biochemical characterization of anuran skin secretions, little is known about protein-linked oligosaccharides, their synthesis pathways, and their homing secreted glycoproteins. In the present report, LC-MS/MS was used to investigate the diversity of N- and O-linked oligosaccharides in the skin secretion of two South American frogs, Pithecopus azureus and Boana raniceps. Additionally, the enzymes responsible for glycan synthesis pathways were evaluated based on their skin tissue transcriptome. Our analyses allowed the annotation of various N- and O-glycan structures commonly found in vertebrate proteins. Paucimannosidic glycans were abundant in the skin secretion of both amphibians; however, hybrid and complex N-glycan structures were detected only in B. raniceps. A good correlation between the structures discovered in glycomic analyses and transcripts encoding enzymes necessary for their synthesis was obtained. Some transcripts such as those of MAN1A2, FUT8, and ST6GALNAC were found solely in B. raniceps. Finally, secreted N- and O- linked glycoproteins were predicted from the transcriptomic data, indicating that proteases and protease inhibitors are putative sources of the glycans described herein. Overall, our results show the presence of oligosaccharides in amphibians skin secretions and suggest that their diversity is species-specific, paving the way for novel perspectives involving amphibian evolution and ecology. MenosAmphibians secrete a complex array of molecules that shape their interactions with coinhabiting microorganisms and macroscopic predators. Glycans are a rapidly evolving and complex class of biomolecules implicated in intrinsic and extrinsic recognition events. Despite the numerous studies aiming at the biochemical characterization of anuran skin secretions, little is known about protein-linked oligosaccharides, their synthesis pathways, and their homing secreted glycoproteins. In the present report, LC-MS/MS was used to investigate the diversity of N- and O-linked oligosaccharides in the skin secretion of two South American frogs, Pithecopus azureus and Boana raniceps. Additionally, the enzymes responsible for glycan synthesis pathways were evaluated based on their skin tissue transcriptome. Our analyses allowed the annotation of various N- and O-glycan structures commonly found in vertebrate proteins. Paucimannosidic glycans were abundant in the skin secretion of both amphibians; however, hybrid and complex N-glycan structures were detected only in B. raniceps. A good correlation between the structures discovered in glycomic analyses and transcripts encoding enzymes necessary for their synthesis was obtained. Some transcripts such as those of MAN1A2, FUT8, and ST6GALNAC were found solely in B. raniceps. Finally, secreted N- and O- linked glycoproteins were predicted from the transcriptomic data, indicating that proteases and protease inhibitors are putative sources of the g... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Mass spectrometry; Oligosaccharides; Transcriptomics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| Registros recuperados : 64 | |
| 2. |  | ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Análise da expressão de genes candidatos para a tolerância à seca, em genótipos de Coffea arabica, por PCR quantitativo. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 019. p. 59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | REICHEL, T.; ALVES, G. S. C.; AQUINO, S. O.; CARNEIRO, F.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P. Expression analysis ofdrebsubfamily genes in leaves and roots of Coffea canephora Conilon subjected to Drought. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFE SCIENCE, 26., 2016, China. The programm & abstrcets... China: Asic, 2016. p. 183.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 4. | | VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Caracterização de genótipos de Coffea canephora tolerantes ao estresse hídrico. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.132.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C. RNA-Seq em Coffea arabica: genes candidatos em condições de estresse abiótico. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 6. | | TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C. Transcriptome analysis in Coffea arabica, under several abiotic stresses, reveals differentially expressed genes in leaves. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 7. | | ALVES, G. S. C.; RAMOS, H.; RODRIGUES, G. C.; VIEIRA, L. G. E.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Estresse hídrico altera o perfil de expressão de isoformas da subunidade menor (RBCS) da rubisco em folhas de Coffea arabica e Coffea canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | RODRIGUES, G. C.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H.; VIEIRA, L. G. E.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Estresse hídrico altera o perfil de expressão de isoformas da subunidade menor (RBCS) da rubisco em folhas de Coffea arabica e Coffea canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 9. | | AQUINO, S. O.; CARNEIRO, FERNANDA A; REGO, E. C. S.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Functional analysis of different promoter haplotypes of the coffee (Coffea Canephora) CcDREB1D gene through genetic transformation of Nicotiana tabacum. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFE SCIENCE, 26., 2016, China. The programm & abstrcets... China: Asic, 2016. p. 184.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 10. | | MERA, A. C.; ALVES, G. S. C.; GUYOT, B.; DAVRIEUX, F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Efeitos de estresse hídrico na composição bioquímica de grãos de Coffea arabica Cv. Rubi. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | MERA, A. C.; ALVES, G. S. C.; GUYOT, B.; DAVRIEUX, F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Efeitos de estresse hídrico na composição bioquímica de grãos de coffea arabica cv. rubi. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 14. | | VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; FREIRE, L. P.; VIEIRA, N. G.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Identificação e caracterização de genes candidatos para a tolerância à seca em clones de café Conilon (Coffea canephora). In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | FREIRE, L. P.; VIEIRA, N. G.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; HEIMBECK, I. G. R.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Análise de expressão e polimorfismo nucléicos de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | GOMES, T. G.; HADI, S. I. I. A.; ALVES, G. S. C.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. Current Strategies for the Detoxification of Jatropha curcas Seed Cake: A Review. Journal of Agricultural and Food Chemistry, v. 66, n. 11, p. 2510-2522, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 17. | | ALVES, G. S. C.; DECHAMP, E.; FREIRE, L. P.; POT, D.; THIS, D.; PAIVA, L. V.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H. Characterization of CcDREB1D promoter region from contrasting genotypes of Coffea canephora by homologous transformation in Coffea Arabica. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-47.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | PEREIRA, L. F. P.; CAÇÃO, S. M. B.; SILVA, N. V.; DINIZ, L. E. C.; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; ANDRADE, A. C.; VIEIRA, L. G. E. Construction of a Coffea arabica bacterial artificial chromosome library. In: ENCUENTRO LATINO AMERICANO Y DEL CARIBE DE BIOTECNOLOGIA AGROPECUARIA: REDBIO 2007, 6., 2007, Viña del Mar, Chile. Abstracts and posters? Roma: FAO, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | GOMES, T. G.; ALVES, G. S. C.; HADI, S. I. I. A.; COSTA, M. M. do C.; MENDONCA, S.; MILLER, R. N. G.; SIQUEIRA, F. G. de. Expressão diferencial de genes em Pleurotus pulmonarius associados a degradação enzimática e destoxificação da torta de pinhão-manso. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 18.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 20. | | FREIRE, L. P.; VIEIRA, N. G.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; LEROY, T.; POT, D.; ELBELT, S.; MARQUES, T.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Expression analysis and nucleic polymorphism of candidate genes for drought tolerance in coffee. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 2010, Bali. Preceedings... [S.l]: Association for Science and Information on Coee (ASIC), 2010. p. 382-388| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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