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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
21/07/2022 |
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Data da última atualização: |
21/07/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BITTENCOURT, C. B.; SILVA, T. L. C. da; RODRIGUES NETO, J. C.; VIEIRA, L. R.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
CLEITON BARROSO BITTENCOURT, Universidade Federal de Lavras; THALLITON LUIZ CARVALHO DA SILVA, Universidade Federal de Lavras; JORGE CÂNDIDO RODRIGUES NETO; LETÍCIA RIOS VIEIRA, Universidade Federal de Lavras; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE; CARLOS ANTONIO FERREIRA DE SOUSA, CPAMN; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
Insights from a Multi-Omics Integration (MOI) Study in Oil Palm (Elaeis gineensis Jacq.) Response to Abiotic Stresses: Part One?Salinity. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Plants, 11, n. 1755, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/plants11131755 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) is the number one source of consumed vegetable oil nowadays. It is cultivated in areas of tropical rainforest, where it meets its natural condition of high rainfall throughout the year. The palm oil industry faces criticism due to a series of practices that was considered not environmentally sustainable, and it finds itself under pressure to adopt new and innovative procedures to reverse this negative public perception. Cultivating this oilseed crop outside the rainforest zone is only possible using artificial irrigation. Close to 30% of the world?s irrigated agricultural lands also face problems due to salinity stress. Consequently, the research community must consider drought and salinity together when studying to empower breeding programs in order to develop superior genotypes adapted to those potential new areas for oil palm cultivation. Multi-Omics Integration (MOI) offers a new window of opportunity for the non-trivial challenge of unraveling the mechanisms behind multigenic traits, such as drought and salinity tolerance. The current study carried out a comprehensive, large-scale, single-omics analysis (SOA), and MOI study on the leaves of young oil palm plants submitted to very high salinity stress. Taken together, a total of 1239 proteins were positively regulated, and 1660 were negatively regulated in transcriptomics and proteomics analyses. Meanwhile, the metabolomics analysis revealed 37 metabolites that were upregulated and 92 that were downregulated. After performing SOA, 436 differentially expressed (DE) full-length transcripts, 74 DE proteins, and 19 DE metabolites ffected by this stress, with at least one DE molecule in all three omics platforms used. The Cysteine and methionine metabolism (map00270) and Glycolysis/Gluconeogenesis (map00010) pathways were the most affected ones, each one with 20 DE molecules. MenosOil palm (Elaeis guineensis Jacq.) is the number one source of consumed vegetable oil nowadays. It is cultivated in areas of tropical rainforest, where it meets its natural condition of high rainfall throughout the year. The palm oil industry faces criticism due to a series of practices that was considered not environmentally sustainable, and it finds itself under pressure to adopt new and innovative procedures to reverse this negative public perception. Cultivating this oilseed crop outside the rainforest zone is only possible using artificial irrigation. Close to 30% of the world?s irrigated agricultural lands also face problems due to salinity stress. Consequently, the research community must consider drought and salinity together when studying to empower breeding programs in order to develop superior genotypes adapted to those potential new areas for oil palm cultivation. Multi-Omics Integration (MOI) offers a new window of opportunity for the non-trivial challenge of unraveling the mechanisms behind multigenic traits, such as drought and salinity tolerance. The current study carried out a comprehensive, large-scale, single-omics analysis (SOA), and MOI study on the leaves of young oil palm plants submitted to very high salinity stress. Taken together, a total of 1239 proteins were positively regulated, and 1660 were negatively regulated in transcriptomics and proteomics analyses. Meanwhile, the metabolomics analysis revealed 37 metabolites that were upregulated and 92 t... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
African oil palm; Integratomics. |
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Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Metabolomics; Proteomics; Transcriptomics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144868/1/MANOEL-SEG-12.15.00.007.00.19-Bittencourt-et-al-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| 82. |  | VIANNA, R. B.; VIEIRA, F. S.; SOUTO, A. L.; MENDES, T. D.; COSTA, P. P. K. G.; ABDELNUR, P. V.; RODRIGUES, C. M.; DAMASO, M. C. T. Seleção de cepa produtora de ácido kójico a partir de glicerina bruta de soja. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 4.,2017, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 101-106.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 83. | | SOUZA JUNIOR, M. T.; ALVES, A. A.; SOUSA, C. A. F. de; SIQUEIRA, F. G. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; ABDELNUR, P. V.; MENDONCA, S. O Programa de PD&I em Ômica de Palma de Óleo (Elaeis spp.) na Embrapa Agroenergia. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2017. (Embrapa Agroenergia. Documentos, 28).| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 84. | | GREGORINE, L. F.; MONCLARO, A. V.; SILVA, C. de O. G.; RODRIGUES, K. B.; PEIXOTO, J. S. G.; ABDELNUR, P. V.; FAVARO, L. C. de L. Heterologous expression of a new lytic polysaccharide monooxygenase from Hahella ganghwensis and their functional characterization. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 22.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA, 13., 2019, Uberlandia, MG. [Anais ...]. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 85. | | CAMPOS, C. G.; VERAS, H. C. T.; RIBEIRO, J. A. de A.; COSTA, P. P. K. G.; RODRIGUES, C. M.; ALMEIDA, J. R. M. de; ABDELNUR, P. V. Preparo de amostra em metabolômica de leveduras para a determinação dos metabólitos produzidos na fermentação de xilose. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 81-83| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 88. | | COLLETES, T. C.; GARCIA, P. T.; CAMPANHA, R. B.; ABDELNUR, P. V.; ROMÃO, W.; COLTRO, W. K. T.; VAZ, B. G. A new insert sample approach to paper spray mass spectrometry: a paper substrate with paraffin barriers. Analyst, v. 141, p. 1707?171, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 89. | | SILVA, C. de O. G.; TEIXEIRA, T. S.; RIBEIRO, J. A. de A.; RODRIGUES, K. B.; ANASTÁCIO, G. S.; SOUZA, A. A.; MENDES, T. D.; SALUM, T. F. C.; FAVARO, L. C. de L.; ABDELNUR, P. V. avaliação da atividade da LPMO Cel61A de trichoderma reesei sobre celulose por espectrometria de massas. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 25.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 90. | | SOUTO, A. L.; ARAÚJO, K. P. de; SILVA, R. M. C. da; POLETTO, C. M.; RIBEIRO, J. A. de A.; DAMASO, M. C. T.; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Aplicação da análise multivariada de dados de Espectrometria de Massas em amostras de glicerol biotransformadas por fungos filamentosos In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUÍMICA, 55., 2015, Goiânia. Recursos renováveis: inovação e tecnologia. Rio de Janeiro: ABQ, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 91. | | CAMPOS, C. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; COSTA, P. P. K. G.; PEREIRA, K. A.; VERAS, H. C.; ALMEIDA, J. R. M. de; RODRIGUES, C. M.; ABDELNUR, P. V. Análise quantitativa dos metabólitos produzidos por levedura na via de fermentação da xilose utilizando UHPLC-MS/MS. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 39., 2016, Goiânia, GO. Criar e empreender: anais ... São Paulo: SBQ, 2016. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 92. | | SILVA, C. de O. G.; TEIXEIRA, S. T.; RODRIGUES, K. B.; SOUZA, A. A.; MONCLARO, A. V.; MENDES, T. D.; RIBEIRO, J. A. de A.; SIQUEIRA, F. G. de; FAVARO, L. C. de L.; ABDELNUR, P. V. Combination of MALDI-TOF MS and UHPLC-ESI-MS for the characterization of lytic polysaccharide monooxygenase activity. Analytical Methods, n. 2, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 93. | | VIEIRA, V. de O.; CONCEIÇÃO, A. A.; SILVA, C. de O. G.; ROMERO-PELAEZ, R. D.; LOBO JUNIOR, M.; ABDELNUR, P. V.; ALMEIDA, J. R. M. de; ALMEIDA, E. G.; SIQUEIRA, F. G. de. Characterization of extracellular secondary metabolites in Oudemansiella canarii BRM-044600 displaying antifungal activity against the phytopathogen Sclerotinia sclerotiorum. World Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 37, 203, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 94. | | BRAGA, Í. de O.; SILVA, T. L. C. da; SILVA, V. N. B.; RODRIGUES NETO, J. C.; RIBEIRO, J. A. de A.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Deep untargeted metabolomics analysis to further characterize the adaptation response of Gliricidia sepium (Jacq.) Walp. to very high salinity stress. Frontiers in Plant Science, v. 13, Art. 869105, May, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 95. | | NETO, J. C. R.; RICCI-SILVA, M. E.; SANTOS, C. F. dos; COSTA, P. P. K. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Desenvolvimento de protocolo analítico para identificação de proteínas em frutos de dendê utilizando MALDI(+)-TOF-MS In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUÍMICA, 55., 2015, Goiânia. Recursos renováveis: inovação e tecnologia. Rio de Janeiro: ABQ, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 96. | | TEIXEIRA, T. S.; RODRIGUES NETO, J. C.; MARTINS, P. A.; SILVA, E. A. da; COSTA, P. P. K. G.; SALUM, T. F. C.; SIQUEIRA, F. G. de; ABDELNUR, P. V. Desenvolvimento de protocolo para imagem química por espectrometria de massas de metabólitos-microrganismos. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 46.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 97. | | BAHIA, F. M.; ALMEIDA, G. C. de; ANDRADE, L. P. de; CAMPOS, C. G.; QUEIROZ, L. R.; SILVA, L. R. V. da; ABDELNUR, P. V.; CORRÊA, J. R.; BETTIGA, M.; PARACHIN, N. S. Rhamnolipids production from sucrose by engineered Saccharomyces cerevisiae. Scientific Reports, v. 8, artigo 2905, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 98. | | SILVA, C. de O. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; SOUTO, A. L.; ABDELNUR, P. V.; BATISTA, L. B.; RODRIGUES, K. A.; PARACHIN, N. S.; FERREIRA FILHO, E. X. Sugarcane bagasse hydrothermal pretreatment liquors as suitable carbon sources for hemicellulase production by Aspergillus niger. BioEnergy Research, v. 11, n. 2, p. 316-329, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 100. | | CARNEIRO, A. A. J.; SOUTO, A. L.; SOUSA, G. P.; MENDES, T. D.; FAVARO, L. C. de L.; SALUM, T. F. C.; ABDELNUR, P. V.; RODRIGUES, C. M.; DAMASO, M. C. T. Evaluation of fungal strains for bioconversion of crude glycerin from palm oil and soybean into polyols. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 21.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA, 12., 2017, Aracajú, SE. [Anais ...]. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2017. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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