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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
24/10/2014 |
Data da última atualização: |
16/11/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOMAVILLA, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; COUTINHO, L. L.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
A. L. SOMAVILLA, Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento Animal, UNESP/FCAV, Jaboticabal, Brasil; T. S. SONSTEGARD, Bovine Functional Genomics Laboratory, ANRI, USDA-ARS, Beltsville, MD, USA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ANTONIO DO NASCIMENTO ROSA, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; L. L. COUTINHO, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq), USP, Piracicaba, Brasil; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 45, n. 6, p. 771-781, dec. 2014 |
DOI: |
10.1111/age.12210 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Brazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, which might be used to better understand autozygosity and the effects of selection on the Nellore genome. MenosBrazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, whic... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Desequilíbrio de ligação; Homozigose do haplótipo estendido; Polimorfismo de nucleotídeo único; Relative extended haplotype homozygosity; Single nucleotid; Single nucleotide polymorphisms. |
Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de corte. |
Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Genotyping; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/110576/1/PROCI-2014.00083-2.pdf
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Marc: |
LEADER 02827naa a2200397 a 4500 001 1998406 005 2022-11-16 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1111/age.12210$2DOI 100 1 $aSOMAVILLA, A. L. 245 $aA genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aBrazilian Nellore cattle (Bos indicus) have been selected for growth traits for over more than four decades. In recent years, reproductive and meat quality traits have become more important because of increasing consumption, exports and consumer demand. The identification of genome regions altered by artificial selection can potentially permit a better understanding of the biology of specific phenotypes that are useful for the development of tools designed to increase selection efficiency. Therefore, the aims of this study were to detect evidence of recent selection signatures in Nellore cattle using extended haplotype homozygosity methodology and BovineHD marker genotypes (>777 000 single nucleotide polymorphisms) as well as to identify corresponding genes underlying these signals. Thirty-one significant regions (P < 0.0001) of possible recent selection signatures were detected, and 19 of these overlapped quantitative trait loci related to reproductive traits, growth, feed efficiency, meat quality, fatty acid profiles and immunity. In addition, 545 genes were identified in regions harboring selection signatures. Within this group, 58 genes were associated with growth, muscle and adipose tissue metabolism, reproductive traits or the immune system. Using relative extended haplotype homozygosity to analyze high-density single nucleotide polymorphism marker data allowed for the identification of regions potentially under artificial selection pressure in the Nellore genome, which might be used to better understand autozygosity and the effects of selection on the Nellore genome. 650 $aBeef cattle 650 $aGenotyping 650 $aLinkage disequilibrium 650 $aSingle nucleotide polymorphism 650 $aBos Indicus 650 $aGado de corte 653 $aDesequilíbrio de ligação 653 $aHomozigose do haplótipo estendido 653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único 653 $aRelative extended haplotype homozygosity 653 $aSingle nucleotid 653 $aSingle nucleotide polymorphisms 700 1 $aSONSTEGARD, T. S. 700 1 $aHIGA, R. H. 700 1 $aROSA, A. do N. 700 1 $aSIQUEIRA, F. 700 1 $aSILVA, L. O. C. da 700 1 $aTORRES JUNIOR, R. A. de A. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aMUDADU, M. de A. 700 1 $aALENCAR, M. M. de 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tAnimal Genetics$gv. 45, n. 6, p. 771-781, dec. 2014
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Registros recuperados : 878 | |
861. | | SOUZA, M. M.; BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; MALAGÓ-JR, W.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Searching for snp in capn1 gene and its association with shear force in nellore cattle. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, (supl. 1), p. 233, 2011Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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862. | | SOUZA, M. M.; DONATONI, F. A. B.; TIZIOTO, P. C.; MALOGÓ JUNIOR, W.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Searching for snp in capn1 gene and its association with shear force in nellore cattle. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, p. 233, 2011. (supl. 1). Memorias de la XXII Reunión ALPA, Montevideo, Uruguay. 24?26 octubre de 2011. 1 p. ALPA.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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863. | | REGITANO, L. C. de A.; IBELLI, A. M.; GASPARIN, G.; MIYATA, M.; AZEVEDO, A. L. S.; COUTINHO, L. L.; TEODORO, R. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; NAKATA, L. C.; ZAROS, L. G.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, A. M.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, M. C. de S. On the search for markers of tick resistance in bovines. Developments in Biologicals, v. 132, p. 225-230, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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864. | | REGITANO, L. C. A.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; MIYATA, M.; AZEVEDO, A. L. S.; COUTINHO, L. L.; TEODORO, R. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; NAKATA, L. C.; ZAROS, L. G.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, A. M.; ALENCAR, M. M.; OLIVEIRA, M. C. S. On the search for markers of tick resistance in bovines. In: PINARD, M.; GAY, C.; PASTORET, P.; DODET, B. (Ed.). Animal genomics for animal healt. Basel, Karger: Dev Biol, 2008. p. 225-230. 132Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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865. | | BUZANSKAS, M. E.; VENTURA, R. V.; CHUD, T. C. S.; BERNARDES, P. A.; SANTOS, D. J. de A.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MUDADU, M. de A.; ZANELLA, R.; SILVA, M. V. G. B.; LI, C.; SCHENKE, F. S.; MUNARI, D. P. Study on the introgression of beef breeds in canchim cattle using single nucleotide polymorphism markers. Plos one, v. 12, p. 1-16, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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866. | | TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; VENERONE, G. B.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A. A SNP in ASAP1 gene is associated with meat quality and production traits in Nelore breed. Meat Science, v. 92, n. 4, p. 855-857, dec. 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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867. | | TIZIOTO, P. C.; DECKER, J. E.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. de A.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A. Genome scan for meat quality traits in Nelore beef cattle. Physiological genomics, v. 45, n. 21, p. 1012-1020, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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868. | | TIZIOTO, P. C.; DECKER, J. E.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. de A.; SILVA, F. L.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES, R. A.; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; REGITANO, L. C. de A. Genome scan for meat quality traits in Nelore beef cattle. Physiological Genomics, v. 45, n. 21, p. 1012-1020, September 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte. |
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869. | | TIZIOTO, P. C.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. de A.; SILVA, F. L.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO. L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A. Genome scan revealed new pathways related to meat tenderness in Nelore beef cattle. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.08.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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870. | | TIZIOTO, P. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. A.; SILVA, F. L.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ROSA, A. N.; ALENCAR, M. M.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJÓ, G. L. D.; SILVA, L. O. C.; TORRES, R. A.; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A. Genome scan revealed new pathways related to meat tenderness in Nelore beef cattle. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 15. ISAFG 2013. AB.08.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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871. | | TIZIOTO, P. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MUDADU, M. A.; SILVA, F. L.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ROSA, A. N.; ALENCAR, M. M.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R.; NASSU, R. T.; FEIJÓ, G. L. D.; SILVA, L. O. C.; TORRES, R. A.; SIQUEIRA, F.; HIGA, R. H.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A. Genome scan revealed new pathways related to meat tenderness in Nelore beef cattle. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 15. ISAFG 2013. AB.08.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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872. | | TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; DECKER, J. E.; GROMBONI, C. F.; MUDADU, M. de A.; SCHNABEL, R. D.; COUTINHO, L. L.; MOURAO, G. B.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M.; REECY, J. M.; NASSU, R. T.; DONATONI, F. A. B.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A. Detection of quantitative trait loci for mineral content of Nelore longissimus dorsi muscle. Genetics Selection Evolution, v. 47, n. 15, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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873. | | CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; ALENCAR, M. M. de; ESTEVES, S. N.; FREITAS, A. R. de; BARROS, A. T. M. de; BRITO, L. G.; VIEIRA, L. C.; HASSUM, I. C.; BRANDAO, H. de M.; CHAVES, F. C. M.; BIZZO, H. R.; MOLENTO, M. B.; KATIKI, L. M.; SILVA, M. F. F. da; CORRÊA, A. G.; FURLAN, M.; FOGLIO, M. A.; RODRIGUES, R. A. F.; CARVALHO, J. E.; REHDER, V. L. G. Pesquisa de compostos bioativos vegetais para o controle de parasitas de ruminantes. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1., 2009, Campo Grande. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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874. | | CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; ALENCAR, M. M. de; ESTEVES, S. N.; FREITAS, A. R. de; BARROS, A. T. M. de; BRITO, L. G.; VIEIRA, L. C.; HASSUM, I. C.; BRANDAO, H. de M.; CHAVES, F. C. M.; BIZZO, H. R.; MOLENTO, M. B.; KATIKI, L. M.; SILVA, M. F. F. da; CORRÊA, A. G.; FURLAN, M.; FOGLIO, M. A.; RODRIGUES, R. A. F.; CARVALHO, J. E.; REHDER, V. L. G. Pesquisa de compostos bioativos vegetais para o controle de parasitas de ruminantes. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1., 2009, Campo Grande. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 CD-ROMTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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875. | | CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; ALENCAR, M. M. de; ESTEVES, S. N.; FREITAS, A. R. de; BARROS, A. T. M. de; BRITO, L. G.; VIEIRA, L. da S.; HASSUM, I. C.; BRANDÃO, H. de M.; CHAVES, F. C. M.; BIZZO, H. R.; MOLENTO, M. B.; KATIKI, L. M.; SILVA, M. F. F. da; CORRÊA, A. G.; FURLAN, M.; FOGLIO, M. A.; RODRIGUES, R. A. F.; CARVALHO, J. E.; REHDER, V. L. G. Pesquisa de compostos bioativos vegetais para o controle de parasitas de ruminantes. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1., 2009, Campo Grande. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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876. | | MUDADU, M. de A.; PORTO NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P. D.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A. Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of brazilian nelore beef cattle. BMC Genomics, v. 17, n. 235, p. 1-16, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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877. | | MUDADU, M. de A.; PORTO-NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P.; NASCIMENTO, M. L.; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A. Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of Brazilian Nelore beef cattle. BMC Genomics, London, v. 17, p. 1-16, Mar. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte. |
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878. | | MUDADU, M. de A.; PORTO NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P. D.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A. Erratum to: 'Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of brazilian nelore beef cattle'. BMC Genomics, v. 17, n. 492, p. 1-2, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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